lncRNA在肢端黑素瘤中的功能和作用機制研究

《lncRNA在肢端黑素瘤中的功能和作用機制研究》是依託中國人民解放軍第四軍醫大學，由馬晶晶擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：lncRNA在肢端黑素瘤中的功能和作用機制研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：馬晶晶
• 依託單位：中國人民解放軍第四軍醫大學

項目摘要

肢端黑素瘤是我國人群好發的皮膚惡性腫瘤。基因變異引起癌基因或抑癌基因的異常表達參與肢端黑素瘤的發生。lncRNA是新發現的具有基因調控功能的非編碼RNA，它通過與核酸或蛋白分子相互作用在基因表達的不同水平發揮功能。lncRNA的異常表達與乳腺癌、結腸癌和非肢端黑素瘤的發病密切相關。然而，lncRNA在肢端黑素瘤中的功能和作用機制尚不清楚。根據本研究組已有的肢端黑素瘤外顯子測序的結果，我們已篩選出外顯子發生點突變或插入缺失突變的ncRNA，說明這些異常的ncRNA可能參與肢端黑素瘤的發生。為了進一步找到肢端黑素瘤特異性lncRNA， 本研究擬採用lncRNA和mRNA表達譜晶片及RNA測序技術建立肢端黑素瘤特異性lncRNA表達譜並進行大樣本驗證，評價目標lncRNA在肢端黑素瘤中的生物學功能，然後通過生物信息學和體外實驗相結合進一步發現其可能的作用機制，有望為肢端黑素瘤的治療提供新思路。

結題摘要

黑素瘤是致死性最強的皮膚腫瘤，其中肢端黑素瘤是我國人群好發的皮膚腫瘤類型，目前，黑素瘤的發病機制尚未完全闡明。長鏈非編碼RNA（lncRNAs）是一類具有基因調控功能的非編碼RNA，已有研究表明lncRNAs的異常表達參與腫瘤的發生髮展。然而，lncRNAs在肢端黑素瘤中的功能和作用機制尚不清楚。本研究採用lncRNA和mRNA表達譜晶片篩選在肢端黑素瘤和色素痣組織中差異表達的lncRNAs和mRNAs；對它們進行一系列生物信息學分析，包括差異mRNAs的KEGG和GO分析、構建lncRNAs-mRNAs共表達網路、lncRNAs靶基因和轉錄因子預測等；對差異lncRNAs的表達水平及lncRNAs-mRNAs對的表達水平用定量PCR的方法在組織和細胞中進行驗證；根據驗證結果，我們在黑素瘤細胞中對所選lncRNAs和mRANs的腫瘤相關的生物學功能和相應的機制進行研究。結果顯示， 在肢端黑素瘤和色素痣組織中顯著差異表達的lncRNAs共有1646個，主要為基因間lncRNAs和反義lncRNAs，1號、2號染色體分布的差異LncRNA最多；生物信息學分析結果顯示差異表達的lncRNAs和mRNAs所參與的信號通路以Hippo信號途徑、多能幹細胞調節途徑、賴氨酸降解、抗原提呈和加工、細胞因子及受體相互作用、NK細胞介導的細胞毒性、吞噬體、癌症途徑、B細胞受體信號途徑最顯著，參與的生物過程以天然免疫和適應性免疫反應、免疫效應過程、免疫激活、免疫反應激活的細胞表面受體信號途徑、白細胞和淋巴細胞介導的免疫反應及免疫系統的調節、I型干擾素信號和細胞粘附最顯著；用定量RT-PCR的方法對所選的表達差異最顯著的8個lncRNA進行驗證，結果顯示有7個與晶片的檢測結果一致；同時，對有共表達關係的lncRNAs-mRNAs的表達水平在組織和細胞系中進行驗證，結果與晶片中的表達趨勢一致；體外功能研究發現lncRNA CD27-AS可能通過調節CD27的表達促進黑素瘤的發生髮展，另外還發現HMHA1蛋白在黑素瘤發生髮展中的促癌作用。綜上，本項目的研究表明lncRNAs是黑素瘤治療的一個潛在的靶點。