RERT-lncRNA調控EGLN2在肝細胞肝癌發生中的作用機制研究

《RERT-lncRNA調控EGLN2在肝細胞肝癌發生中的作用機制研究》是依託蘇州大學，由何艷擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

• 中文名：RERT-lncRNA調控EGLN2在肝細胞肝癌發生中的作用機制研究
• 項目類別：青年科學基金項目
• 項目負責人：何艷
• 依託單位：蘇州大學

項目摘要

長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在基因組中廣泛表達並以RNA的形式在多種層面調控基因表達。已有研究表明lncRNAs的異常表達與腫瘤的發生髮展密切相關。我們近期的研究發現：位於prolyl羥化酶（EGLN2）遠端啟動子的一個遺傳多態(rs10680577)與肝細胞肝癌（HCC）的發生、預後及EGLN2表達存在顯著性相關，而這種相關不是該多態影響EGLN2啟動子的轉錄而調控其表達。我們注意到EGLN2及其上游基因間存在一個通讀長鏈非編碼RNA（RERT-lncRNA），我們推測該多態可能通過影響長鏈非編碼RNA的表達從而實現對其下游基因EGLN2的調控，進而參與HCC的發生和預後。本課題擬採用基因型-表型關聯結合功能實驗方法研究遺傳多態、RERT-lncRNA和EGLN2三者間的依存關係及其對腫瘤細胞特徵的影響，以期闡明遺傳因素-lncRNA-EGLN2通路在HCC發生髮展中的作用機制。

結題摘要

長鏈非編碼RNAs（lncRNAs）在基因組中廣泛表達並以RNA的形式在多種層面調控基因表達。研究表明lncRNAs的異常表達與腫瘤的發生髮展密切相關。本課題經過大樣本多中心病例對照結合後續功能實驗研究發現中國人群中長鏈非編碼RNA（RERT-lncRNA）中的一個四鹼基（TTCA）插入缺失多態（rs10680577）與肝細胞肝癌（HCC）易感性存在顯著關聯，攜帶四鹼基缺失基因型的個體患HCC的風險明顯增加，而這種關聯在經常吸菸患者中更為明顯；rs10680577多態與RERT-lncRNA和prolyl羥化酶（EGLN2）的表達量均存在顯著的基因型-表型關聯，攜帶缺失基因型的組織和細胞較插入型，RERT-lncRNA和EGLN2的表達量均有明顯的增加； RERT-lncRNA和EGLN2二者的表達量也存在顯著線性相關，RERT-lncRNA的過表達能顯著提高EGLN2的表達；同時結合生物信息學預測，rs10680577多態可能通過影響RERT-lncRNA的空間構象，影響RERT-lncRNA的表達，從而實現對其下游基因EGLN2表達的調控，進而參與HCC的發生。此外，課題組利用本項目剩餘資金探討了另外兩個多態 rs35622507,rs199618935（分別位於KCNQ1OT1和PTPN11基因）與HCC易感性的關聯性分析，結果顯示這兩個多態均與HCC發生存在顯著關聯，為HCC的早期診斷及預防提供了新的候選遺傳標記。