《結直腸癌預後相關基因的功能及表達調控機制的研究》是依託浙江大學，由鄭樹擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：結直腸癌預後相關基因的功能及表達調控機制的研究
- 依託單位：浙江大學
- 項目負責人：鄭樹
- 項目類別：面上項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
本課題基於已有工作基礎，採用Affymetrix基因晶片對不同預後的Dukes'B、C期結直腸癌腫瘤組織進行了全基因組表達譜分析，獲得了198個差異基因，通過對差異基因的生物信息學功能分析及權重排列，篩選出能最好區分不同預後組的15個基因。在該課題中我們將擴大臨床樣本使用Tissue Array對候選基因進行驗證，找出結直腸癌的預後相關基因，並通過細胞及動物水平的功能實驗證實預後相關靶基因對腫瘤細胞增殖、侵襲的影響。為了進一步闡明以上實驗獲得的靶基因的表達調控機制，我們將從基因組各個水平包括SNP、CNV、甲基化修飾和MicroRNA的調控對其進行研究。因而，本研究首先基於全基因組表達譜分析獲得後續研究的候選基因，並通過對靶基因進行功能及表達調控機制的研究，為中國人臨床結直腸癌的預後評價提供有效的標誌物，並為腫瘤的干預、治療提供候選靶點。
結題摘要
本研究對結直腸癌患者腫瘤組織進行全基因組表達譜晶片掃描，多種生物信息學分析尋找預後和肝轉移相關基因。構建了大腸癌組織蠟塊的組織晶片，完善臨床病理資料及隨訪資料庫。尋找到預後相關基因ANKRD12, RT-PCR驗證發現ANKRD12在癌旁組織中表達明顯高於癌組織中的表達，肝轉移原發灶中表達明顯低於非肝轉移原發灶中表達；轉入ANKRD12 C端功能域的細胞生長未受明顯影響，但轉移能力受到抑制；正常結直腸黏膜組織和細胞系sw620、rko的cnv基因拷貝數分布和甲基化位點未見明顯差異。尋找到與肝轉移和預後相關靶基因NKTR，qRT-PCR和免疫組化證實NKTR在肝轉移的原發灶中表達較無肝轉移的原發灶明顯降低，細胞功能實驗提示敲除NKTR可以促進腫瘤生長和轉移。尋找到腫瘤幹細胞相關靶基因NANOG，該基因在結腸癌細胞系中的表達均高於正常腸黏膜上皮，而在克隆球中的表達又遠遠高於其原始細胞系的表達，敲除NANOG可以抑制腫瘤的生長。通過對結直腸癌腫瘤代謝物和表達譜晶片數據分析，發現了不同分期腫瘤相關的代謝物質：天冬氨酸、β-丙氨酸、谷氨酸、L-半胱氨酸、5-氧代脯氨酸、同型半胱氨酸。
