《結直腸癌中抑癌基因DCP4的ceRNA鑑定及分子機制探討》是依託北京大學,由王早早擔任負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:結直腸癌中抑癌基因DCP4的ceRNA鑑定及分子機制探討
- 項目負責人:王早早
- 依託單位:北京大學
- 項目類別:青年科學基金項目
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
抑癌基因DCP4表達下調在結直腸癌發生中起關鍵作用,轉錄後異常表達的miRNAs是導致DCP4功能失活的重要原因之一。近期研究報導,競爭性內源RNA(ceRNA)可通過競爭性結合靶基因的部分miRNAs從而調控靶基因的表達。前期工作中我們通過生物信息學預測及資料庫分析篩選出4個DCP4的候選ceRNAs,並初步實驗證實VAMP24可作為ceRNA調控DCP4的表達。本項目將在此基礎上進一步鑑定其餘可調控DCP4的候選ceRNAs;通過螢光素酶報告基因實驗、構建Dicer穩定干擾的結腸癌細胞系等技術,明確ceRNAs通過miRNAs調節DCP4的分機制及其對DCP4功能和下游信號通路的影響;並在結直腸癌組織中檢測ceRNAs與DCP4表達及臨床資料的相關性,以期闡明ceRNAs以miRNAs為橋樑調節DCP4的表觀遺傳學調控機制,為結直腸癌的防治提供新思路。
結題摘要
本項目圍繞“調控結直腸癌抑癌基因DCP4的ceRNA鑑定及其分子機制”開展了一系列研究工作。首先,我們通過生物信息學分析、篩選及實驗驗證,明確了USP3與DCP4之間的相互調控作用,以及二者間依賴於miRNA互為ceRNA的調控機制;其次,找到同時調控DCP4與USP3的miRNA——miR-224,並驗證miR-224對DCP4和USP3的直接調控作用,說明其在ceRNA調控中所起的作用;此外,明確了USP3通過ceRNA方式調控DCP4影響結直腸癌細胞的侵襲轉移;最後,臨床結直腸癌組織樣本檢測分析結果提示,USP3和DCP4在腫瘤組織呈低表達,而miR-224則與之相反,在腫瘤組織呈高表達,三者具有顯著相關性,且USP3表達水平降低提示病人預後不良。在課題進展過程中,我們對篩選到的DCP4的ceRNA分別進行了驗證,並發現, USP3優於VAMP24、SMAD5和SP4,其對DCP4的調控作用更為明顯,二者可通過miR-224實現ceRNA之間的相互調控作用,並進一步影響腫瘤細胞的侵襲轉移。故我們對課題計畫進行了必要的調整,以期得到更好的產出。此外,根據上述研究結果,我們套用lncRNA晶片、表達譜晶片和CGH晶片進行聯合篩選,對結直腸癌腫瘤組織中與DCP4表達高度相關的lncRNA展開進一步研究工作,上述工作已獲得北京市自然科學基金資助。綜上,本項目明確了USP3作為ceRNA通過miR-224調控DCP4的分子機制。同時闡明了USP3對結腸癌細胞侵襲轉移的抑制作用。課題從表觀遺傳學水平揭示了在結直腸癌發生過程中抑癌基因DCP4功能失活的另一可能分子機制,即通過USP3-miR224-DCP4之間的調控實現,上述研究國內外尚無相關報導,為結直腸癌的防治提供新的干預靶點,有一定的潛在套用價值。