拷貝數變異檢測是一種通過對特定基因或全基因組掃描發現基因組中大片段DNA序列的變異的檢測方法。拷貝數變異包括染色體水平的缺失、倒位、易位、插入、重複等基因組結構的變化。
基本介紹
- 中文名:拷貝數變異檢測
- 檢測方法:基於聚合酶鏈反應法等
- 包括:染色體水平的缺失、倒位、易位、插入、重複等基因組結構的變化
拷貝數變異檢測是一種通過對特定基因或全基因組掃描發現基因組中大片段DNA序列的變異的檢測方法。拷貝數變異包括染色體水平的缺失、倒位、易位、插入、重複等基因組結構的變化。
拷貝數變異檢測是一種通過對特定基因或全基因組掃描發現基因組中大片段DNA序列的變異的檢測方法。拷貝數變異包括染色體水平的缺失、倒位、易位、插入、重複等基因組結構的變化。拷貝數變異檢測方法1.基於聚合酶鏈反應的方法包括定時...
拷貝數變異(Copy number variation, CNV)是由基因組發生重排而導致的, 一般指長度為1 kb 以上的基因。概念 拷貝數變異(Copy number variation, CNV)是由基因組發生重排而導致的, 一般指長度為1 kb 以上的基因 組大片段的拷貝數增加...
拷貝數目變異(拷貝數變異,CNV)也稱拷貝數目多態(拷貝數多態性,CNP),是一種大小介於1 KB至3 MB的DNA片段的變異,在人類基因組中廣泛分布其覆蓋的核苷酸總數大大超過單核苷酸多態性(單核苷酸多態性,SNP)位點的總數,並就CNV在...
《中國漢族人群冠心病相關拷貝數變異的鑑定》是依託上海交通大學,由金瑋擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 尋找冠心病致病基因是全球的熱點和難點,拷貝數變異(copy number variation, CNV)是最新發現的人類基因組變異形式並參與複雜性...
《中國漢族高血壓定位區域基因拷貝數變異的識別研究》是依託上海交通大學,由張怡擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 拷貝數變異(Copy number variation,CNV)是基因的重要遺傳變異之一,現已被發現在人體內頻繁存在且與複雜性狀和疾病發生...
鑑定和發現癌症樣本中非隨機的體細胞拷貝數變異(SCNA),是查找癌症基因的重要手段,其核心問題是如何利用拷貝數的結構性變異發現甚至可能是弱顯著的SCNA功能模式。現有檢測方法大多基於單個SCNA位點和靜態零分布的統計檢驗模型,對弱顯著的...
此外,在成對SNP array數據的建模研究中,利用正常組織基因型等信息對GPHMM的建模方式進行改進,有效提高了對拷貝數異常檢測的魯棒性,並在此基礎上發展對腫瘤基因組復發變異的統計顯著性分析方法,通過對乳腺癌、肝癌的數據分析,發現了...
拷貝數變異(Copy number variation, CNV)是由基因組發生重排而導致的, 一般指長度為1 kb 以上的基因組大片段的拷貝數增加或者減少, 主要表現為亞顯微水平的缺失和重複。定義 (一)在細菌細胞中,某種特定質粒的數目。根據複製特性,質粒...
《探尋與高功能孤獨症和Asperger綜合徵相關的拷貝數變異》是依託復旦大學,由公曉紅擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 孤獨症譜系障礙(Autism Spectrum Disorder,ASD),是以孤獨症為代表的一組異質性的發育行為障礙性疾病,由於...
變異是導致疾病的一個重要潛在因素,檢測變異發生的位置是疾病易感基因定位中的一項重要任務。常見的變異有基因拷貝數變異,單核苷酸多態性,DNA結構變異等。本項目發展了針對不同場合的系列檢測各種變異的統計學方法:(1)基於核心家系中...
《基因拷貝數變異在自身免疫性甲狀腺疾病發病中的作用》是依託復旦大學,由張進安擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 遺傳因素對自身免疫性甲狀腺疾病(AITD)易感性的貢獻達80%。我們及國內外前期研究發現CTLA4、Tg等基因的單核苷酸多態性...
鑑定的CNV有望成為肥胖的標誌性位點,為下一步臨床早期檢測、預防以及尋找干預靶點提供理論依據。結題摘要 本項目以肥胖為研究表型,致力於研究拷貝數變異這一新遺傳多態性標記,採用前沿的全基因組關聯分析為研究手段,旨在尋找出肥胖症的...
本項目組基於以往在腫瘤和mtDNA方面的研究基礎和豐富經驗,擬以mtDNA拷貝數顯著升高的大腸癌及顯著降低的肝癌作為代表性研究對象,基於臨床標本及細胞模型,利用實時定量PCR方法檢測mtDNA拷貝數,套用第二代高通量測序技術評估mtDNA的序列變異,...
科學意義:已知致病基因分子遺傳學篩查提示這四個家系致病基因為非已知致病基因,可能為新基因突變或多基因協同致病。散發病例的研究為耳聾基因檢測突變分布特徵及耳聾基因的篩查提供了新的科學的參考依據。DIAPH1基因拷貝數變異的致聾機制的...
《線粒體拷貝數變異在常見線粒體病表型差異中的作用》是依託北京大學,由馬禕楠擔任負責人的面上項目。項目摘要 線粒體病是一組由於遺傳缺陷引起線粒體ATP合成障礙而導致的一組複雜的異質性疾病,基因型與臨床表型的關係複雜。近來認為 ...
《先天性心臟病伴肢體畸形拷貝數變異及其致病機理研究》是依託中南大學,由羅成擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 先天性心臟病是最常見的出生缺陷,也可作為遺傳綜合徵的組成部分,約25%的患者合併其他系統缺陷。其中,肢體畸形是...
在自閉症研究領域中,點突變(point mutation)和拷貝數變異(copy number variant, CNV)是相關病變遺傳特徵研究的重中之重。然而僅僅對單個基因的研究並不能回答大多數自閉症發病的遺傳因素。隨著近年來遺傳學檢測技術的更新和發展,越來...
《非綜合徵型唇齶裂易感基因編碼和拷貝數變異的研究》是依託武漢大學,由邊專擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 唇齶裂是人類最常見的顱頜面出生缺陷,是一組在環境因素和遺傳因素相互作用下發生的複雜疾病,非綜合徵型唇齶裂(NSCL/P...
mtDNA拷貝數目突變是mtDNA拷貝數大大低於正常,這種突變較少,僅見於一些致死性嬰兒呼吸障礙,乳酸中毒或肝, 腎衰竭的病例。 此外,mtDNA病變還具有相應的組織特異性。不同組織對氧化磷酸化的依賴性差異是線粒體病組織特異性的基礎。有人...
拷貝數變異是基因結構化變異的主要組成部分。由於拷貝數的變化與疾病、性狀等存在著密切的關聯性,所以拷貝數的檢測一直是生物學領域研究的熱點。尤其近年來全基因組測序、單細胞測序等新技術給檢測拷貝數帶來的不確定性更是促進了統計技術...
MLPA結合了DNA探針雜交和PCR技術,具有以下優點1、高效:一次反應可以檢測45個靶序列拷貝數的改變。2、特異:可以檢測點突變。3、快速:一次實驗可以在24小時內完成。4、簡便:不同的試劑盒操作基本相同,容易掌握。MLPA雖然具有很大優點,...
比較基因組雜交是將消減雜交、螢光原位雜交相結合,用於檢測DNA序列的拷貝數變異並將其定位在染色體上的方法。比較基因組雜交 英文名稱:comparative genome hybridization;CGH CGH 只能檢測不平衡的染色體改變。結構染色體變異,例如:平衡的...
定量PCR是依靠標準曲線或參照基因來測定核酸量,而數字PCR則讓你能夠直接數出DNA分子的個數,是對起始樣品的絕對定量。因此特別適用於依靠Ct值不能很好分辨的套用領域:拷貝數變異、突變檢測、基因相對表達研究(如等位基因不平衡表達)、...
本項目主要研究成果如下:(1)自主研發了兩種22q11.2拷貝數變異檢測系統,為本項目靶向測序進行樣本篩選提供可行的方法。(2)套用新建立的CHD候選及已知致病基因外顯子組捕獲系統,對300例22q11.2微缺失篩查結果陰性的心臟圓錐動脈乾(...
150萬。主要功能 微滴式數字PCR系統主要套用於分子生物學領域,包括病原微生物檢測,病原微生物分型鑑定,稀有變異檢測、拷貝數變異、珍貴樣品檢測、與二代測序整合、基因表達量差異研究、點突變(SNP)研究和甲基化含量鑑定等。
全基因組重測序的個體,通過序列比對,可以找到大量的單核苷酸多態性位點(SNP),插入缺失位點(InDel,Insertion/Deletion)、結構變異位點(SV,Structure Variation)和拷貝數變異位點(CNV,copy number variation)。SBC可以協助客戶,通過...