《中國漢族人群冠心病相關拷貝數變異的鑑定》是依託上海交通大學，由金瑋擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：中國漢族人群冠心病相關拷貝數變異的鑑定
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：金瑋
- 依託單位：上海交通大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
尋找冠心病致病基因是全球的熱點和難點，拷貝數變異（copy number variation, CNV）是最新發現的人類基因組變異形式並參與複雜性疾病進程。本課題立足中國漢族人群,(1)套用生物信息學方法並結合最新CNV圖譜和基因組圖譜，識別冠心病定位區域內CNV、SNP及涉及基因；(2)套用全基因組晶片平台在小樣本冠心病患者中初篩驗證比對，構建中國漢族人群冠心病候選CNV條目；(3)從功能候選的角度，先期挑選10個CNV，在首輪1000例冠心病和冠脈正常對照人群中，經定量PCR體系開展關聯研究，評估候選CNV對冠心病臨床表型及中間表型的風險；(4)套用寡核苷酸晶片平台，對有統計學意義的CNV檢測其定位區域內單體型標籤SNP的等位基因拷貝數。研究將可能識別冠心病相關基因及CNV，為冠心病的發病機制、風險預測和診斷治療提供理論依據，為多基因疾病研究探索新思路。
結題摘要
冠心病是一種發病率、患病率和死亡率極高的多基因疾病，由遺傳因素和環境因素互動作用而發病，尋找冠心病的致病基因是全球的熱點和難點。本項目以中國華東地區漢族為研究對象，通過構建大樣本的冠心病及冠脈正常對照人群的表型庫、中間表型庫和基因組DNA庫，套用生物信息學方法並結合最新CNV圖譜和基因組圖譜，以第四代遺傳標記－拷貝數變異（CNVs）結合第三代遺傳標記－單核苷酸多態（SNPs）為研究手段，關注冠心病全基因組關聯研究中有統計學意義的基因定位區域，從脂蛋白加工、內皮完整性、血管免疫炎症和血栓形成四大通路為切入點，通過功能候選，仔細識別該些區域內CNVs、SNPs及涉及基因，重點對LPA，MEF2A，Apelin/APJ,LTA，IL6等基因開展病例-對照關聯研究，評估候選CNVs，SNPs及其單倍型對冠心病臨床表型及中間表型的風險。研究獲得了一系列中國人群特有的冠心病遺傳標記，為冠心病的發病機制、風險預測和診斷治療提供理論依據，為多基因疾病研究探索新思路。
