《乙醯轉移酶、去乙醯化酶特異的賴氨酸乙醯化位點識別》是李婷婷為項目負責人，北京大學為依託單位的面上項目。
基本介紹
- 中文名：乙醯轉移酶、去乙醯化酶特異的賴氨酸乙醯化位點識別
- 項目類別 ：面上項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：李婷婷
科研成果 ,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 | 作者 |
|---|---|---|---|
1 | Computational prediction of associations between long non-coding RNAs and proteins | 期刊論文 | Lu, Qiongshi(#)，Ren, Sijin，Lu, Ming，Zhang, Yong，Zhu, Dahai，Zhang, Xuegong，Li, Tingting(*) |
2 | Prediction of Protein Lysine Acylation by Integrating Primary Sequence Information with Multiple Functional Features | 期刊論文 | Du, Yipeng(#)，Zhai, Zichao，Li, Ying，Lu, Ming，Cai, Tanxi，Zhou, Bo，Huang, Lei，Wei, Taotao(*)，Li, Tingting(*) |
3 | Systematic Characterization and Prediction of Post-Translational Modification Cross-Talk | 期刊論文 | Huang, Yuanhua，Xu, Bosen，Zhou, Xueya，Li, Ying，Lu, Ming，Jiang, Rui，Li, Tingting(*) |
4 | Quantitative proteome-based systematic identification of SIRT7 substrates | 期刊論文 | Zhang, Chaohua，Zhai, Zichao，Tang, Ming，Cheng, Zhongyi，Li, Tingting(*)，Wang, Haiying(*)，Zhu, Wei-Guo(*) |
5 | 中國在翻譯後修飾的生物信息學研究領域的進展與前瞻 | 期刊論文 | 劉澤先(#)，蔡煜東，郭雪江，李驁，李婷婷，邱建丁，任間，施紹萍，宋江寧，王明會，謝鷺，薛宇，張子丁，趙興明 |
6 | Identifying Human SIRT1 Substrates by Integrating Heterogeneous Information from Various Sources | 期刊論文 | Zhai, Zichao(#)，Tang, Ming，Yang, Yue，Lu, Ming，Zhu, Wei-Guo(*)，Li, Tingting(*) |
7 | Co-occurring protein phosphorylation are functionally associated | 期刊論文 | Li, Ying(#)，Zhou, Xueya，Zhai, Zichao，Li, Tingting(*) |
8 | Prediction of substrate sites for protein phosphatases 1B, SHP-1, and SHP-2 based on sequence features | 期刊論文 | Wu, Zheng(#)，Lu, Ming，Li, Tingting(*) |
項目摘要
蛋白質賴氨酸殘基乙醯化是一種普遍存在的可逆性翻譯後修飾, 乙醯轉移酶和去乙醯化酶共同作用使其處於動態平衡, 在基因表達等生物過程中發揮著重要作用。乙醯化位點預測是生物信息學研究中的熱點問題，但以往的方法卻沒有考慮酶的特異性。在前期研究中，我們針對乙醯轉移酶CBP/p300和PCAF/ GCN5成功建立了第一個酶特異的乙醯化位點預測算法，不但預測乙醯化發生與否，同時也能鎖定起作用的乙醯轉移酶,本項目計畫把工作繼續擴展到去乙醯化酶識別位點預測這一基本處於空白的領域。我們將收集實驗驗證的乙醯轉移酶、去乙醯化酶識別位點數據，分析各個酶催化序列的特徵，在此基礎上建立系統的乙醯轉移酶、去乙醯化酶特異識別位點預測平台。除序列信息外，我們也將融合蛋白質二級結構、蛋白-蛋白相互作用等信息，提高乙醯轉移酶和去乙醯化酶識別位點預測方法的性能。希望通過本項目，為相關領域的生物學研究提供有效的預測和實驗設計工具。
