《組蛋白共價修飾的生物信息學研究》是依託華中科技大學,由薛宇擔任項目負責人的重大研究計畫。
基本介紹
- 中文名:組蛋白共價修飾的生物信息學研究
- 項目類別:重大研究計畫
- 項目負責人:薛宇
- 依託單位:華中科技大學
- 批准號:90919001
- 申請代碼:C0601
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費:60(萬元)
中文摘要
組蛋白的共價修飾是表觀遺傳現象中重要的分子調控機制。組蛋白中被修飾胺基酸的種類、位置和修飾類型稱為組蛋白密碼,其中最主要的兩種共價修飾為組蛋白的乙醯化和甲基化。一個廣受關注的問題是:由甲基化和乙醯化修飾構成的組蛋白密碼,究竟具有怎樣的特異性?我們將在本項目的支持下,採用生物信息學與實驗學的方法,將乾法與濕法有機的結合,使用改進版本的GPS算法預測蛋白質的乙醯化和甲基化位點,並進一步發展酶特異性的乙醯化和甲基化位點的預測。我們擬結合蛋白質-蛋白質相互作用的信息,發展蛋白質組層面系統預測乙醯化和甲基化修飾底物及其位點的新方法。最後,在理論計算的指導下,我們將以實驗學方法鑑定人類MYST亞家族的組蛋白乙醯基轉移酶Tip60無修飾狀態與SUMO化修飾狀態下,組蛋白乙醯化的修飾位點。該研究將為深入理解DNA損傷修復通路中的組蛋白密碼可塑性的分子機制奠定基礎。