蛋白質功能位點預測方法的研究

蛋白質功能位點預測方法的研究

《蛋白質功能位點預測方法的研究》是依託北京工業大學,由李春華擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:蛋白質功能位點預測方法的研究
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:李春華
  • 依託單位:北京工業大學
  • 批准號:20773006
  • 申請代碼:B0301
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2008-01-01 至 2010-12-31
  • 支持經費:26(萬元)
項目摘要
能夠在基因組規模上預測蛋白質功能已成為生命科學領域的研究熱點,而關於蛋白質功能位點(結合位點或活性位點)的預測則是其中最基礎和最重要的問題之一。本項目在對蛋白質按功能進行分類的基礎上,用複雜網路方法研究蛋白質結合界面保守殘基的聚集性、模組化性質及殘基間相互作用的協同性,用高斯網路模型分析蛋白質的動力學性質,從而提出新的蛋白質類型特異的識別功能位點的網路拓撲、物理化學及動力學特徵參量,進而建立基於支持向量機的功能位點預測新方法。另外,構建蛋白質功能位點庫,採用關聯規則對功能位點區域進行數據挖掘,建立功能位點模式庫和預測的知識推理新方法。最後在這兩方面工作的基於上,建立複雜網路、高斯網路、支持向量機與知識推理方法相結合的蛋白質功能位點預測系統。該項目的實施不但有助於闡明分子識別機理、重大疾病的分子根源,而且必將帶動相關套用研究,包括複合物結構預測、蛋白質工程和藥物分子設計等的重大進展。

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