《基於結構的蛋白質相互作用能量熱點預測技術研究》是依託同濟大學，由關佶紅擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：基於結構的蛋白質相互作用能量熱點預測技術研究
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：關佶紅
- 依託單位：同濟大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
蛋白質相互作用能量熱點(Hot Spots)是蛋白質相互作用界面上貢獻絕大部分結合自由能的少數關鍵殘基，在蛋白質結合的穩定性方面發揮著重要作用。有效識別能量熱點對於蛋白質設計和藥物開發具有非常重要的意義。大規模生物實驗測定能量熱點代價昂貴，使用計算方法預測可以彌補這一不足。本課題將在前期蛋白質相互作用及功能位點預測研究的基礎上，結合生物學、數學、物理學等方法和計算機技術，探索蛋白質能量熱點預測的新方法、新算法和軟體工具。研究內容包括：（1）建立基於結構比對的機率預測方法；（2）用複雜網路方法研究胺基酸網路的拓撲結構及聚集性、模組化等性質，提出新的能量熱點預測方法；（3）研究蛋白質能量熱點集成預測方法；（4）開發蛋白質能量熱點綜合預測平台和建立集成的能量熱點資料庫，為蛋白質功能和藥物設計提供技術和數據支持。
結題摘要
蛋白質相互作用能量熱點(Hot Spots)是蛋白質相互作用界面上貢獻絕大部分結合自由能的少數關鍵殘基，在蛋白質結合的穩定性方面發揮著重要作用。有效識別能量熱點有助於更好地了解蛋白質相互作用機理。傳統的生物實驗檢測能量熱點耗時耗力，本課題深入研究並提出了一系列計算的方法預測蛋白質相互作用能量熱點，主要創新成果包括：（1）基於結構鄰居特徵的能量熱點預測方法；（2）基於半監督的能量熱點預測方法；（3）基於遞歸特徵消除法的能量熱點預測方法；（4）開發了蛋白質能量熱點預測平台，為蛋白質功能和藥物設計提供技術和數據支持；（5）其他相關研究內容的預測模型和一系列新方法。課題資助發表論文共40篇，另外已錄用論文2篇。
