《磷酸化修飾介導的蛋白質相互作用研究》是依託四川大學，由郭延芝擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：磷酸化修飾介導的蛋白質相互作用研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：郭延芝
- 依託單位：四川大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
磷酸化是最重要的蛋白質翻譯後修飾之一，它與信號轉導、細胞周期、生長發育以及癌症機理等諸多生物學問題有密切關係。在磷酸化修飾調節的細胞信號通路中，蛋白激酶、底物(磷酸化蛋白)及磷酸化蛋白結合結構域(phosphoprotein-binding domain, PPBD)發揮了十分重要的作用。因此針對這三類蛋白質，本項目擬開展以下三個方面的研究:(一)、探索磷酸化修飾規律，利用信號處理與機器學習方法構建激酶特異性的磷酸化位點預測模型；(二)、建立激酶-底物-PPBD蛋白的相互作用預測模型，探討磷酸化修飾介導的蛋白質相互作用機理；(三)、通過分析激酶-底物-PPBD蛋白的相互作用網路，揭示新的磷酸化修飾介導的細胞信號通路。.開展對磷酸化修飾介導的蛋白質相互作用的系統性研究，不僅有助於理解磷酸化修飾調節的信號轉導機理及其在生命過程中的重要意義，而且能為藥物開發提供重要的指導信息。
結題摘要
本項目旨在利用信號處理、模式識別及化學計量學算法對蛋白質功能進行研究，主要開展了以下研究工作：（1）挖掘蛋白質中功能位點殘基的特徵信息，構建了一系列蛋白質功能位點的預測模型，包括對二硫鍵、脂結合位點、有害胺基酸殘基突變、藥物作用位點及黃素單核苷酸綁定位點的識別與預測；（2）探討蛋白質相互作用機理，構建了包括人類、酵母、線蟲、大腸桿菌及果蠅的蛋白質相互作用預測模型，並構建了web-server網路伺服器，並通過蛋白質相互作用網路來推導負樣本，提出預測蛋白質相互作用新方法；（3） 從蛋白質的分泌途徑研究蛋白質的功能，完成了對人類及細菌蛋白的基於分泌途徑的功能分類，並對神經毒素蛋白的功能進行了模式識別的研究。以上新方法的提出與預測模型的建立，對於進一步從序列、結構了解蛋白質功能，尤其是對那些與已知功能或代謝通路的蛋白有相互作用的蛋白質的功能鑑定具有很好的參考價值。總之，已完成的這些研究工作具備系統性，又不失先進性，超額完成了基金計畫書中所規定的研究內容，達到了我們的預定目標。在該項目資助下，完成SCI論文8篇，EI收錄論文1篇，並培養多名研究生。
