nsSNPs影響植物蛋白質磷酸化修飾的生物信息學研究

nsSNPs影響植物蛋白質磷酸化修飾的生物信息學研究

《nsSNPs影響植物蛋白質磷酸化修飾的生物信息學研究》是依託鄭州大學,由程涵擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:nsSNPs影響植物蛋白質磷酸化修飾的生物信息學研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:程涵
  • 依託單位:鄭州大學
  • 批准號:31601067
  • 申請代碼:C0609
  • 負責人職稱:副教授
  • 研究期限:2017-01-01 至 2019-12-31
  • 支持經費:20(萬元)
項目摘要
蛋白質磷酸化是重要的翻譯後修飾之一,在植物的生長發育過程中發揮關鍵作用,幾乎參與所有生物學過程。非同義單核苷酸多態性(Non-synonymous single nucleotide polymorphisms, nsSNPs)可改變蛋白質磷酸化修飾的狀態,進而重排某些關鍵生物學通路和網路,並參與抗逆和抗病的過程,最終可影響植物對各種不利生物或非生物因素的回響。本項目擬以模式植物——擬南芥和兩種重要糧食作物——水稻和玉米為研究對象,通過收集實驗鑑定的植物磷酸化底物位點數據,開發植物激酶特異性磷酸化位點的預測軟體,構建nsSNPs影響蛋白質磷酸化修飾的預測分析平台,系統研究三種植物的nsSNPs對磷酸化調控網路以及抗逆抗病過程的影響,並對部分計算分析結果進行生物學實驗驗證。本項目旨在建立與植物蛋白質磷酸化修飾相關的nsSNPs的預測分析平台,進而探索其調控磷酸化網路及參與環境回響的分子機制。

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