《蛋白質-蛋白質相互作用位點的預測》是依託華中科技大學,由陳穎擔任項目負責人的專項基金項目。
基本介紹
- 中文名:蛋白質-蛋白質相互作用位點的預測
- 項目類別:專項基金項目
- 項目負責人:陳穎
- 依託單位:華中科技大學
- 批准號:10847129
- 申請代碼:A25
- 負責人職稱:講師
- 研究期限:2009-01-01 至 2009-12-31
- 支持經費:2(萬元)
《蛋白質-蛋白質相互作用位點的預測》是依託華中科技大學,由陳穎擔任項目負責人的專項基金項目。
《蛋白質-蛋白質相互作用位點的預測》是依託華中科技大學,由陳穎擔任項目負責人的專項基金項目。中文摘要為滿足迅速發展的蛋白質序列庫對了解蛋白質結構的要求,及準確把握蛋白質-蛋白質相互作用位點對識別藥理學目標和藥物設計研究的...
一、設計基於蛋白質共進化的分析方法,識別蛋白質相互作用關係。二、利用局部信息(序列、結構)建立蛋白質結合位點知識庫,設計合理的相似性模型預測蛋白質結合位點殘基。三、構造局部模型和機率圖模型,統計蛋白質表面殘基的物理化學特性,...
《蛋白質功能位點及相互作用位點預測》是2007年北京大學俞歡所寫的學位論文,指導老師是錢敏平。副題名 外文題名 論文作者 俞歡著 導師 錢敏平指導 學科專業 學位級別 d 2007n 學位授予單位 北京大學 學位授予時間 2007 關鍵字 蛋白質 ...
《基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測方法研究》是依託同濟大學,由黃德雙擔任項目負責人的重點項目。中文摘要 蛋白質相互作用與功能預測問題是當前蛋白質組學要解決的核心問題之一,這個問題的解決將有助於理解生命現象的本質,並對生命...
蛋白質相互作用通常可以分為物理互作和遺傳互作。物理互作是指蛋白質間通過空間構象或化學鍵彼此發生的結合或化學反應,是蛋白質互作的主要研究對象。而遺傳互作則是指在特殊環境下,蛋白質或編碼基因收到其他蛋白質或基因的影響,常常表現...
1.3.3配體-受體相互作用的物理學性質013 1.4蛋白質結合位點預測研究現狀018 1.4.1蛋白質-蛋白質和蛋白質-配體結合位點的比較019 1.4.2蛋白質-配體結合位點預測020 1.4.3蛋白質-蛋白質結合位點預測029 1.5本研究的主要工作033...
輔以表面技術、光譜等多種手段,通過考察若干蛋白質的界面行為及其相互作用,整合各種重要參數,提出蛋白質相互作用的識別與結合模型,推測蛋白質相互作用的重要位點、發生機制以及對生物體內代謝過程的調控,建立蛋白質-蛋白質相互作用的電...
(4)在機器學習相關算法研究方面,提出了一種基於SVM的主動學習算法,用來解決蛋白質相互作用的預測問題。同時,針對生物信息學中正、反例不平衡問題,給出了構造合理反例集的算法,用於基於蛋白質互作數據的基因功能推斷方法。
《基於結構與序列信息的蛋白質-配體結合位點的預測》是依託南開大學,由楊建益擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白質是細胞中重要的生物大分子,它們通過與配體的相互作用來執行其生物學功能。因此對蛋白質-配體結合位點的預測...
《基於多生物網路的蛋白質功能預測算法研究》是依託昆明理工大學,由彭瑋擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 隨著基因組序列數據和其功能注釋數據之間差距的日益增大,高效的蛋白質功能預測方法成為後基因組時代的研究熱點。考慮到細胞...
另一方面,以此為基礎,講述從新的角度研究生物信息學中與蛋白質相關的幾個重要問題,其中包括適用於多物種的關鍵蛋白識別、蛋白質複合物挖掘、以及蛋白質功能預測。圖書目錄 第一部分 基礎篇 第1章 緒論 (2) 1.1 蛋白質相互作用 (...
四級結構預測:主要是預測蛋白質-蛋白質之間的相互作用方式。研究進展 2022年7月28日,據《衛報》報導,谷歌旗下人工智慧公司DeepMind進一步破解了幾乎所有已知的蛋白質結構,其AlphaFold算法構建的資料庫中如今包含了超過2億種已知蛋白質結構...
蛋白質-RNA相互作用界面的預測與設計可以加深我們理解這些分子的生物學功能與分子識別的物理化學原理。我們研究發現長程靜電相互作用在RNA-蛋白質識別中起重要作用,在RNA-蛋白質結合位點附近存在靜電勢阱。針對RNA-蛋白質相互作用界面存在...
蛋白質互補分析(Protein-complementation assay PCA) 是新發展起來的為了監測胞內蛋白相互作用的技術,報告蛋白分解成兩個連線(通過非共價整合或者通過內蛋白介導的共價連線)到靶蛋白的非功能性的片段。蛋白質互補分析(Protein-complementation ...
同理,不同細胞在不同生理或病理狀態下所表達的蛋白質的種類也不盡相同。蛋白質是基因功能的實施者,因此對蛋白質結構,定位和蛋白質-蛋白質相互作用的研究將為闡明生命現象的本質提供直接的基礎。生命科學是實驗科學,因此生命科學的發展...
蛋白質結合位點結構比對方法的研究是當今結構基因組學的重要研究內容之一,對於蛋白質結構和功能研究有著重要的意義。申請課題擬解決蛋白質與蛋白質結合位點結構比對研究中的幾個熱點和難點問題,課題組將蒐集和整理蛋白質與蛋白質結合位點的...
然後運用rnafold等生物信息學軟體提取特徵,並運用深度學習方法構建了蛋白質-RNA相互作用預測模型DPRPI。另外,我們採用十倍交叉驗證策略,在3個公開數據集RPI2241、RPI369和RPI12737上進行模型性能評價,結果表明,我們的模型具有較好的預測...
蛋白質–蛋白質相互作用是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞。定義 兩個或多個蛋白質通過物理接觸結合在一起的反應。通常是為了實現一定的生物學功能。發布時間 2018年,經全國科學技術名詞審定委員會審定發布。出處 《...
蛋白–蛋白相互作用 蛋白–蛋白相互作用(protein-protein interaction)是2014年公布的藥學名詞。定義 導致蛋白質活性構象和信號轉導變化的蛋白質之間的作用。如多肽配體與蛋白酶、多肽激素與受體之間的相互作用。出處 《藥學名詞》第二版。
五、使用快速矩陣方法檢索資料庫 參考文獻 第十七章利用網際網路資源來研究蛋白質蛋白質相互作用 一、蛋白質序列信息 二、資料庫查詢 三、結構域檢索及相互作用預測 四、實驗過程中用到的網路資源 五、綜合性網路資源 參考文獻 ...
基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測 基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測是一本2019年出版的圖書,由同濟大學出版社出版
蛋白質-蛋白質相互作用(protein-protein interaction)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的計算機科學技術名詞。定義 兩種或兩種以上的蛋白質結合的過程。通常旨在執行其生化功能。出處 《計算機科學技術名詞 》第三版 ...
蛋白質–蛋白質對接 蛋白質–蛋白質對接(protein-protein docking)是2018年公布的生物物理學名詞。定義 採用能量最小化等規則,獲得兩個或多個蛋白質分子形成複合物模型的計算過程。出處 《生物物理學名詞》第二版。
本書為蛋白質及其相互作用的研究提供了相應的智慧型演算方法,並指出這些方法在解決生物學問題中的套用策略。圖書目錄 前言 第1章緒論 第2章蛋白質三維結構預測分析 第3章蛋白質相互作用熱點預測 第4章蛋白質相互作用熱區預測 第5章藥物-...
我們將在本項目的支持下,採用生物信息學與實驗學的方法,將乾法與濕法有機的結合,使用改進版本的GPS算法預測蛋白質的乙醯化和甲基化位點,並進一步發展酶特異性的乙醯化和甲基化位點的預測。我們擬結合蛋白質-蛋白質相互作用的信息,...
蛋白質-蛋白質相互作用 《蛋白質-蛋白質相互作用》是北京大學醫學出版社出版的圖書,作者是(美)富(Fu,H.)。
第27章 共聚焦顯微鏡檢測細胞內蛋白質的共定位 第28章 蛋白質片段互補法分析生物化學網路 第29章 細胞內蛋白質交聯 第五部分 基於蛋白質組學的技術 第30章 蛋白質蛋白質相互作用的計算機預測 第31章 用親和力方法研究磷酸化依賴...
蛋白質賴氨酸的乙醯化是一種重要的翻譯後修飾(PTM),在細胞生命活動中發揮舉足輕重的作用,並參與著包括腫瘤在內的多種病理過程。發展理論預測乙醯化位點的方法,是乙醯化研究的迫切需要和當前生物信息學的前沿熱點課題,具有重要的生物...
第一章 蛋白質與蛋白質相互作用的結構基礎 第二章 蛋白質相互作用的定量分析 第二部分 實驗方法 第三章 酵母雙雜交系統篩選和驗證蛋白質相互作用 第四章 細菌雙雜交技術 第五章 哺乳動物雙雜交 第六章 噬菌體展示技術 第七章 GST...
處理與分析其中所含生物信息,可預測蛋白質相互作用位點與相互作用網路,已廣泛用於疾病診斷、預防與治療相關的基礎與套用研究中。目前,通過多種表面展示實驗已能高通量獲得模擬肽序列;但相應專業資料庫建設嚴重滯後,相關生物信息處理與分析...