《蛋白質-蛋白質相互作用的電化學分析》是依託南京大學,由李根喜擔任項目負責人的重點項目。
基本介紹
- 中文名:蛋白質-蛋白質相互作用的電化學分析
- 項目類別:重點項目
- 項目負責人:李根喜
- 依託單位:南京大學
《蛋白質-蛋白質相互作用的電化學分析》是依託南京大學,由李根喜擔任項目負責人的重點項目。
《蛋白質-蛋白質相互作用的電化學分析》是依託南京大學,由李根喜擔任項目負責人的重點項目。項目摘要雖然蛋白質參與了幾乎所有的生命活動,但研究表明,每個蛋白質並不是獨立地、而是通過相互作用來完成特定的生物學功能,對蛋白質-蛋...
蛋白質互補分析(Protein-complementation assay PCA) 是新發展起來的為了監測胞內蛋白相互作用的技術,報告蛋白分解成兩個連線(通過非共價整合或者通過內蛋白介導的共價連線)到靶蛋白的非功能性的片段。在靶蛋白相互作用時,這個報告酶的活性恢復。幾個生物發光報告酶已經被套用到PCA技術上了,如螢火蟲螢光素酶,海腎...
《蛋白質電化學分析實驗技術:基礎與方案》是2020年上海大學出版社出版的圖書。內容簡介 蛋白質定量分析可以為蛋白質功能研究、藥物篩選、疾病診斷預後等提供有效技術手段。蛋白質很多功能的執行與電荷的運動密切相關,這使得電化學分析實驗技術在蛋白質定量分析中有著得天獨厚的優勢。本書作者長期從事蛋白質電化學定量...
(2)用全量子的方法計算蛋白-蛋白相互作用體系。挖掘在傳統分子力場方案下被忽視的靜電極化效應。(3)在MFCC-PB方法所計算的蛋白質電子結構的基礎上,擬合出蛋白可極化電荷。並以此電荷為基礎構建精確的勢能面,研究酶催化反應過程中的自由能變化。此工作有助於解決鹽橋等靜電效應對蛋白結合的貢獻正負與否等頗具爭議...
SPR蛋白質相互作用儀是一種用於物理學、化學領域的分析儀器,於2017年5月25日啟用。技術指標 Plexera分析系統可以同時檢測數千個相互作用反應。系統操作簡單,分析快速,實時、全自動檢測各種分子之間的相互作用。主要功能 可用於:抗體篩選:抗體晶片,大規模抗體篩選,藥物研發:藥物初篩、藥物作用機理的研究、先導化合物...
蛋白質晶片是一種高通量的蛋白功能分析技術,可用於蛋白質表達譜分析,研究蛋白質與蛋白質的相互作用,甚至DNA-蛋白質、RNA-蛋白質的相互作用,篩選藥物作用的蛋白靶點等。原理 蛋白晶片技術的研究對象是蛋白質,其原理是對固相載體進行特殊的化學處理,再將已知的蛋白分子產物固定其上(如酶、抗原、抗體、受體、配體...
首先介紹了信號轉導和人類遺傳學/藥物基因組學等問題,並強調蛋白質——蛋白質相互作用在其中發揮關鍵作用。然後分三部分介紹了如下內容:6個基於標準分子生物學、生物化學和微生物學技術建立起來的、用於分析蛋白質——蛋白質相互作用的方法;6種鑑定和識別蛋白質——蛋白質相互作用的生物物理學方法;近期改進過的與...
蛋白–蛋白相互作用 蛋白–蛋白相互作用(protein-protein interaction)是2014年公布的藥學名詞。定義 導致蛋白質活性構象和信號轉導變化的蛋白質之間的作用。如多肽配體與蛋白酶、多肽激素與受體之間的相互作用。出處 《藥學名詞》第二版。
《蛋白質專一性極化力場在分子動力學模擬中的套用》是依託山東師範大學,由段莉莉擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 靜電相互作用是生物分子中最重要的相互作用,但目前分子力場對靜電相互作用的描述都不包含關鍵的靜電極化效應。新發展的基於全量子力學計算得到具有靜電極化效應的原子電荷,對不同體系大量的分子...
蛋白質相互作用分析是一種用於生物學、食品科學技術領域的分析儀器,於2009年2月1日啟用。技術指標 通過等離子表面共振技術分析DNA-蛋白質,蛋白質-蛋白質等大分子間的相互作用特性,經分析後可以得到結合、解離、平衡常數,含六通道流體流路。折射率範圍:1.33–1.37 折射率單位,動態範圍:1–40,000RU。主要功能...
可提供有關蛋白質相互作用的親和性、特異性和動力學的實時數據。能同時分析最多 6 個分析物和 6 個配體之間的相互作用。一次實驗,在一塊晶片上可分析多達 36 個不同的蛋白相互作用,能高通量地篩選樣品。可用於抗體的特徵和研發、大分子和小分子藥品研發、蛋白-蛋白相互作用分析、蛋白質結構和摺疊的分析等。
三級結構:通過多個二級結構元素在三維空間的排列所形成的一個蛋白質分子的三維結構。四級結構:用於描述由不同多肽鏈(亞基)間相互作用形成具有功能的蛋白質複合物分子。除了這些結構層次,蛋白質可以在多個類似結構中轉換,以行使其生物學功能。對於功能性的結構變化,這些三級或四級結構通常用化學構象進行描述,而相應...
同理,不同細胞在不同生理或病理狀態下所表達的蛋白質的種類也不盡相同。蛋白質是基因功能的實施者,因此對蛋白質結構,定位和蛋白質-蛋白質相互作用的研究將為闡明生命現象的本質提供直接的基礎。生命科學是實驗科學,因此生命科學的發展極大地依賴於實驗技術的發展。以DNA序列分析技術為核心的基因組研究技術推動了...
蛋白質–蛋白質對接 蛋白質–蛋白質對接(protein-protein docking)是2018年公布的生物物理學名詞。定義 採用能量最小化等規則,獲得兩個或多個蛋白質分子形成複合物模型的計算過程。出處 《生物物理學名詞》第二版。
蛋白質相互作用分析儀是一種用於生物學領域的分析儀器,於2015年11月2日啟用。技術指標 Biacore T200 支持使用 96 孔和 384 孔微孔板以及試瓶。 由於同時使用四個流動池要,可同時對四種相互反應進行監測。 Biacore T200 的樣本倉可冷卻至 4°C,從而可在無人看護的情況下,對敏感型樣本進行長達 48 小時的分析...
《蛋白-蛋白界面殘基的能量分析》是依託中國海洋大學,由梁世德擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白-蛋白相互作用是最重要的生命過程之一。但是蛋白-蛋白複合物的晶體結構卻極難得到。隨著蛋白質晶體學的發展,許多單體蛋白質的結構被解析出來。分析這些蛋白的功能成為目前生物學上最重要的任務之一。在目標...
溶液中蛋白質相互作用分析系統是一種用於基礎醫學領域的分析儀器,於2016年11月29日啟用。技術指標 1、分離系統 最高轉速 為 60,000 rpm,轉速精度為 20 rpm 溫度設定範圍為0-40 oC ,精度0.5oC 樣品分離數量(同時進行實驗):21個。主要功能 主要研究蛋白質、核酸等不同分子間或同類分子或亞基間的...
Ⅲ蛋白質-蛋白質相互作用和蛋白質一小分子相互作用 13.非變性條件下蛋白質的免疫沉澱 14.非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳作為研究蛋白質相互作用的一種方法:線上粒體氧化磷酸化複合物分析中的套用 15.化學交聯法分析蛋白質-蛋白質相互作用 16.靶向過氧化物酶體作為檢測蛋白質-蛋白質相互作用的工具 17.生物分子相互作用...
蛋白質相互作用系統是一種用於生物學、基礎醫學、臨床醫學、預防醫學與公共衛生學領域的分析儀器,於2008年9月22日啟用。技術指標 相互作用點:36 相互作用範圍:0.245平方毫米 符合率:大於98% 動態範圍:1-40000RU CCD:12-bit digital camera data points measuring rate:1Hz for display,50 frames/sec for ...
二、利用局部信息(序列、結構)建立蛋白質結合位點知識庫,設計合理的相似性模型預測蛋白質結合位點殘基。三、構造局部模型和機率圖模型,統計蛋白質表面殘基的物理化學特性,分析蛋白質相互作用界面的殘基構象。四、分析綁定蛋白質的序列特性,設計序列分段描述模型,利用特徵編碼方法構建蛋白質相互作用網路。五、研究蛋白...
3 能夠升級其他3類非微流控流路,可兼容光學顯微鏡、電化學技術及HPLC和質譜等平台; 4 進樣方式:內置全自動進樣器。主要功能 基於表面電漿共振原理的蛋白質相互作用工作站。用於鑑定生物分子之間的相互作用,獲得動力學常數包括解離平衡常數(KD)、結合常數(Ka)和解離常數(Kd)。
蛋白質-蛋白質相互作用 《蛋白質-蛋白質相互作用》是北京大學醫學出版社出版的圖書,作者是(美)富(Fu,H.)。
本項目融合多學科新成果,從分子水平加強層析分離過程中相互作用的系統認識,建立新方法,可以推廣到其它生物分離過程,促進生物分離過程的合理設計。結題摘要 圍繞蛋白質層析分離中的分子相互作用,一方面從分子模擬入手,構建分子模擬方法,探討配基-蛋白質間分子相互作用;另一方面從實驗研究入手,製備系列層析分離介質,...
《蛋白質--蛋白質,蛋白質--核酸相互作用及結構研究》是徐筱傑為項目負責人,北京大學為依託單位的面上項目。 項目摘要 本項目內容包括分子間相互作用的計算機模擬及原子顯微鏡的觀察。已完成具有世界先進水平的在微機上運行的研究分子間相互作用的計算機系統,該系統具有友好的工作界面,包括資料庫分子對接,構效關係,...
連結所指的是可能產生的相互作用,DIP 對每一個相互作用都會說明證據(實驗的方法)與提供文獻,此外,也記錄除巨量分析外,支持此相互作用的實驗數量。DIP 還可以用序列相似性(使用Blast)、模式 (pattern) 等查詢。至2002年6月,已收錄了約一萬八千個蛋白質間的相互作用信息條目。BIND所收錄的資料較少,不過其...
(6)SDS-PAGE, Western blotting或質譜儀分析。注意的問題:(1)細胞裂解採用溫和的裂解條件,不能破壞細胞記憶體在的所有蛋白質-蛋白質相互作用,多採用非離子變性劑(NP40或Triton X-100)。每種細胞的裂解條件是不一樣的,通過經驗確定。不能用高濃度的變性劑(0.2%SDS),細胞裂解液中要加各種酶抑制劑,如...
隨著技術的飛速發展,已能分離出10 000個斑點(spot)。 當雙向電泳斑點的全面分析成為現實的時候,蛋白質組的分析變得可行。樣品製備(sample prepareation)和溶解同樣事關2-DE的成效,目標是儘可能擴大其溶解度和解聚,以提高解析度。用化學法和機械裂解法破碎以儘可能溶解和解聚蛋白,兩者聯合有協同作用。對IEF(...
重新形成活性的螢光基團而發出螢光。在螢光顯微鏡下,就能直接觀察到兩目標蛋白是否具有相互作用,並且在最接近活細胞生理狀態的條件下觀察到其相互作用發生的時間、位置、強弱、所形成蛋白質複合體的穩定性,以及細胞信號分子對其相互作用的影響等,這些信息對研究蛋白質相互作用有一定意義。
ChIP-seq,指的是結合位點分析法,作為研究體內蛋白質與DNA相互作用。染色質免疫共沉澱技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因...