蛋白質相互作用分析是一種用於生物學、食品科學技術領域的分析儀器,於2009年2月1日啟用。
基本介紹
- 中文名:蛋白質相互作用分析
- 產地:美國
- 學科領域:生物學、食品科學技術
- 啟用日期:2009年2月1日
- 所屬類別:分析儀器
蛋白質相互作用分析是一種用於生物學、食品科學技術領域的分析儀器,於2009年2月1日啟用。
蛋白質相互作用分析是一種用於生物學、食品科學技術領域的分析儀器,於2009年2月1日啟用。技術指標通過等離子表面共振技術分析DNA-蛋白質,蛋白質-蛋白質等大分子間的相互作用特性,經分析後可以得到結合、解離、平衡常數,含...
蛋白質互補分析(Protein-complementation assay PCA) 是新發展起來的為了監測胞內蛋白相互作用的技術,報告蛋白分解成兩個連線(通過非共價整合或者通過內蛋白介導的共價連線)到靶蛋白的非功能性的片段。蛋白質互補分析(Protein-complementation assay PCA) 是新發展起來的為了監測胞內蛋白相互作用的技術,報告蛋白分解成兩...
雖然蛋白質參與了幾乎所有的生命活動,但研究表明,每個蛋白質並不是獨立地、而是通過相互作用來完成特定的生物學功能,對蛋白質-蛋白質相互作用的分析與表征可揭示許多生命活動的信息,拓展生物感測體系,發展新的生物感測方法。另一方面,由於蛋白質-蛋白質相互作用極其複雜,需要綜合運用多種理論知識和實驗技術,而隨著...
生物膜干涉蛋白相互作用分析系統是一種用於基礎醫學、臨床醫學、藥學領域的分析儀器,於2018年7月26日啟用。技術指標 1.1 檢測技術:生物膜干涉技術原理,非標記實時線上檢測分子間相互作用的過程,可以檢測不可逆的生物分子結合; 1.2 檢測模式:採用平行檢測模式,同時檢測8組獨立的不同生物分子相互作用; 1.3 ...
(1)相互作用的蛋白質都是經翻譯後修飾的,處於天然狀態;(2)蛋白的相互作用是在自然狀態下進行的,可以避免人為的影響;(3)可以分離得到天然狀態的相互作用蛋白複合物。缺點 (1)可能檢測不到低親和力和瞬間的蛋白質-蛋白質相互作用;(2)兩種蛋白質的結合可能不是直接結合,而可能有第三者在中間起橋樑作用...
一、設計基於蛋白質共進化的分析方法,識別蛋白質相互作用關係。二、利用局部信息(序列、結構)建立蛋白質結合位點知識庫,設計合理的相似性模型預測蛋白質結合位點殘基。三、構造局部模型和機率圖模型,統計蛋白質表面殘基的物理化學特性,分析蛋白質相互作用界面的殘基構象。四、分析綁定蛋白質的序列特性,設計序列分段...
《基於智慧型計算的蛋白質及其相互作用算法分析》是2020年科學出版社出版的圖書,作者是張曉龍,林曉麗,胡靜。內容簡介 隨著蛋白質組學研究的不斷深入,智慧型計算方法已成為蛋白質組學的支撐技術。本書系統地闡述目前蛋白質及其相互作用的主要研究內容,介紹其背景、相關數據、主要計算方法以及軟體工具資源。本書的主要內容包括...
首先介紹了信號轉導和人類遺傳學/藥物基因組學等問題,並強調蛋白質——蛋白質相互作用在其中發揮關鍵作用。然後分三部分介紹了如下內容:6個基於標準分子生物學、生物化學和微生物學技術建立起來的、用於分析蛋白質——蛋白質相互作用的方法;6種鑑定和識別蛋白質——蛋白質相互作用的生物物理學方法;近期改進過的與...
蛋白質細胞相互作用分析儀 蛋白質細胞相互作用分析儀是一種用於生物學、基礎醫學領域的分析儀器,於2016年9月14日啟用。技術指標 螢光標記檢測,對FITC標記的化合物或其他具有相同激發波長和發射波長的螢光標記物進行實時觀察。主要功能 進行蛋白-細胞相互作用親和力測定;單抗與細胞相互作用測定等。
從mRNA角度考慮,實際上僅包括了轉錄水平調控,並不能全面代表蛋白質表達水平。實驗也證明,組織中mRNA豐度與蛋白質豐度的相關性並不好,尤其對於低豐度蛋白質來說,相關性更差。更重要的是,蛋白質複雜的翻譯後修飾、蛋白質的亞細胞定位或遷移、蛋白質-蛋白質相互作用等則幾乎無法從mRNA水平來判斷。毋庸置疑,蛋白質...
主要成果包括三個方面:第一,分子模擬研究配基-蛋白質分子相互作用:針對層析分離過程的特點,結合分子對接和分子動力學模擬,構建了單一配基、固定化配基、配基網層層遞進的分子模擬方法,從分子水平驗證了疏水性電荷誘導層析(HCIC)和離子交換層析分離蛋白質的分子機制;探討了配基結構、分布、密度、空間臂等對蛋白質...
《基於蛋白質起源的蛋白質相互作用網路演化機制的研究》是依託蘇州大學,由張文宇擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 細胞內的各種重要的生理過程都是以蛋白質間的相互作用為紐帶,並形成網路。因而,研究蛋白質互作網路的形成過程對我們理解生命活動的起源,組織及發展機制具有至關重要的意義。大量蛋白質互作數...
本課題擬通過發展可靠的結構域-多肽相互作用預測模型,進行蛋白質結構域介導的蛋白-蛋白相互作用網路的預測和研究。研究內容包括:(1)構建通用的SH3結構域結合多肽的預測模型,從理論上完整地預測酵母蛋白質組中通過SH3介導的蛋白-蛋白相互作用網路;通過對預測得到的網路的分析,從結構上揭示SH3的識別密碼以及SH3...
《DNA與蛋白質作用的全基因組分析》是依託東南大學,由陸祖宏擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 新一代DNA測序技術的出現給在全基因組水平上開展DNA和蛋白質相互作用的研究帶來了重大的機遇。本項目旨在發展基於新一代高通量DNA測序技術的DNA和蛋白質相互作用的研究平台,使之能夠在全基因組水平上進行特定組織和細胞...
《酵母蛋白質相互作用網路的動態性質研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院,由李棟擔任項目負責人的青年科學基金項目。 中文摘要 蛋白質相互作用在很多生物學進程中發揮重要作用,對蛋白質相互作用網路的分析有助於從整體上理解細胞的生物學功能。當前對蛋白質網路的研究大都基於靜態的網路,而生命是一個...
蛋白質相互作用在所有的生命活動中扮演著十分重要的角色,研究蛋白質相互作用具有重大的生物學意義。通過實驗的方法來確定蛋白質相互作用不僅費時、費力、價格高昂,而且不能保證很高的精度。因此有必要研究通過計算的方法來分析或者預測蛋白質相互作用的問題。本項目擬採用自然語言處理和機器學習相結合的方法來研究蛋白質...
代謝組學在臨床疾病診斷、病理機制的探索、治療新靶點的發現等研究中發揮了極為重要的作用,但同時也存在缺陷,代謝組學的發展迫切需要發展新的方法。本項目建立了蛋白質-代謝物相互作用的代謝組學新方法,通過蛋白質-小分子相互作用,實現了對一類小分子化合物群的無歧視分析。並以心血管疾病的研究為實例,通過固定...
第十四章 雷射共聚焦技術在蛋白質亞細胞定位與蛋白質相互作用中的套用 第三部分 生物信息學在蛋白質相互作用研究中的套用 第十五章 利用計算生物學的方法進行全基因組水平的蛋白質相互作用分析 第十六章 蛋白質相互作用生物信息學檢索與預測 第十七章 常用網際網路蛋白相互作用資料庫資源的使用 ...
蛋白質–蛋白質相互作用 蛋白質–蛋白質相互作用是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞。定義 兩個或多個蛋白質通過物理接觸結合在一起的反應。通常是為了實現一定的生物學功能。發布時間 2018年,經全國科學技術名詞審定委員會審定發布。出處 《生物物理學名詞》 (第二版)
一級結構:組成蛋白質多肽鏈的線性胺基酸序列。二級結構:依靠不同胺基酸之間的C=O和N-H基團間的氫鍵形成的穩定結構,主要為α螺旋和β摺疊。三級結構:通過多個二級結構元素在三維空間的排列所形成的一個蛋白質分子的三維結構。四級結構:用於描述由不同多肽鏈(亞基)間相互作用形成具有功能的蛋白質複合物分子。除了...
(2) 提出了一種用於蛋白質相互作用分析和預測的開源算法:ppiPre算法,它是一種用於PPI分析和預測的開源框架,集成了異質特性,包括:三個基於GO的語義相似性,一個基於KEGG的共路徑相似性,以及三個基於拓撲的相似性。 (3) 首先利用邊的中心性,如介數、信息中心性和邊聚集係數來給連線賦權重,將無權圖轉換為...
SPR蛋白質相互作用儀是一種用於物理學、化學領域的分析儀器,於2017年5月25日啟用。技術指標 Plexera分析系統可以同時檢測數千個相互作用反應。系統操作簡單,分析快速,實時、全自動檢測各種分子之間的相互作用。主要功能 可用於:抗體篩選:抗體晶片,大規模抗體篩選,藥物研發:藥物初篩、藥物作用機理的研究、先導化合物...
本項目將從蛋白質的最基本特徵即序列特徵出發,在蛋白質相互作用的數據整合、特徵編碼、分類識別和預測結果校準方面進行深入研究,以探索蛋白質相互作用的規律與本質。首先,在整合來自不同數據源相互作用數據的基礎上,利用胺基酸殘基的理化性質,並結合矩陣分解方法對蛋白質序列進行編碼;然後,運用主成分分析和極限學習機...
蛋白質間相互作用研究 大多數蛋白質-蛋白質結合相互作用是瞬時的,通過交聯方法可以穩定或永久連線相互作用複合物中的成分,從而有助於鑑別這些瞬時接觸。一旦相互作用的成分被共價偶聯,可以使用其他步驟(例如細胞裂解,親和純化和電泳)來製備分析樣品,同時可維持最初的相互作用複合物。生物飛彈研究(靶向藥物)將能...
其基本原理是將靶蛋白-GST融合蛋白親和固化在谷胱甘肽親和樹脂上,作為與目的蛋白親和的支撐物,充當一種“誘餌蛋白”,目的蛋白溶液過柱,可從中捕獲與之相互作用的“捕獲蛋白”(目的蛋白),洗脫結合物後通過SDS-PAGE電泳分析,從而證實兩種蛋白間的相互作用或篩選相應的目的蛋白,“誘餌蛋白”和“捕獲蛋白”均可通過...
ChIP-seq,指的是結合位點分析法,作為研究體內蛋白質與DNA相互作用。染色質免疫共沉澱技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾位點的研究。將ChIP與第二代測序技術相結合的ChIP-Seq技術,能夠高效地在全基因...
Filter-Binding Assays 亦即親和力分析,是分析蛋白與核酸相互作用的一種方法。由於蛋白質一般帶正電荷,而核酸則由於磷酸基團的存在帶負電荷。在該實驗中,我們用到的硝化纖維膜帶負電荷。實驗開始之前,先用同位素標記待研究的DNA片段,將其與研究蛋白共同孵育,然後過柱。與DNA能夠結合的蛋白質則會留在消化纖維的表面...