《模擬肽的生物信息處理與分析新方法研究》是依託電子科技大學,由黃健擔任醒目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：模擬肽的生物信息處理與分析新方法研究
- 依託單位：電子科技大學
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：黃健
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
模擬肽是能模擬蛋白質相互作用位點的多肽。處理與分析其中所含生物信息，可預測蛋白質相互作用位點與相互作用網路，已廣泛用於疾病診斷、預防與治療相關的基礎與套用研究中。目前，通過多種表面展示實驗已能高通量獲得模擬肽序列；但相應專業資料庫建設嚴重滯後，相關生物信息處理與分析方法存在嚴重噪聲納入與信息丟失，預測性能不盡人意。針對上述問題，本項目將在前期工作基礎上，建設迄今最為完備的模擬肽資料庫（MimoDB），挖掘、匯總噪聲序列特徵，建立基於模式識別與資料庫搜尋比對的噪聲掃描過濾程式，開發基於胺基酸組成比對的模擬肽分析新算法並將其實現為網路程式。我們還將利用MimoDB數據並以上市藥物美妥昔單抗為對象，對新方法的性能進行系統評估與實驗驗證。這些工作最終將形成一套以降噪保息為核心思想、性能優越可靠的模擬肽生物信息處理與分析新方法，成為相關科研工作的重要數據來源與新工具，具有重要的科學意義與套用價值。
結題摘要
模擬肽是能模擬蛋白質相互作用位點的多肽，可通過噬菌體展示實驗（生物淘選）較為方便地獲得。處理與分析噬菌體展示實驗中的模擬肽數據，可預測蛋白質相互作用位點與相互作用網路，已廣泛用於疾病診斷、預防與治療相關的基礎與套用研究中。本項目的研究目標是：建立從數據收集、噪聲濾除到信號解析的噬菌體展示生物信息學平台並將其套用到生物醫學研究中。 經過幾年的努力，本項目取得的主要成果有：（1）成功構建了迄今為止最為完備的噬菌體展示多肽資料庫（MimoDB）；（2）建立了一套基於模式識別與資料庫搜尋比對的噪聲多肽預測、掃描、過濾程式（SAROTUP）；（3）升級了模擬肽解析程式（MIMOX）；（4）我們的數據資源及分析軟體被我們自己及國內數十所大學與研究機構廣泛運用，獲得了較高的評價。 基於這些工作，我們在Nucleic Acid Research等國際期刊發表SCI 收錄論文8 篇，單篇最高影響因子到達8.026，參加國際會議4 次（特邀報告及分組報告各2次）、國內會議2次（特邀報告及分組報告各1次），培養博士後1人、博士生1人、碩士研究生6人。無論是科學研究，還是人才培養，各項指標均超額完成。
