基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測是一本2019年出版的圖書,由同濟大學出版社出版
基本介紹
- 中文名:基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測
- 出版社:同濟大學出版社
- ISBN:9787560878317
- 定價:60.1 元
- 叢書:同濟博士論叢
基於機器學習的蛋白質相互作用與功能預測是一本2019年出版的圖書,由同濟大學出版社出版
本項目針對生物信息學中典型的對稱性預測問題,發展適合的機器學習pairwise核方法,通過度量兩對對象之間的相似度,解決蛋白質相互作用、基因功能關聯這兩類對稱預測問題。首先,構建用於客觀反映pairwise核方法分類性能的數據集,通過平衡隨機...
《套用機器學習方法預測和分析蛋白質的結構柔性》是依託浙江工商大學,由張華擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質的結構柔性與動力學特徵是蛋白質完成各種生物功能的基礎,對它的研究是蛋白質組計畫的一個重要組成部分。隨著...
本課題通過分析生物數據特徵及生物關聯特性,利用複雜網路理論、機率統計方法、機器學習算法,解決蛋白質相互作用相關預測問題。一、設計基於蛋白質共進化的分析方法,識別蛋白質相互作用關係。二、利用局部信息(序列、結構)建立蛋白質結合位點...
《面向蛋白質功能預測的多標記學習方法研究與套用》是依託西南大學,由余國先擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質功能預測是生物信息學領域的關鍵問題。針對當前的預測方法通常假定已知蛋白質標註準確無缺失,不符合現實特徵的...
本項目擬採用自然語言處理和機器學習相結合的方法來研究蛋白質相互作用問題。首先,將多個異構的蛋白質相互作用資料庫進行整合來建立一個相對完整的相互作用資料庫,通過自然語言處理技術對相互作用數據進行評估,為資料庫中每一個記錄賦予可信...
2.1.3 蛋白質組學 2.1.4 資料庫 2.2 蛋白質序列、結構與功能的關係 2.3 機器學習 2.3.1 機器學習的定義和特點 2.3.2 基本的機器學習模型 2.3.3 機器學習方法分類 2.3.4 套用於生物信息學領域的機器學習方法 第3章 ...
《基於智慧型計算的蛋白質及其相互作用算法分析》是2020年科學出版社出版的圖書,作者是張曉龍,林曉麗,胡靜。內容簡介 隨著蛋白質組學研究的不斷深入,智慧型計算方法已成為蛋白質組學的支撐技術。本書系統地闡述目前蛋白質及其相互作用的主要...
最後用機器學習的多層次學習框架集成多生物網路來預測的蛋白質功能。研究中涉及的數據、研究成果以及算法實現將會整合到一個統一的信息平台上來,實現多網路的構建、分析以及蛋白質功能預測,方便生物學研究和醫學研究人員使用。結題摘要 隨著...
《基於幾何算法與機器學習的反向配體結合位點預測》是依託南開大學,由王奎擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白質-配體結合位點的預測,是生物信息學中的重要問題。廣泛套用於蛋白質功能注釋,虛擬藥物篩選,合理化藥物設計中。...
《激酶特異性的蛋白質磷酸化預測方法研究》是依託中國科學技術大學,由王明會擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白質磷酸化過程是真核細胞生命活動最普遍的調控手段,具有重要的研究意義。發展基於機器學習理論的蛋白質磷酸化預測...
《蛋白質相互作用預測的集成學習方法研究》是依託湖南大學,由曹智擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白質是生物功能的直接執行者,而蛋白質相互作用是細胞進行一切代謝活動的基礎,因此,蛋白質相互作用成為了當前蛋白質組研究的...
蛋白質-蛋白質相互作用研究能夠從分子水平上揭示蛋白質功能,幫助揭示水稻回響乾旱脅迫的分子機制。本研究提出了一種基於機器學習的水稻蛋白質與蛋白質互作預測新方法,該方法結合了蛋白質空間結構與功能信息,有效提高了蛋白質相互作用預測的...
有效識別能量熱點對於蛋白質設計和藥物開發具有非常重要的意義。大規模生物實驗測定能量熱點代價昂貴,使用計算方法預測可以彌補這一不足。本課題將在前期蛋白質相互作用及功能位點預測研究的基礎上,結合生物學、數學、物理學等方法和計算機...
(3)在本課題資助下,成功地將該蛋白質-DNA結合位點預測方法推廣到蛋白質-膜相互作用中。同時創新性地在機器學習的套用中,引入“知識發現”的理念,所以在本課題中我們構建的預測模型不但獲得了高精度的預測結果,而且對預測模型的潛在...
蛋白質組學是當前生命科學的新前沿,通過研究蛋白質的功能、結構、相互作用來系統地分析蛋白質,進而分析生命活動,成為熱點的研究問題之一。尤其是,從蛋白質網路中進行多物種的關鍵蛋白識別、蛋白質複合物挖掘、以及蛋白質功能預測,對揭示...
《蛋白質-蛋白質相互作用位點的預測》是依託華中科技大學,由陳穎擔任項目負責人的專項基金項目。中文摘要 為滿足迅速發展的蛋白質序列庫對了解蛋白質結構的要求,及準確把握蛋白質-蛋白質相互作用位點對識別藥理學目標和藥物設計研究的積極...
.基於天然蛋白質結構處於自由能最小的假設,又因為現有多種類能量函式既有用又不完全準確,可以把柔性對接問題轉化為多目標最佳化問題。通過並行互動多種啟發式搜尋方法、且各搜尋並行體獨立套用不同的能量函式,以及機器學習方法識別和建模...
這些算法幾乎都是採用機器學習算法對從蛋白質序列中提取的特徵進行分類。而本項目將採用全新的思路,打破現有的問題框架,通過融合蛋白質相互作用網路,調控通路網路,並在網路結構上重新利用蛋白質序列及序列相關數據(理化特性,功能域組成,...
《蛋白質功能位點及相互作用位點預測》是2007年北京大學俞歡所寫的學位論文,指導老師是錢敏平。副題名 外文題名 論文作者 俞歡著 導師 錢敏平指導 學科專業 學位級別 d 2007n 學位授予單位 北京大學 學位授予時間 2007 關鍵字 蛋白質 ...
對結構域組成進行非線性變換,並利用進化算法最佳化計算模型,為得到高可靠性的蛋白質相互作用預測結果打下良好的基礎。本項目的成果將為了解蛋白質生理功能的實現機制和治療相關疾病的藥物設計提供理論上的依據。
機體細胞內蛋白質之間相互交叉作用可以從分子水平揭示蛋白質的功能,而且對於提示生長、發育、分化、凋亡以及理解生物調控機制等生命活動規律至關重要,為探討重大疾病的機制、疾病治療、疾病預防和新藥開發提供了重要的理論基礎。因此,了解、...
第16章 利用噬菌體展示和多價大分子技術設計蛋白質一蛋白質相互作用抑制劑 第三部分 在異種系統中檢測蛋白質蛋白質相互作用 第17章 基於轉錄激活的細菌雙雜交系 第18章 套用酵母雙雜交系統檢測相互作用的蛋白 第19章 利用雙誘餌...
該工作不但有助於我們從整體上理解自相互作用蛋白在細胞功能中的作用,所構建的預測模型也能夠促進自相互作用蛋白的高通量發現,為揭示它們的功能提供線索。此外,針對一類特殊的蛋白質相互作用——泛素連線酶-底物相互作用(含自身相互作用...
系統分析大量蛋白在生物系統中的相互作用關係,對於了解生物系統中蛋白質的工作原理,了解疾病等特殊生理狀態下生物信號和能量物質代謝的反應機制,以及了解蛋白之間的功能聯繫都有重要意義。蛋白質相互作用通常可以分為物理互作和遺傳互作。物理...
4.3.3 基於蛋白質結構的方法 4.3.4 基於胺基酸序列的方法 4.3.5 基於自然語言處理的文獻挖掘方法 4.3.6 基於機器學習方法預測蛋白質相互作用 4.4 蛋白質相互作用數據可靠性評價 4.4.1 相似性評價指標 4.4.2 有效...
《基於結構與序列信息的蛋白質-配體結合位點的預測》是依託南開大學,由楊建益擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 蛋白質是細胞中重要的生物大分子,它們通過與配體的相互作用來執行其生物學功能。因此對蛋白質-配體結合位點的預測...