基於結構域組成變換的蛋白質相互作用預測方法研究

基於結構域組成變換的蛋白質相互作用預測方法研究

《基於結構域組成變換的蛋白質相互作用預測方法研究》是依託安徽工業大學,由王兵擔任項目負責人的青年科學基金項目。

基本介紹

  • 中文名:基於結構域組成變換的蛋白質相互作用預測方法研究
  • 項目類別:青年科學基金項目
  • 項目負責人:王兵
  • 依託單位:安徽工業大學
  • 批准號:60803107
  • 申請代碼:F0213
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2009-01-01 至 2011-12-31
  • 支持經費:20(萬元)
項目摘要
蛋白質相互作用是當前蛋白質組學所要解決的關鍵問題之一,這個問題的解決有助於理解生命現象的本質,並對整個生命科學的發展都將起到強有力的推動作用。近幾年利用計算方法預測蛋白質相互作用受到了廣泛關注並得到了快速發展,但還沒有一種方法能夠同時考慮多結構域之間複製和組合對蛋白質相互作用所產生的影響。本項目在蛋白質相互作用的數據獲取和預處理、特徵提取和選擇、分類識別方面進行深入研究,探索蛋白質相互作用的作用機制;從蛋白質-結構域出發,提出一種新的基於結構域組成的蛋白質柱狀編碼方式,構建預測蛋白質相互作用的高性能計算模型;考慮多結構域對蛋白質相互作用的影響,對結構域組成進行非線性變換,並利用進化算法最佳化計算模型,為得到高可靠性的蛋白質相互作用預測結果打下良好的基礎。本項目的成果將為了解蛋白質生理功能的實現機制和治療相關疾病的藥物設計提供理論上的依據。

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