《套用機器學習方法預測和分析蛋白質的結構柔性》是依託浙江工商大學，由張華擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 項目名稱：套用機器學習方法預測和分析蛋白質的結構柔性
- 批准號：61003187
- 項目類別：青年科學基金項目
- 申請代碼：F0213
- 項目負責人：張華
- 負責人職稱：教授
- 依託單位：浙江工商大學
- 研究期限：2011-01-01 至 2011-12-31
- 支持經費：7（萬元）
項目摘要
蛋白質的結構柔性與動力學特徵是蛋白質完成各種生物功能的基礎，對它的研究是蛋白質組計畫的一個重要組成部分。隨著蛋白質結構測定技術的不斷完善，大量由實驗獲得的柔性數據不斷湧現，其中包括B-因子，構象變化，無序區域，序參數，化學位移，保護因子等，清楚地解釋這批柔性數據的生物學機制還需很長的路要走，不需要實驗而成本較低的一種途徑是從蛋白質序列或結構出發，利用機器學習方法來預測蛋白質的柔性。雖然已有不少研究者關注於蛋白質的柔性預測，但目前預測的精度還普遍較低，並且還未有學者對這些柔性度量進行過系統的預測和分析。.本項目將立足於利用機器學習方法預測蛋白質的柔性度量，通過新特徵設計與特徵選擇，提高預測精度，並嘗試系統分析各柔性度量之間的關係。另外還將利用機器學習方法開發出基於序列的高斯網路模型，以及建立膜蛋白的柔性預測模型。蛋白質柔性的精確預測可以為進一步的結構預測和功能與藥物設計提供可靠的理論基礎。
