簡介 生物晶片(biochip或bioarray)是根據生物分子間特異相互作用的原理,將生化分析過程集成於晶片表面,從而實現對DNA、RNA、多肽、蛋白質以及其他生物成分的高通量快速檢測。狹義的生物晶片概念是指通過不同方法將生物分子(
寡核苷酸 、cDNA、genomic DNA、多肽、抗體、抗原等)固著於矽片、玻璃片(珠)、塑膠片(珠)、凝膠、尼龍膜等固相遞質上形成的生物分子點陣。因此生物晶片技術又稱微陳列(microarray)技術,含有大量生物信息的固相基質稱為
微陣列 ,又稱生物晶片。生物晶片在此類晶片的基礎上又發展出微
流體 晶片(microfluidics chip),亦稱微電子晶片(microelectronic chip),也就是縮微實驗室晶片。
什麼是生物晶片呢?簡單說,生物晶片就是在一塊玻璃片、矽片、尼龍膜等材料上放上生物樣品,然後由一種儀器收集信號,用
計算機 分析數據結果。人們可能很容易把生物晶片與電子晶片聯繫起來。事實上,兩者確有一個最基本的共同點:在微小尺寸上具有海量的數據信息。但它們是完全不同的兩種東西,電子晶片上布列的是一個個半導體電子單元,而生物晶片上布列的是一個個生物探針分子。
像花布一樣五彩斑斕的生物晶片 晶片的概念取之於集成的概念,如電子晶片的意思就是把大的東西變成小的東西,集成在一起。生物晶片也是集成,不過是
生物材料 的集成。像實驗室檢測一樣,在生物晶片上檢查血糖、蛋白、酶活性等,是基於同樣的
生物反應 原理。所以生物晶片就是一個載體平台。這個平台的材料則有很多種,如矽,玻璃,膜(
纖維素 膜)等,還有一些三維結構的多聚體,平台上則密密麻麻地擺滿了各種生物材料。晶片只是一個載體。做什麼東西、檢測什麼,還是靠
生物學家 來完成。也就是說,原來要在很大的實驗室中需要很多個試管的反應,現在被移至一張晶片上同時發生了。
世界發展 進入21世紀,隨著生物技術的迅速發展,
電子技術 和
生物技術 相結合誕生了
半導體晶片 的兄弟——生物晶片,這將給我們的生活帶來一場深刻的革命。這場革命對於全世界的可持續發展都會起到不可估量的貢獻。
生物晶片技術的發展最初得益於
埃德溫·邁勒·薩瑟恩 (Edwin Mellor Southern)提出的
核酸雜交 理論,即標記的核酸分子能夠與被固化的與之互補配對的核酸分子雜交。從這一角度而言,
Southern雜交 可以被看作是生物晶片的雛形。
弗雷德里克·桑格 (Fred Sanger)和
吉爾伯特 (Walter Gilbert)發明了現在廣泛使用的
DNA測序 方法,並由此在1980年獲得了
諾貝爾獎 。另一個諾貝爾獎獲得者卡里·穆利斯(Kary Mullis)在1983年首先發明了
PCR ,以及後來在此基礎上的一系列研究使得微量的DNA可以放大,並能用實驗方法進行檢測。
Fred Sanger Walter Gilbert Kary Mullis 生物晶片這一名詞最早是在二十世紀八十年代初提出的,當時主要指分子電子器件。它是
生命科學 領域中迅速發展起來的一項
高新技術 ,主要是指通過微加工技術和
微電子 技術在固格體晶片表面構建的微型
生物化學 分析系統,以實現對細胞、蛋白質、DNA以及其他生物組分的準確、快速、大信息量的檢測。美國海軍實驗室研究員
卡特 (Carter) 等試圖把有機功能分子或
生物活性 分子進行組裝,想構建微功能單元,實現信息的獲取、貯存、處理和傳輸等功能。用以研製
仿生 信息處理系統和
生物計算機 ,從而產生了"分子電子學",同時取得了一些重要進展:如
分子開關 、分子貯存器、分子導線和分子
神經元 等分子器件,更引起科學界關注的是建立了基於DNA或蛋白質等分子計算的實驗室模型。
進入二十世紀九十年代,
人類基因組計畫 (Human Genome Project,HGP)和
分子生物學 相關學科的發展也為
基因晶片 技術的出現和發展提供了有利條件。與此同時,另一類"生物晶片"引起了人們的關注,通過
機器人 自動列印或光引導化學合成技術在矽片、玻璃、凝膠或
尼龍膜 上製造的生物分子微陣列,實現對
化合物 、蛋白質、
核酸 、
細胞 或其它生物組分準確、快速、大信息量的篩選或檢測。
●1991年Affymatrix公司福德(Fodor)組織半導體專家和分子生物學專家共同研製出利用光蝕刻光導合成多肽;
最早微陣列圖片 ●1992年運用半導體照相平板技術,對
原位合成 製備的DNA晶片作了首次報導,這是世界上第一塊基因晶片;
●1993年設計了一種寡核苷酸生物晶片;
●1994年又提出用光導合成的寡核苷酸晶片進行DNA序列快速分析;
●1996年靈活運用了照相平板印刷、計算機、半導體、雷射共聚焦掃描、寡核苷酸合成及
螢光 標記探針雜交等多學科技術創造了世界上第一塊商業化的生物晶片;
●1995年,
史丹福大學 布朗(P.Brown)實驗室發明了第一塊以玻璃為
載體 的基因微
矩陣 晶片。
●2001年,全世界生物晶片市場已達170億美元,用生物晶片進行藥理
遺傳學 和藥理
基因組學 研究所涉及的世界藥物市場每年約1800億美元;
●2000-2004年的五年內,在套用生物晶片的市場銷售達到200億美元左右。
●2005年,僅
美國 用於基因組研究的晶片銷售額即達50億美元,2010年有可能上升為400億美元,這還不包括用於疾病預防及診治及其它領域中的基因晶片,部分預計比基因組研究用量還要大上百倍。因此,基因晶片及相關產品產業將取代微電子晶片產業,成為21世紀最大的產業。
●2004年3月,
英國 著名諮詢公司弗若斯特·沙利文(Frost & Sulivan)公司出版了關於全球晶片市場的分析報告《世界DNA晶片市場的戰略分析》。報告認為,全球DNA生物晶片市場每年平均增長6.7%,2003年的市場總值是5.96億美元,2010年將達到93.7億美元。納儂市場(NanoMarkets)調研公司預測,以
納米 器械作為解決方案的醫療技術將在2009年達到13億美元,並在2012年增加到250億美元,而其中以晶片實驗室最具發展潛力,市場增長率最快。
●2012年12月,三位美國科學家獲得了美國專利與商標辦公室( US PTO)授予的一項關於量子級神經動態計算晶片專利,該晶片功能強大,能夠通過高速非標準運算模擬解決問題,將為未來量子計算領域的發展起到巨大的推動作用。該電腦晶片是生物過程和物理過程的結合,通過模仿生物系統在接口界面運用突觸神經元連線並反饋學習,有潛力賦予計算機超強的運算能力和超快的速度,可廣泛運用於軍用和民用領域,而該專利則涉及生產該電腦晶片的幾種不同途徑。
中國發展 基本情況 我國生物晶片研究始於1997-1998年間,儘管起步較晚,但是技術和產業發展迅速,實現了從無到有的階段性突破,並逐步發展壯大,生物晶片已經從技術研究和產品開發階段走向技術套用和產品銷售階段,在表達譜晶片、重大疾病診斷晶片和生物晶片的相關設備研製上取得了較大成就。2008年我國生物晶片市場約為1億美元,並正以20%以上的速度增長,至2020年生物晶片市場將達到9億美元。
從2000年開始,國家就陸續投入了大筆資金對生物晶片的系統研發給予了支持,建立了北京國家晶片工程中心、上海國家晶片工程中心、西安微檢驗工程中心、天津生物晶片公司、南京生物晶片實驗室等研發機構,為我國在這一新型高科技領域的自主創新和產業化能力奠定了堅實的基礎,由此形成了以北京、上海兩個國家工程研究中心為龍頭,天津、西安、南京、深圳、哈爾濱等地50餘家生物晶片研究機構和百餘家生物晶片企業的蓬勃發展局面,形成了“北有博奧,南有博星”的企業格局。
目前,由於技術壁壘的限制,國內生物晶片銷售利潤率都維持在較高水平,並且競爭性企業少;但是也有一些企業連續幾年處於虧損狀態,主要是由於技術商業化程度比較低或者存在困難。預計未來幾年,中國生物晶片市場盈利能力依然處在較高水平。目前,越來越多的研究機構和企業投入到生物晶片這一領域,雖然還有很多相關技術仍然制約著生物晶片技術的快速發展。
2011年6月24日,生物晶片北京國家工程研究中心煙臺分中心在毓璜頂醫院落成。這是既2007年在新疆建起第一家分中心,包括山西、寧夏、山東煙臺,已經建起四家分中心。
2011年,博奧生物生物晶片產業化道路進一步推進。其研發的全球第一張用於臨床的致聾基因檢測晶片在北京市高危人群致聾基因篩查項目中得到完美套用。北京市16個區縣20839位持證聽力殘疾者接受了耳聾基因篩查,共有2899人因檢測出攜帶致聾基因突變而初步確定或疑為遺傳性聾或藥物性聾,平均突變檢出率高達13.92%。
生物晶片將會給21世紀整個人類生活帶來一場“革命”。生物晶片行業研究小組認為,隨著我國生物晶片科技的發展,其產業化水平快速提高,雖然仍有許多技術難題制約著生物晶片技術的快速發展,但隨著投入的加大和技術水平的提高,生物晶片產業也有望與“微電子晶片”並列成為21世紀最大的產業之一。
生物晶片從上世紀90年代開始發展,一直屬於尖端科學,同樣參與了
人類基因組 的中國在這方面沒有落後,出現了不少研究生物晶片的廠商和科研機構,並在國際上有了一定的影響。
中國生物晶片研究始於1997~1998年間,在此之前生物晶片技術在中國還是空白。儘管起步較晚,但是中國生物晶片技術和產業發展迅速,實現了從無到有的階段性突破,並逐步發展壯大。截止到2006年,中國生物晶片的產值已達到2億多元,生物晶片研究已經從實驗室進入套用階段。據有關資料表明,在市場銷售方面,2004年國內市場分額為2億元,約占全球市場的2%左右。其中主要由
863計畫 支持的幾家國內企業出售的生物晶片以及提供的相關服務累計銷售收入約1.1億元人民幣,所有代理國外產品及服務總計為9000萬。
“十五”期間,國家“863”計畫重點組織實施了“
功能基因組 及生物晶片研究”重大專項,對生物晶片的系統研發給與了傾斜性支持。從2000年開始,國家還陸續投入大筆資金,建立了北京國家晶片工程中心、上海國家晶片工程中心、西安微檢驗工程中心、
天津 生物晶片公司、南京生物晶片重點實驗室共五個生物晶片研發基地,為加強中國在這一新興高科技領域的自主創新和產業化能力奠定了堅實的基礎。目前,生物晶片產業在中國已初見端倪並初具規模,形成了以
北京 、上海兩個
國家工程研究中心 為龍頭,天津、
西安 、南京、
深圳 、哈爾濱等地近50家生物晶片研發機構和30多家生物晶片企業蓬勃發展的局面。到2006年為止,中國已有500餘種生物晶片及相關產品問世,從2002到2005年累計銷售額近2.5億元,10餘個晶片或相關產品獲得了國家新藥證書、醫療器械證書或其他認證,並已實現產業化生產。
北京國家晶片工程中心辦公室
例如深圳益生堂研製的C型肝炎病毒分片段抗體檢測試劑(蛋白質片)、北京博奧公司的
微陣列晶片 掃瞄器等六種晶片及設備被
國家食品藥品監督管理局 (SFDAO)已批准註冊,獲得新藥證書或醫療器械證書。另外,被國家食品藥品監督管理局受理的有10 個。
中國 是世界上批准生物晶片進入臨床最早的國家,比美國早近3 年。
為了加強生物晶片的研發與產業化,縮短與國際上的差距,中國分別在北京和上海建立了兩個國家級的研究中心。中心現已初步形成了生物晶片技術產業化
聯合艦隊 式的企業發展格局,通過了IS09001:2000版
質量管理體系認證 ,成立基因晶片部、蛋白抗體部、產品開發部、
生物信息 部和以組織晶片為特色的上海芯超生物科技有限公司、以
基因分型 為特色的上海南方基因科技有限公司、以市場行銷為主的上海滬晶生物科技有限公司以及以專業診斷產品研發和生產的上海華冠生物晶片有限公司、
江蘇 海晶診斷科技有限公司、中美合資上海英伯肯醫學生物技術有限公司等多個為產業化依託的具有良好的自我循環能力的專業子公司。
在激烈的國際競爭中,中國生物晶片產業不僅實現了跨越式的發展,而且已經走出國門,成為世界生物晶片領域一股強大的力量。例如中國科學家自主研製的雷射共焦掃瞄器向歐美、
韓國 等地區的出口訂單已經達到百台級規模,實現了中國原創性
生命科學儀器 的首次出口,未來三年將保持更高速度的增長,這標誌著中國生物晶片企業正式邁入國際領先者行列,也使
生物晶片北京國家工程研究中心 進入國際市場的產品達到了5 種。
近年成果 近年取得的科研成果如下:
●“十五”期間,中國生物晶片研究共申請國內專利356項,國外專利62項。
●2005年4月,由科技部組織實施的
國家重大科技專項 “功能基因組和生物晶片”在生物晶片產業取得階段成果,診斷檢測晶片產品、高密度基因晶片產品、食品安全檢測晶片、擁有
自主智慧財產權 的生物晶片創新技術創建等一系列成果蜂擁而出。
●2005年,由“
長江學者 特聘教授”、南開大學
王磊 博士任首席科學家的國家“863”專項—“重要病原
微生物 檢測生物晶片”課題組經過兩年的潛心科研攻關,取得重大成果,“重要致病菌檢測晶片”第一代樣品研製成功,並且開始制定企業和產品的質量標準,這標誌著中國第一個具有世界水平的微生物晶片研究進入產業化階段,從而使
天津市 建設世界級微生物檢測生物晶片研發和產業化基地,搶占全球生物晶片研發制高點邁出歷史性的一步。
●2005年4月26日,中國生物晶片產業的骨幹企業北京博奧生物晶片有限責任公司(生物晶片北京國家工程研究中心)和美國昂飛公司(Affymetrix)建立
戰略合作關係 ,並共同簽訂了《生物晶片相關產品的共同研發協定》和《DNA晶片服務平台協定》兩個重要的全面合作協定,對於中國生物晶片產業來說這是一個歷史的時刻,也標誌著以博奧生物為代表的中國生物晶片企業已在全球競爭日益激烈的生物晶片產業中躋身領跑者的地位。
●2006年,生物晶片北京國家工程研究中心又成功研製了一種利用生物晶片對
骨髓 進行分析處理的技術,這在全球尚屬首次,可以大大提高骨髓分型的速度和準確度。這種用於骨髓分型的生物晶片,只有手指大小,僅一張就可以存儲上萬個人的白細胞
抗原 基因。過去在中國,這種技術長期依賴進口,價格很高。每進行一份骨髓分型,就要支付500元的費用,而這種晶片的造價只是國外的1/3,
精密度 可以超過99%,比國外高出好幾個百分點。
●2006年7月,
中國科學院力學研究所 國家微重力實驗室靳剛課題組在中科院知識創新工程和
國家自然科學基金 的資助下,主持研究的“蛋白質晶片
生物感測器 系統”實現實驗室樣機,目前已實現
B肝 五項指標同時檢測、
腫瘤 標誌物檢測、微量抗原抗體檢測、
SARS 抗體藥物鑑定、病毒檢測及
急性心肌梗死 診斷標誌物檢測等多項套用實驗。全程只需40分鐘,採血只需幾十微升血液。該項研究成果有望為中國的生物晶片技術開闢新的途徑。
●2006年,由東北大學
方肇倫 院士領銜國內10家高校、科研單位共同打造的晶片實驗室“微流控生物化學分析系統”通過驗收,該項研究成果將使中國醫療臨床化驗發生革命性變革,徹底改變了中國在微流控分析領域的落後面貌。
●2006年,
第四軍醫大學 預防醫學系郭國禎採用輻射
生物學 效應原理,套用Mpmbe軟體設計探針篩選參與輻射生物學效應基因,成功研製出一款由143個基因組成的電離輻射相關低密度寡核苷酸基因晶片,該晶片為檢測不同輻射敏感性腫瘤細胞的
差異表達 基因提供了一個新的
技術平台 。
●2006年03月
西安交通大學 第二醫院檢驗科何謙博士等成功研發出
C型肝炎病毒 (HCV)不同片段
抗體 蛋白晶片檢測新技術。該技術的問世,為C型肝炎患者的確診、獻血人員的篩選及治療藥物的研發等,提供了先進的檢測手段。
●此外,
美國史丹福大學 華裔科學家王善祥及其研究團隊利用磁納米技術有望取代通常採用的螢光探測癌蛋白技術,更快更方便地獲得檢測結果;中國台北榮民總醫院和賽亞基因科技共同研發生物晶片,可快速找出遺傳疾病的異常基因,將可成為家族篩檢的利器。
存在問題 對於中國生物晶片工業來講。關鍵問題有3個:
(1)製作技術:晶片製作技術原理並不複雜,就製作涉及的每項技術而言,中國已具有實際能力,中國發展生物晶片的難點是如何實現各種相關技術的整合集成。
(2)基因、蛋白質等前沿研究:除去製作技術外,關鍵就是晶片上放置的基因和蛋白質等物質了。如果製作用於檢測
核苷酸 多態性以診斷某種
遺傳病 ,或者用於基因測序,那么晶片探針上一般放置的是有8個鹼基的寡核苷酸片段,基因晶片和蛋白質晶片則相應放置的是基因標誌性片段
EST (
表達序列標籤 )、全長基因或蛋白質。因此製作生物晶片首先要解決的是DNA探針、基因以及蛋白質的儘可能全面和快速地收集問題。
(3)專利和產權:以生物晶片技術為核心的各相關產業正在全球崛起,一個不容忽視的問題就是專利和產權的問題。專家指出世界工業已開發國家已開始有計畫、大投入、爭先恐後地對該領域智慧財產權進行
跑馬圈地 式的保護。北京國家工程研究中心主任
程京 教授說:“就生物晶片領域而言,目前全世界都在‘跑馬圈地’,專利和自主產權比什麼都重要。我們不能再像計算機晶片那樣受制於人。”現在,
科學家 、企業家和金融界已經聯起手來,組成了結構上更為合理、運作上更具可操作性的商業運行構架,通過全球定位布局,建立產權結構清晰的公司.為生物晶片在中國的產業化奠定良好基礎。
分類 生物晶片雖然只有10多年的歷史,但包含的種類較多,分類方式和種類也沒有完全的統一。
用途分類 (1)生物電子晶片:用於生物計算機等生物電子產品的製造。
(2)生物分析晶片:用於各種
生物大分子 、細胞、組織的操作以及生物化學反應的檢測。
前一類目前在技術和套用上很不成熟,一般情況下所指的生物晶片主要為生物分析晶片。
作用方式分類 (1)主動式晶片:是指把生物實驗中的樣本處理純化、反應標記及檢測等多個實驗步驟集成,通過一步反應就可主動完成。其特點是快速、操作簡單,因此有人又將它稱為功能生物晶片。主要包括微流體晶片(microftuidic chip)和
縮微晶片 實驗室(lab on chip,也叫“晶片實驗室”,是生物晶片技術的高境界)。
(2)被動式晶片:即各種微陣列晶片,是指把生物實驗中的多個實驗集成,但操作步驟不變。其特點是高度的並行性,目前的大部分晶片屬於此類。由於這類晶片主要是獲得大量的生物大分子信息,最終通過
生物信息學 進行
數據挖掘 分析,因此這類晶片又稱為信息生物晶片。包括基因晶片、
蛋白晶片 、細胞晶片和組織晶片。
成分分類 (1)基因晶片(gene chip):又稱DNA晶片(DNA chip)或
DNA微陣列 (DNA microarray),是將cDNA或寡核苷酸按微陣列方式固定在微型載體上製成。
(2)
蛋白質晶片 (protein chip或protein microarray):是將蛋白質或抗原等一些非核酸生命物質按微陣列方式固定在微型載體上獲得。晶片上的探針構成為蛋白質或晶片作用對象為蛋白質者統稱為蛋白質晶片。
(3)
細胞晶片 (cell chip):是將細胞按照特定的方式固定在載體上,用來檢測細胞間相互影響或相互作用。
(4)組織晶片(tissue chip):是將組織切片等按照特定的方式固定在載體上,用來進行
免疫組織化學 等組織內成分差異研究。
(5)其他:如
晶片實驗室 (Lab on chip),用於生命物質的分離、檢測的微型化晶片。現在,已經有不少的研究人員試圖將整個生化檢測分析過程縮微到晶片上,形成所謂的“晶片實驗室”(Lab on chip)。晶片實驗室是生物晶片技術發展的最終目標。它將
樣品 的製備、生化反應到檢測分析的整個過程集約化形成微型分析系統。由加熱器、微泵、微閥、微流量控制器、
微電極 、電子化學和電子發光探測器等組成的晶片實驗室已經問世,並出現了將生化反應、
樣品 製備、檢測和分析等部分集成的晶片)。“晶片實驗室”可以完成諸如
樣品 製備、試劑輸送、
生化反應 、結果檢測、信息處理和傳遞等一系列複雜工作。這些微型集成化分析系統攜帶方便,可用於緊急場合、野外操作甚至放在太空飛行器上。例如可以將
樣品 的製備和PCR擴增反應同時完成於一塊小小的晶片之上。再如Gene Logic公司設計製造的生物晶片可以從待檢
樣品 中分離出DNA或RNA,並對其進行螢光標記,然後當樣品流過固定於柵欄狀微通道內的寡核苷酸探針時便可捕獲與之互補的靶核酸序列。套用其自己開發的檢測設備即可實現對
雜交 結果的檢測與分析。這種晶片由於寡核苷酸探針具有較大的吸附
表面積 ,所以可以靈敏地檢測到稀有基因的變化。同時,由於該
晶片設計 的微通道具有濃縮和富集作用,所以可以加速
雜交 反應,縮短測試時間,從而降低了測試成本。
晶片實驗室 主要特點 高通量 提高實驗進程,利於顯示圖譜的快速對照和閱讀
微型化 減少試劑用量和反應液體積,提高樣品濃度和反應速度
自動化 減低成本和保證質量
製備 載體材料及要求 作為載體必須是固體片狀或者膜、表面帶有活性基因,以便於連線並有效固定各種生物分子。目前製備晶片的固相材料有
玻片 、矽片、金屬片、尼龍膜等。目前較為常用的支持材料是玻片,因為玻片適合多種合成方法,而且在製備晶片前對玻片的預處理也相對簡單易行。
載體種類 玻璃片、
PVDF 膜、聚丙烯醯氨凝膠、聚苯乙烯微珠、磁性微珠。
點樣機 生物樣品的製備 分離純化、壙增、獲取其中的蛋白質或DNA、RNA並用螢光標記, 才能與晶片進行反應。用DNA晶片做表達譜研究時,通常是將樣品先抽提M
RNA ,然後反轉錄成C
DNA 。同時摻入帶螢光標記的dCTP或dUTP。
晶片製備方法 包括原位合成和預合成後點樣。
原位合成:適用於寡核苷酸,通過光引導蝕刻技術。已有P53、P450,BRCAI/BRCA2 等
基因突變 的基因晶片。
預合成後點樣:是將提取或合成好的多肽、蛋白、寡核苷酸、cDNA、
基因組 DAN等通過特定的高速點樣機器人直接點在晶片上。該技術優點在於相對簡易低廉,被國內外廣泛使用。
接觸式點樣:是指列印針從多孔板取出樣品後直接列印在晶片上。列印時針頭與晶片接觸。優點是探針密度高,通常一平方厘米可列印2500個探針。缺點是定量準確性及重現性不太好。
非接觸式點樣:針頭與晶片保持一定距離。優點是定量準確重現性好,缺點是噴印的斑點大,密度低。通常一平方厘米只有400點。但是
日本 佳能公司能把噴印點直徑大小由150-100μm降到30-25μm。可將
哺乳動物 整個基因組DNA點陣於一張晶片上成為可能。
使用壽命 按照美國生物晶片製備標準,使用
壽命 約為10-15年。
套用領域 最大用途在於疾病檢測
基因表達水平的檢測 用基因晶片進行的表達水平檢測可自動、快速地檢測出成千上萬個基因的表達情況。謝納(M.Schena) 等用人外周血
淋巴細胞 的cDNA
文庫 構建一個代表1046個基因的cDNA微陣列,來檢測
體外培養 的
T細胞 對熱休克反應後不同
基因表達 的差異,發現有5個基因在處理後存在非常明顯的高表達,11個基因中度表達增加和6個基因表達明顯抑制。該結果還用
螢光素 交換標記對照和處理組及RNA
印跡 方法證實。在HGP完成之後,用於檢測在不同生理、
病理 條件下的人類所有基因表達變化的基因組晶片為期不遠了。
基因診斷 從正常人的基因組中分離出DNA與DNA晶片雜交就可以得出標準圖譜。從病人的基因組中分離出DNA與DNA晶片雜交就可以得出病變圖譜。通過比較、分析這兩種圖譜,就可以得出病變的DNA信息。這種基因晶片診斷技術以其快速、高效、敏感、經濟、平行化、自動化等特點,將成為一項現代化診斷新技術。例如Affymetrix公司,把
p53基因 全長序列和已知突變的探針集成在晶片上,製成p53基因晶片,將在
癌症 早期診斷中發揮作用。又如,Heller等構建了96個基因的cDNA微陣,用於檢測分析
風濕性關節炎 (RA)相關的基因,以探討DNA晶片在感染性疾病診斷方面的套用。
藥物篩選 利用基因晶片分析用藥前後機體的不同組織、器官基因表達的差異。如果再cDNA
表達文庫 得到的肽庫製作肽晶片,則可以從眾多的藥物成分中篩選到起作用的部分物質。還有,利用RNA、單鏈DNA有很大的柔性,能形成複雜的
空間結構 ,更有利與靶分子相結合,可將核酸庫中的RNA或單鏈DNA固定在晶片上,然後與靶蛋白孵育,形成蛋白質-RNA或蛋白質-DNA複合物,可以篩選特異的藥物蛋白或核酸,因此晶片技術和RNA庫的結合在
藥物篩選 中將得到廣泛套用。在尋找
HIV 藥物中,Jellis等用
組合化學 合成及DNA晶片技術篩選了654536種硫代磷酸八聚核苷酸,並從中確定了具有XXG4XX樣結構的抑制物,實驗表明,這種篩選物對HIV感染細胞有明顯阻斷作用。生物晶片技術使得藥物篩選,靶基因鑑別和新藥測試的速度大大提高,成本大大降低。
個體化醫療 臨床上,同樣藥物的劑量對病人甲有效可能對病人乙不起作用,而對病人丙則可能有副作用。在藥物療效與副作用方面,病人的反應差異很大。這主要是由於病人遺傳學上存在差異(
單核苷酸多態性 ,SNP),導致對藥物產生不同的反應。如果利用基因晶片技術對患者先進行診斷,再開處方,就可對病人實施個體最佳化治療。另一方面,在治療中,很多同種疾病的具體病因是因人而異的,用藥也應因人而異。例如B肝有較多亞型,HBV基因的多個位點如S、P及
C基因 區易發生
變異 。若用B肝
病毒 基因多態性 檢測晶片每隔一段時間就檢測一次,這對指導用藥防止B肝病毒耐藥性很有意義。
測序
基因晶片利用固定探針與樣品進行分子雜交產生的雜交圖譜而排列出待測樣品的序列,這種測定方法快速而具有十分誘人的前景。研究人員用含135000個
寡核苷酸 探針的陣列測定了全長為16.6kb的人
線粒體 基因組序列,準確率達99%。用含有48000個
寡核苷酸 的高密度微陣列分析了黑猩猩和人BRCA1基因序列差異,結果發現在
外顯子 約3.4kb長度範圍內的核酸序列
同源性 在98.2%到83.5%之間,提示了二者在進化上的高度相似性。
生物信息學研究 人類
基因組計畫 是人類為了認識自己而進行的一項偉大而影響深遠的研究計畫。目前的問題是面對大量的基因或基因片斷序列如何研究其功能,只有知道其功能才能真正體現HGP計畫的價值--破譯人類基因這部天書。
後基因組計畫 、
蛋白組 計畫、疾病基因組計畫等概念就是為實現這一目標而提出的。生物信息學將在其中扮演至關重要的角色。生物晶片技術就是為實現這一環節而建立的,使對個體生物信息進行高速、並行採集和分析成為可能,必將成為未來生物信息學研究中的一個重要
信息採集 和處理平台,成為
基因組信息學 研究的主要
技術支撐 。生物晶片作為生物信息學的主要技術支撐和操作平台,其廣闊的發展空間就不言而喻。
在實際套用方面,生物晶片技術可廣泛套用於疾病診斷和治療、藥物
基因組圖譜 、藥物篩選、中藥
物種 鑑定、農作物的優育優選、
司法鑑定 、食品衛生監督、環境檢測、國防等許多領域。它將為人類認識
生命的起源 、
遺傳 、發育與進化、為人類疾病的診斷、治療和防治開闢全新的途徑,為生物大分子的全新設計和藥物開發中
先導化合物 的快速篩選和
藥物基因組學 研究提供技術支撐平台,這從中國99年3月國家科學技術部剛起草的《醫藥生物技術“十五”及2015年規劃》中便可見一斑:規劃所列十五個關鍵技術項目中,就有八個項目(基因組學技術、重大疾病相關基因的分離和功能研究、
基因藥物 工程、
基因治療 技術、生物信息學技術、
組合生物合成 技術、新型診斷技術、
蛋白質組學 和生物晶片技術)要使用生物晶片。生物晶片技術被單列作為一個專門項目進行規劃。總之,生物晶片技術在醫學、生命科學、藥業、
農業 、環境科學等凡與
生命活動 有關的領域中均具有重大的套用前景。
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