肝癌相關環狀RNA鑑定及其作用機制研究

《肝癌相關環狀RNA鑑定及其作用機制研究》是依託復旦大學，由黃勝林擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：肝癌相關環狀RNA鑑定及其作用機制研究
• 依託單位：復旦大學
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：黃勝林

項目摘要

環狀RNA(Circular RNA, circRNA)是一類非線性，自身成環的RNA分子，最近研究發現它大量存在於人類細胞中。作為一類新的調控性非編碼RNA，環狀RNA在腫瘤中的存在情況，臨床意義，功能和作用機制都還不清楚。本研究前期工作採用高通量RNA測序，結合生物信息分析，鑑定並篩選出肝癌組織中差異表達的環狀RNA，發現肝癌組織中存在著不少具有一定豐度的差異表達環狀RNA；進一步，通過特異siRNA對這些肝癌相關的環狀RNA進行初步的功能篩選，發現有部分的環狀RNA在肝癌細胞中具有一定的生物學功能。本項目將在前期工作基礎上，進一步研究這些肝癌相關環狀RNA的臨床意義，以及它們在肝癌發生髮展過程中所起的功能和作用機制，這些將為肝癌的發病機制提供新的思路，以及肝癌的診療提供新的候選靶點。

結題摘要

環狀RNA(Circular RNA, circRNA)作為一類新的調控性非編碼RNA，在腫瘤中的存在情況，臨床意義，功能和作用機制有待。本項目首次解析環狀RNA在腫瘤中的存在情況和表達規律，發現一類高豐度高反式剪下的環狀RNA，鑑定並闡明了一個高豐度環狀RNA circHIPK3的功能和分子機制（Nature Communications,2016）；發現環狀RNA circPVT1可靶向miR-125家族調控癌細胞的增殖，可作為癌症的獨立預後因子（Cancer Letters, 2017），為研究癌症發病機制提供了新的思路和靶點。此外，還發現外泌體富集大量的環狀RNA，揭示了細胞內環狀RNA的新去向，並發現腫瘤來源的外泌體環狀RNA可釋放並穩定存在於血液中，作為潛在的腫瘤診斷標記物（Cell Research，2015），進一步構建首個人類血液外泌體長鏈RNA資料庫exoRBase（Nucleic Acids Research, 2018），為腫瘤液體活檢提供全新思路和重要基礎。 由於在環狀RNA研究領域取得的成果被認可, 受邀在RNA Biology發表關於人類環狀RNA潛在功能和意義的綜述（RNA Biology, 2017），以及Cancer Letters發表關於環狀RNA在腫瘤中的研究進展（Cancer Letters, 2018）。本課題資助的文章共7篇（5篇第一標註，2篇第二標註），其中論著5篇，受邀綜述2篇，總影響因子65，被引用677次。