《MicroRNA及其作用靶點多態與肝癌發病風險及預後的研究》是依託復旦大學，由蔣德科擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：MicroRNA及其作用靶點多態與肝癌發病風險及預後的研究
- 依託單位：復旦大學
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：蔣德科
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
肝癌是全世界最高發的惡性腫瘤之一，全世界半數以上的肝癌病人集中在中國。因為尚缺乏有效的臨床和分子診斷標記，肝癌很難早期發現，而且預後非常差。因此，迫切需要鑑定出肝癌患病風險及預後相關的遺傳位點。研究表明，microRNA及其作用靶點的遺傳變異影響癌症的發生和預後。本項目將利用生物信息學方法篩選出所有位於microRNA中以及肝癌相關基因3′UTRs可能的microRNA結合區域內的多態位點；通過兩步病例-對照研究在大規模肝癌與正常對照人群中對篩選的多態位點進行基因分型及統計分析，找出等位基因頻率分布在病例組和對照組存在顯著差異的多態位點以及與肝癌病人生存期顯著相關的多態位點；最後通過生物信息學方法預測、雙螢光素酶報告基因實驗以及實時定量 PCR檢測基因表達水平等實驗對多態位點的作用進行驗證及功能分析，以期了解候選基因位點在肝癌發病風險及預後中的分子作用機制以及為肝癌的診斷及治療奠定基礎。
結題摘要
本項目的主要目的是鑑定出位於microRNA 及其作用靶點區域中與肝癌患病風險以及預後相關的遺傳位點。我們基本上按照原計畫所擬定的研究方案進行，同時充分利用本研究團隊開展的肝癌GWAS課題所積累的豐富資源，最終順利完成了本研究項目，取得了可喜的研究成果。 我們首先跟蹤查閱了國際上關於MicroRNA相關SNP與癌症發病風險相關性的研究進展，並且針對其中5個研究最為廣泛的MicroRNA相關SNP進行了meta分析，獲得最新的研究背景，也借鑑了別人的研究經驗。相關的研究結果於2013年發表在Plos One雜誌，本項目負責人為通訊作者。 在本項目開展之初，本課題組開展的肝癌GWAS研究圓滿完成，相關研究成果於2013年發表在Nature Genetics 雜誌，本項目負責人為第一作者。該肝癌GWAS研究課題的完成，為本項目奠定了非常堅實的基礎，包括積累了大量的基因分型數據和研究樣本。我們通過與microRNA的相關資料庫進行比對分析，發現在肝癌GWAS分析的SNP位點中，有556個位於人類MicroRNA序列，有90357個位於人類MicroRNA作用靶點區域內。 我們通過兩階段、五個獨立人群樣本、超過4000對肝癌和對照樣本的分析，從以上9萬多個候選SNP位點中，成功篩選到位於SLC7A6基因3’UTR區域hsa-miR-548d-3p靶點中的rs11350為肝癌易感基因位點（加性模型：P＝2.09E-07；顯性模型：P＝1.82E-07）。並通過通過生物信息學方法預測、雙螢光素酶報告基因實驗以及實時定量 PCR 檢測基因在肝癌及癌旁組織中的表達水平等實驗，揭示了rs11350¬－C等位基因能夠影響miR-548d-3p對SLC7A6基因表達的有效抑制，相應地增加了rs11350－C等位基因所對應的SLC7A6基因在肝臟組織中的表達水平。 我們在362例肝癌手術樣本中，對53個位於MicroRNA成熟序列中的SNP位點，分析其與肝癌預後的關係。成功鑑定了miR-608 rs4919510為肝癌預後相關的遺傳多態位點。我們發現rs4919510與肝癌病人的生存期顯著關聯，不論是單因素分析（P＝0.013），還是多因素分析（P＝0.021）。 這一項目的順利完成及其產生的研究成果，為揭示肝癌發生髮展的分子機制提供了新的線索，也為肝癌的預警、預後提供了新的分子標誌物。
