《蛋白質摺疊機理的研究》是依託北京工業大學，由王存新擔任項目負責人的面上項目。
《蛋白質摺疊機理的研究》是依託北京工業大學，由王存新擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 用基於殘基的非格點模型與全原子模型，模擬真實蛋白質的摺疊和去摺疊過程。在殘基和原子的水平上研究具體蛋白質摺疊的物理機制，描述其在摺疊自由...
《蛋白質錯誤摺疊機理及其電化學特性研究》是依託南京師範大學，由蔡稱心擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質錯誤摺疊是指蛋白質的空間結構發生某些異常的變化，從而引起蛋白質許多性質的改變，甚至某些疾病的發生。本項目的主要研究...
摺疊密碼又稱第二遺傳密碼，即指胺基酸順序與蛋白質三維結構之間存在的對應關係。基本信息 蛋白質工程領域將研究蛋白質摺疊的過程定義為破譯“第二遺傳密碼”——摺疊密碼（foldingcode）的過程。蛋白質的基本單位為胺基酸，而蛋白質的一級...
《蛋白質結合-摺疊的理論研究》是依託吉林大學，由汪勁擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質摺疊決定三維結構的形成，而蛋白質結合決定分子水平的相互作用和功能。通常人們單獨地研究蛋白質的摺疊和結合。然而，越來越多的實驗證據表明...
蛋白質摺疊規律的研究是生命科學重大前沿課題。本課題擬構建蛋白質摺疊類型資料庫，研究蛋白質摺疊的經驗規律。研究內容包括：1、蛋白質摺疊類型信息資料庫的建立，定義規範摺疊分類的量化指標。從PDB、SCOP等資料庫出發，在已有研究工作基礎...
蛋白質摺疊是生物學的基本問題，但相關理論模型主要基於對可在胞外自發摺疊的、小尺寸模式蛋白的研究。C-反應蛋白（C-reactive protein, CRP）是一種典型的人類急性期因子，由五個分子量為23 kDa的相同亞基通過非共價相互作用組裝而成，...
《用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究》是依託清華大學，由孫之榮擔任項目負責人的專項基金項目。項目摘要 本項目研究主要套用各種理論物理和數理方法，總結蛋白質各個不同層次的結構規律。重點集中蛋白質結構類、結構子類、超二級結構MOTIF等...
《基於微流控晶片的蛋白質摺疊超快動力學新方法研究》是依託華中科技大學，由徐友志擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 生物大分子的功能取決於分子結構，而如何形成活性三維結構，即生物大分子摺疊動力學過程，是科學界長久以來備受關注的...
分析其摺疊過程熱力學和動力學特徵，探索影響蛋白質摺疊的主要因素，進而歸納總結摺疊過程的物理機制和圖象，研究序列組成與摺疊結構之間的內在聯繫。通過這樣的研究實現對蛋白質摺疊過程的基本物理內容的理解和認識。
本項目以重要的肌肉蛋白Titin和細胞骨架蛋白Filamin A為研究對象，利用磁鑷單分子操縱技術來研究在生理條件拉力作用下蛋白質摺疊與去摺疊的性質，這類研究是目前絕大部分實驗技術所不能實現的。本項目的主要研究目標和內容包括：（1）研究...
申請人在對稱蛋白質序列與結構關係方面有系統的研究，本項目擬在此基礎上通過新生肽鏈摺疊和局部肽鏈摺疊方式的研究，模擬對稱蛋白質的摺疊過程，希望在模擬較大蛋白質摺疊過程和揭示摺疊物理機制方面取得進展。結題摘要 本項目的研究重點一...
近年來的實驗證據表明，這些疾病與誤摺疊蛋白質的積聚體在神經元或其它細胞表面沉積直接相關。儘管已研究多年，但人們對誤摺疊蛋白質的積聚機理和積聚細胞毒性等問題仍沒弄清。本項目擬藉助分子動力學模擬，從分子水平研究四種既具代表性，...
本研究還將採用不同的蛋白質樣品，考察蛋白質分子內二硫鍵、疏水性以及其摺疊中間態對蛋白質摺疊行為的影響，從蛋白質結構的角度加深對表面活性劑介導摺疊過程的認識。本研究最後將套用電場刺激回響性高分子來合成新型分離介質，用於解離...
進一步發展新的複雜網路分析方法。總結建立與網路構建、網路分析、網路特徵量提取等有關的計算機模擬程式。本研究屬於物理學與生物學的交叉領域，重點從蛋白質摺疊網路的研究為切入點，為蛋白質摺疊機理和結構-功能關係的研究提供理論基礎。
針對若干典型的蛋白質體系，結合凝聚態統計物理中最新的構象空間採樣方法和手段，利用全原子及簡化模型的分子動力學模擬，研究蛋白質摺疊動力學，研究自由能面的複雜性及來源等,加深對蛋白質摺疊問題的認識。具體內容包括：利用REMD構象空間...
傳統的基於巨觀層面上的實驗研究極大地豐富了我們對蛋白質摺疊機理的認識。單分子實驗方法的可以進一步對一些特殊摺疊行為如下山式摺疊、天然態中的不同構象微態的存在、誤摺疊和輔助因子介導的摺疊和結合的協同等的機理研究提供獨特的視角。...
《蛋白質摺疊構造的新化學探針研究》是依託吉林大學，由王宗睦擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 設計、合成了具有EDTA基團或1，3-丙二胺四乙酸基團的探針共6種。部分探針的合成採用了“預製塊連結”戰略，簡化了步驟，提高了總收率...
建立蛋白質摺疊過程的基本圖象，研究蛋白質摺疊的物理機制．從殘基間的相互作用入手，利用種類簡化方法，表征和刻畫蛋白質系統的複雜性，並研究其摺疊結構與序列之間的關係．這些基於物理機制的研究對於認識蛋白質摺疊過程和簡化表征蛋白質具有...
由此可見蛋白質的復性或重摺疊是一個十分複雜的過程，而它又是套用生化工程技術的關鍵，所以有許多學者對多肽鏈是如何摺疊形成具有生物活性蛋白質的過程進行了艱苦的研究。【重摺疊途徑】蛋白質摺疊的熱力學和動力學控制用熱力學和動力學...
從胺基酸之間的相互作用勢方面對序列複雜性進行約化，結合能量面的路徑描述進行摺疊動力學研究。研究膜蛋白及其相關係統的輸運過程物理機制。這些研究對蛋白質序列和結構之關係與蛋白質設計具有重大意義。
理論計算表明：由天然態多構象貢獻穩定自由能30kJ/mol。本項目用NMR方法測量Ssh10b中可滴定殘基pKa值，研究蛋白質天然態多構象對摺疊自由能貢獻，並通過實驗測定P18A和P62A突變體摺疊自由能，證實理論計算蛋白質天然態構象熵的可靠性。
按蛋白質摺疊的要求，設計併合成出一系列具有不同疏水、親水和功能基團，具有不同鏈構造的水溶性和兩親性高分子。研究這些合成高分子與蛋白質分子的絡合作用。探索蛋白質分子在合成高分子提供的微環境中的變形、復性機理、復性過程的驅動...
對設計序列是否可摺疊只能逐條檢驗，成本高，效率低，有限的實驗結果很難提示如何改進理論方法。本課題主要研究對序列可摺疊性進行檢測的高效實驗方法：擬採用基於Split β-內醯胺酶將蛋白質摺疊穩定性與宿主的抗藥性關聯的系統，將其套用於...
《蛋白質摺疊中最佳化問題的研究》是依託清華大學，由黃紅選擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質摺疊中分子結構預測問題在數學上可以轉化為非凸函式極小化問題，該項目研究基於多變數部分和多層最佳化的非凸函式極小化算法，以及...
同時，將該模型整合到經典的分子動力學，並利用凝聚態統計物理學最新發展的高效率構象採樣技術，進行大規模並行計算，用物理的方法來研究輔助因子調控的蛋白質摺疊、聚集及功能運動。從原子層次探索輔助因子調控蛋白質結構與動力學的分子機制...
