《蛋白質序列分析、結構預測和摺疊動力學及其相關問題》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的重大研究計畫。
基本介紹
- 中文名:蛋白質序列分析、結構預測和摺疊動力學及其相關問題
- 項目類別:重大研究計畫
- 項目負責人:王煒
- 依託單位:南京大學
- 批准號:90103031
- 申請代碼:A2014
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2002-01-01 至 2004-12-31
- 支持經費:67.5(萬元)
《蛋白質序列分析、結構預測和摺疊動力學及其相關問題》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的重大研究計畫。
《蛋白質序列分析、結構預測和摺疊動力學及其相關問題》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的重大研究計畫。項目摘要對蛋白質資料庫的胺基酸序列進行統計分析,發展序列與結構之間的理論分析方法,研究序列與結構之關係並建立結構計算...
從一級序列預測蛋白質分子的三級結構並進一步預測其功能,是極富挑戰性的工作。研究蛋白質摺疊,尤其是摺疊早期過程,即新生肽段的摺疊過程是全面的最終闡明中心法則的一個根本問題,在這一領域中,近年來的新發現對新生肽段能夠自發進行...
摺疊動力學(folding kinetics )是2018年公布的生物物理學名詞。定義 蛋白質分子從無序狀態摺疊成特定三維結構的動力學過程。即蛋白質摺疊過程中各中間體由高能態向低能態轉變的反應速率和反應機制。是分子內胺基酸殘基和外部環境共同作用的...
蛋白質的基本單位為胺基酸,而蛋白質的一級結構指的就是其胺基酸序列,蛋白質會由所含胺基酸殘基的親水性、疏水性、帶正電、帶負電……等等特性通過殘基間的相互作用而摺疊成一立體的三級結構。雖然蛋白質可在短時間中從一級結構摺疊至...
《RNA結構預測與摺疊熱力學動力學研究》是依託南京大學,由張建擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 研究目標為發展RNA 的三級結構預測方法,並利用分子模擬等手段研究RNA摺疊熱力學和動力學,和結構預測研究相互促進,以加深人們對RNA結構和...
蛋白質摺疊是生物與物理交叉研究方向的重要問題。蛋白質摺疊是生物分子自發、精密自組裝的典型代表。本項目通過基於原子力顯微鏡的單分子力譜,研究了多種有著特殊摺疊行為的蛋白在受力下的解摺疊和摺疊的物理機制,研究了含金屬離子的蛋白...
6.3 蛋白質序列分析 6.4 蛋白質資料庫 6.5 基因融合和複製 6.6 二級結構預測 6.7 基因組學與蛋白質組學 6.8 概要 6.9 問題 7 酶的動力學、結構、功能與催化作用 7.1 酶的命名 7.2 酶的輔因子 7.3 化學動力學 7....
同時針對其他複雜相互作用,發展了計算方法和分析手段,如期完成了項目構想的任務,實現了預期目標,並在原研究計畫基礎上做了重要拓展。特別是關於蛋白質在擁擠環境中的動力學研究、複雜拓撲結構的蛋白質摺疊、具有特殊結構(如:贗節、G-...
第二~四部分是對蛋白質進行結構分析,包括對蛋白質一級結構與空間結構的分析,空間結構又分為三維結構與空間形態結構兩部分內容,其中涉及一系列的信息動力學問題與其他多種不同類型的數學問題,也與生物、醫學與醫藥衛生中的一些重要問題...
1. 蛋白質結構分析 ——基礎 2. 結構、功能的設計和預測 ——基礎的套用與驗證 3. 創造和/或改造蛋白質——新蛋白質 ——終目標 基本途徑 從預期的蛋白質功能出發→設計預期的蛋白質結構→推測應有的胺基酸序列→找到相對應的核糖...
並在Blast序列比對、蛋白二級結構預測等軟體分析的基礎上,對蛋白特定區域的胺基酸殘基進行理性突變,研究不同蛋白突變體的摺疊途徑、摺疊動力學、產物結構及功能是否存在差異。相關研究旨在豐富蛋白質摺疊理論,同時為尋找不同硫素類抗菌肽...
緊密圍繞我國經濟與社會發展的重大科技問題和重大科學前沿,以蛋白質結構與功能、相互作用和動態變化的研究為重點,以蛋白質研究技術與方法創新為支撐,加強新技術新方法在蛋白質研究中的推動力;在結構生物學、蛋白質組學、蛋白質研究新...
研究。.本項目擬集中或結合智慧型計算與高斯網路模型各自的優點,設計新的特徵向量,利用多種(混合的)智慧型計算方法,從胺基酸序列或蛋白質結構出發,建立起一系列各具特色的高精度柔性預測模型,並進一步系統性地對各類柔性數據進行預測和分析。
網路理論的興起為研究蛋白質摺疊以及結構功能關係注入了全新的思路與方法。蛋白質分子可以視作以胺基酸為節點,以殘基間相互作用為邊連線而構成的複雜系統。對胺基酸網路的分子指標和彈性網路的動力學研究將增加對蛋白質拓撲學機理的了解和...
使用EM算法處理具有高斯分布的有限混合因子分析模型中的非正態誤差等相關問題。 本項目研究對解析功能蛋白質的序列、結構、功能和進化之間的關係具有重要意義,完善和豐富了針對生物大分子序列數據建模的理論和方法。
本項目基於在生物分子序列與結構關係和蛋白質摺疊問題多年研究的基礎,通過解決RNA摺疊模擬中分子力場與溶劑模型匹配和隱含水模型中金屬離子效應模擬等關鍵問題,提高RNA模擬的準確性和效率,並系統地模擬50個核苷酸左右RNA的摺疊過程,使我們...
2 3蛋白質晶體學的興起12 2 3 1蛋白質結構12 2 3 2多蘿西?霍奇金:蛋白質結構測定時代的起始12 2 3 3馬克斯?佩魯茨:蛋白質結構測定技術的成熟13 2 3 4相位問題16 2 3 5又是相位問題:核糖體結構的解析18 2 4核磁共振方法...