《蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索》是依託北京工業大學，由李曉琴擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：李曉琴
- 依託單位：北京工業大學
- 批准號：30570427
- 申請代碼：C0504
- 負責人職稱：教授
- 研究期限：2006-01-01 至 2008-12-31
- 支持經費：20（萬元）
項目摘要
蛋白質摺疊規律的研究是生命科學重大前沿課題。本課題擬構建蛋白質摺疊類型資料庫，研究蛋白質摺疊的經驗規律。研究內容包括：1、蛋白質摺疊類型信息資料庫的建立，定義規範摺疊分類的量化指標。從PDB、SCOP等資料庫出發，在已有研究工作基礎上完成上述內容。2、蛋白質摺疊類型與物種、蛋白質功能、亞細胞定位等信息的相關性研究。3、蛋白質摺疊類型與胺基酸序列關係研究，探索蛋白質摺疊的經驗規律。通過序列比對和統計分析相結合的方法，分析蛋白質摺疊的胺基酸序列特徵，尋找經驗規律，探索摺疊類型形成的物理基礎。4、構建蛋白質摺疊類型演化樹圖。結合蛋白質摺疊類型的空間結構特徵及其序列模式，綜合利用聚類等統計學方法，給出不同摺疊類型蛋白質序列的進化與摺疊類型演化之間的關係。研究結果對蛋白質設計和摺疊動力學實驗具有指導作用，並為精確的蛋白質三級結構預測、蛋白質結構與功能的關係打下基礎。
