李曉琴(北京工業大學生命科學與工程學院教授)

李曉琴(北京工業大學生命科學與工程學院教授)

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李曉琴,博士,教授。1992年畢業於內蒙古大學物理系理論物理專業,師從羅遼復教授。2003年作為引進人才調入北京工業大學生命科學與生物工程學院,2005年入選北京市教委中青年骨幹教師計畫。從1999年開始,一直從事理論生物物理及生物信息學方面的研究,在蛋白質摺疊的生物信息學方面開展了廣泛深入的研究,主持或承擔多項國家自然科學基金重大研究計畫、國家自然科學基金、省部級自然科學基金等項目。在國際、國核心心期刊上發表論文50餘篇,被SCI、EI等收錄40餘篇。

基本介紹

  • 中文名:李曉琴
  • 國籍中國
  • 民族:漢族
  • 畢業院校:內蒙古大學
  • 職業:教師
  • 出生地:內蒙古
  • 性別:女
  • 學歷:博士研究生
  • 專業:生物物理、生物醫學工程
  • 所在單位:北京工業大學生命科學與工程學院
  • 職稱:教授
研究方向,研究項目,科研成果,

研究方向

1. 生物信息學:開展蛋白質摺疊模式識別、蛋白質結構與功能關係、蛋白質結構進化、基因組序列分析等方面的研究工作。
2. 生物醫學信息學:開展與人類健康密切相關的重大疾病的信息學研究。

研究項目

1. 核酸非編碼序列信息內容分析 國家自然科學基金(1997.1-1999.12) 骨幹。
2. 蛋白質拓撲結構的識別、構建和預測 國家自然科學基金(2000.1--2002.12) 骨幹。
3. 胺基酸分類與蛋白質拓撲結構關係的研究 內蒙古大學青年基金(1998.7-2000.12) 主持。
4. mRNA序列與蛋白質結構調控關係研究 內蒙古自然科學基金(2001.1--2002.12) 主持。
5. 藥物分子與只戒榜白靶蛋白結合動力學分析軟體的設計開發凶樂寒灶 內蒙古自然科學基金拳鑽(1998.9--2000.12) 主持。
6. 從mRNA序列經肽鏈的α和β摺疊到蛋白質框架結構的艱譽蘭狼臘朵經驗規律探索 國家自然科學基金重大項目(2002.1--2004.12) 子課題主持
7. mRNA轉譯、新生肽鏈摺疊和蛋白質二級結構編碼研究 北京工業大學博士科研啟動基金 (2003.10--2005.10) 主持。
8.蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗祝糠頸規律探索 國家自然科學基金資助項目(2006.1--2008.12)(項目編號:30570427) 主持
9.蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索 北京市自然科學基金資助項目(2006.1--2007.6)(項目編號:4063035) 主持
10.北京市中青年骨幹教師項目協簽連 主持

科研成果

1.Q Wang,JL Yan,XQ Li.The Recognition of 124-Class Protein Folds: Approached by Functional Domain Composition. Computational Biology and Chemistry. 2014,48(2):71-76
2.HS Xu ,XQ Li.Identifying Coevolution Between Amino Acid Residues in Protein Families: Advances in the Improvement and Evaluation of Correlated Mutation Algorithms.Current Bioinformatics. 2013,8(2):148-160.
3.JL Yan,ZW Chen, HS Xu ,XQ Li. Protein Fold Recognition by Functional Domain Composition. Prog. Biochem. Biophys. 2011,38(2):166-172
4.Hai Song Xu, Wen Ke Ren, Xiao Hui Liu and Xiao Qin Li .Aligning protein sequence and analyzing substitution pattern using class-specific matrix.Journal of Biosciences. 2010,35(2):295-314
5.Qiao Hui , Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Kong Ling-Qiang,Peng Yu. Specificity of Cation-π Interactions in Typical Protein Folds. Acta Physico-Chimica Sinica.2010, 26 (10): 2828-2832
6.Liu Yue,Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Qiao Hui. Classification Modeling and Recognition of Protein Fold Type.Acta Physico-Chimica Sinica.2009, 25 (12): 2558-2564
7.李曉琴,劉岳. 基於LIFCA分類系統的蛋白質摺疊識別軟體V1.0.登記號:2009RBJ4059
8.Wen-Ke Ren, Hai-Song Xu, Xiao-Qin Li.Identification of Globin-like fold proteins with Structural-based profile Hidden Markov Model. Prog Biochem Biophys.2008,35(5):548:554
9.Wei Zhang, Xiao-Qin Li, Hai-Song Xu, Wen-Ke Ren. Study on protein fold type recognition.Acta Biophysica Sinica.2008,241:65-71
10.劉曉輝,李曉琴,徐海松,任文科.構建基於摺疊核心的全α類蛋白取代矩陣.中國生物化學與分子生物學報.2008,24(8):761-766
11.李曉琴,張瑋. 蛋白質結構類及摺疊類型識別軟體V1.0 計算機軟體著作權登記號:2007SRBJ0486
12.LF Luo, MW Jia, XQ Li.Protein-Structure-PreferencetRNA Copy Number and mRNA Stem/Loop Content. Biopolymers.2004(74):432-447
13.Li XQ,Luo LF. The relation between translation speed and protein secondary structure. ACTA Biochimica Biophysica Sinica.2003(35)2:193-196
14.XQ Li, LF Luo. The recognition of protein structural class. ProgBiochem Biophys. 2002,29:938-941
15.LF Luo, XQ Li.construction of genetic code from evolutionary stability.BioSystems. 2002(65):83-97
16.LF Luo, XQ Li.Coding rules for amino acid in the genetic code: the genetic code is aminimal code of mutational deterioration.Origins of life and Evolution of the Biosphere.2002(32):23-33
17.XQ Li, LF Luo. The definition and recognition of protein structural class.Prog Biochem Biophys.2002(29)1:124-127
18.XQ Li, LF Luo. Recognition and Architecture of the Framework Structure of Protein. Proteins: Structure, Function and Genetics.2000(39):9-25
3.JL Yan,ZW Chen, HS Xu ,XQ Li. Protein Fold Recognition by Functional Domain Composition. Prog. Biochem. Biophys. 2011,38(2):166-172
4.Hai Song Xu, Wen Ke Ren, Xiao Hui Liu and Xiao Qin Li .Aligning protein sequence and analyzing substitution pattern using class-specific matrix.Journal of Biosciences. 2010,35(2):295-314
5.Qiao Hui , Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Kong Ling-Qiang,Peng Yu. Specificity of Cation-π Interactions in Typical Protein Folds. Acta Physico-Chimica Sinica.2010, 26 (10): 2828-2832
6.Liu Yue,Li Xiao-Qin,Xu Hai-Song,Qiao Hui. Classification Modeling and Recognition of Protein Fold Type.Acta Physico-Chimica Sinica.2009, 25 (12): 2558-2564
7.李曉琴,劉岳. 基於LIFCA分類系統的蛋白質摺疊識別軟體V1.0.登記號:2009RBJ4059
8.Wen-Ke Ren, Hai-Song Xu, Xiao-Qin Li.Identification of Globin-like fold proteins with Structural-based profile Hidden Markov Model. Prog Biochem Biophys.2008,35(5):548:554
9.Wei Zhang, Xiao-Qin Li, Hai-Song Xu, Wen-Ke Ren. Study on protein fold type recognition.Acta Biophysica Sinica.2008,241:65-71
10.劉曉輝,李曉琴,徐海松,任文科.構建基於摺疊核心的全α類蛋白取代矩陣.中國生物化學與分子生物學報.2008,24(8):761-766
11.李曉琴,張瑋. 蛋白質結構類及摺疊類型識別軟體V1.0 計算機軟體著作權登記號:2007SRBJ0486
12.LF Luo, MW Jia, XQ Li.Protein-Structure-PreferencetRNA Copy Number and mRNA Stem/Loop Content. Biopolymers.2004(74):432-447
13.Li XQ,Luo LF. The relation between translation speed and protein secondary structure. ACTA Biochimica Biophysica Sinica.2003(35)2:193-196
14.XQ Li, LF Luo. The recognition of protein structural class. ProgBiochem Biophys. 2002,29:938-941
15.LF Luo, XQ Li.construction of genetic code from evolutionary stability.BioSystems. 2002(65):83-97
16.LF Luo, XQ Li.Coding rules for amino acid in the genetic code: the genetic code is aminimal code of mutational deterioration.Origins of life and Evolution of the Biosphere.2002(32):23-33
17.XQ Li, LF Luo. The definition and recognition of protein structural class.Prog Biochem Biophys.2002(29)1:124-127
18.XQ Li, LF Luo. Recognition and Architecture of the Framework Structure of Protein. Proteins: Structure, Function and Genetics.2000(39):9-25

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