《用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究》是依託清華大學,由孫之榮擔任項目負責人的專項基金項目。
基本介紹
- 中文名:用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究
- 依託單位:清華大學
- 項目負責人:孫之榮
- 項目類別:專項基金項目
- 批准號:19577104
- 申請代碼:A25
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:1996-01-01 至 1997-12-31
- 支持經費:12(萬元)
《用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究》是依託清華大學,由孫之榮擔任項目負責人的專項基金項目。
《用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究》是依託清華大學,由孫之榮擔任項目負責人的專項基金項目。項目摘要 本項目研究主要套用各種理論物理和數理方法,總結蛋白質各個不同層次的結構規律。重點集中蛋白質結構類、結構子類、超二級結構MOTIF等...
蛋白質摺疊是生物分子自發、精密自組裝的典型代表。本項目通過基於原子力顯微鏡的單分子力譜,研究了多種有著特殊摺疊行為的蛋白在受力下的解摺疊和摺疊的物理機制,研究了含金屬離子的蛋白摺疊和解摺疊受外力的調控,並收到蛋白質錯誤摺疊...
《蛋白質摺疊過程的物理研究》是依託天津大學,由林家狄擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 由統計的方法,實現由20個胺基酸和400個胺基酸對對蛋白質四種二級結構類及含量予測,找到影響各種結構予測參數重要性的排序表,指出在予測中...
《蛋白質結構和摺疊規律及功能關係的動力研究》是依託中國科學院合肥物質科學研究院,由鄒良劍擔任項目負責人的專項基金項目。項目摘要 該項目套用理論物理解析和計算機的分子動力學模擬的方法研究了蛋白質分子的結構,摺疊的物理規律及其與生物...
本項目不僅可以闡明蛋白質摺疊與去摺疊的一般物理規律,也將揭示細胞中的力學感測蛋白行使生物功能的分子機制。結題摘要 絕大多數蛋白質執行其生物功能的前提是它能夠從多肽鏈摺疊到其特定的三維結構,而蛋白質的降解需要將將其解開成多...
《蛋白質的功能結構摺疊動力學研究》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。 項目摘要 針對若干蛋白質體系,結合模擬計算和數據統計研究蛋白質體系的複雜性和功能結構形成的機制。分析研究胺基酸之間的相互作用特性,構造不同複雜...
把靜電相互作用加到傳統的Gō模型中,研究了嗜熱蛋白抗高溫的物理機制,發現該蛋白及其突變體具有相似的摺疊路徑。發展了一種基於彈性網路模型的有效熱力學方法,成功用於蛋白質功能性構象轉變中關鍵殘基的識別,該方法能夠有效識別蛋白質的...
同時,將該模型整合到經典的分子動力學,並利用凝聚態統計物理學最新發展的高效率構象採樣技術,進行大規模並行計算,用物理的方法來研究輔助因子調控的蛋白質摺疊、聚集及功能運動。從原子層次探索輔助因子調控蛋白質結構與動力學的分子機制...
《蛋白質體系中相互作用特徵與摺疊動力學的研究》是依託南京大學,由王駿擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 運用統計物理的思路、方法和計算機模擬的手段,構建蛋白質分子模型,用分類的方法研究胺基酸之間的相互作用特徵,分析其摺疊...
申請人在對稱蛋白質序列與結構關係方面有系統的研究,本項目擬在此基礎上通過新生肽鏈摺疊和局部肽鏈摺疊方式的研究,模擬對稱蛋白質的摺疊過程,希望在模擬較大蛋白質摺疊過程和揭示摺疊物理機制方面取得進展。結題摘要 本項目的研究重點一...
本項目擬構建一個包含二硫鍵形成和打開的理論模型,運用簡化的分子動力學模擬方法,研究BPTI等幾個典型含有硫鍵蛋白質的氧化摺疊過程,探索其摺疊和聚合過程的動力學和物理機制。同時,本項目還在實驗上利用紫外光照辦法研究在生理環境中含有...
3、蛋白質摺疊類型與胺基酸序列關係研究,探索蛋白質摺疊的經驗規律。通過序列比對和統計分析相結合的方法,分析蛋白質摺疊的胺基酸序列特徵,尋找經驗規律,探索摺疊類型形成的物理基礎。4、構建蛋白質摺疊類型演化樹圖。結合蛋白質摺疊類型的...
等等特性通過殘基間的相互作用而摺疊成一立體的三級結構。雖然蛋白質可在短時間中從一級結構摺疊至立體結構,研究者卻無法在短時間中從胺基酸序列計算出蛋白質結構,甚至無法得到準確的三維結構。蛋白質摺疊的研究,比較狹義的定義就是研究...
最後,我們把理論與實驗結合在一起,從微觀尺度研究了蛋白結合複合物的結合-摺疊過程。通過分析模擬系綜可以確定過渡態和熱點殘基,還從微觀結構上比較模擬分析結果和單分子實驗數據,進一步做出預測並指導實驗。並且把蛋白質摺疊-結合的研究...
《基於微流控晶片的蛋白質摺疊超快動力學新方法研究》是依託華中科技大學,由徐友志擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 生物大分子的功能取決於分子結構,而如何形成活性三維結構,即生物大分子摺疊動力學過程,是科學界長久以來備受關注的...
我們將套用該裝置對在細胞色素c和Im7等蛋白質分子早期摺疊事件中存在很大爭議的爆發相(burst phase)和中間體在摺疊途徑中所起的作用進行詳細研究,驗證現有的關於摺疊的模型,並發展關於蛋白質摺疊新的理論和實驗方法。
建立改進型蟻群算法與神經網路、遺傳算法等聯用技術,進行高效的構象空間搜尋以確定全局自由能最小結構,達到蛋白質三維摺疊模式預測的目的。首先以已知結構的蛋白質為研究對象,考察所建立方法的正確性並加以完善。然後以人分化抗原5C5、不...
儘管已研究多年,但人們對誤摺疊蛋白質的積聚機理和積聚細胞毒性等問題仍沒弄清。本項目擬藉助分子動力學模擬,從分子水平研究四種既具代表性,又各具特異性的與蛋白誤摺疊病相關的短多肽的積聚的動力學過程、物理化學機制及細胞毒理學。...
《統計物理和蛋白質摺疊講義》是復旦大學出版社出版的圖書,原作是(美)黃克遜。本書以簡潔的語言,精闢地提出了可能的研究方向,對於從事生命科學研究的多學科讀者都具有指導意義。內容簡介 《統計物理和蛋白質摺疊講義》是作者於2004年...
系統總結了數十年來全世界範圍內蛋白質物理學、蛋白質結構和摺疊原理研究方面取得的成果;略去了複雜的數學推導,通過輕鬆的語言,運用類比等敘述方式,將艱深的統計物理、熱力學等理論知識形象生動地展現給讀者;每講中會適時地插入“...
從胺基酸之間的相互作用勢方面對序列複雜性進行約化,結合能量面的路徑描述進行摺疊動力學研究。研究膜蛋白及其相關係統的輸運過程物理機制。這些研究對蛋白質序列和結構之關係與蛋白質設計具有重大意義。
蛋白質摺疊類型(protein folding type)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。定義 根據蛋白質二級結構組成及其不同的排布可以將蛋白質分成不同的摺疊類型。如α螺旋類、β片層類、α...
Alexei V Finkelstein)和O.B.普季岑(Oleg B Ptitsyn)是世界著名的從事蛋白質物理研究的俄羅斯科學院院士,他們在某些領域特別是關於蛋白質摺疊的工作,非常卓越,例如,蛋白質結構SCOP分類法、“熔球”概念和“穿線法”方法最初都...
《蛋白摺疊色譜法》是依託西北大學,由耿信篤擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 用液相色譜法對通常認為不可逆蛋白摺疊實現完全或部分摺疊,並稱其謂蛋白摺疊色譜法。從提高疏水色譜(HPHIC)固定相對變性蛋白分子提供能量和建立蛋白分子雙...