蛋白質摺疊類型(protein folding type)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
基本介紹
- 中文名:蛋白質摺疊類型
- 外文名:protein folding type
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年
蛋白質摺疊類型(protein folding type)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
蛋白質摺疊類型(protein folding type)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。定義根據蛋白質二級結構組成及其不同的排布可以將蛋白質分成不同的摺疊類型。...
蛋白質摺疊(Protein folding)是蛋白質獲得其功能性結構和構象的過程。通過這一物理過程,蛋白質從無規則捲曲摺疊成特定的功能性三維結構。在從mRNA序列翻譯成線性的肽鏈時,蛋白質都是以去摺疊多肽或無規則捲曲的形式存在。2023年,日本科學家發現了一系列前所未知的蛋白質摺疊。前言 結構決定功能,僅僅知道基因組序列...
另一種常見的蛋白質模序是alpha-螺旋和三種不同的β-轉角。不屬於一個模序的蛋白質一級結構部分被稱之為不規則螺旋。這些部分對蛋白質的空間構象非常重要。特性 β-摺疊(β-sheet)也是一種重複性的結構,大致可分為平行式和反平行式兩種類型,它們是通過肽鏈間或肽段間的氫鍵維繫。可以把它們想像為由摺疊的...
β-摺疊結構(β-sheet)又稱為β-摺疊片層(β-pleated sheet)結構和β-結構等,是蛋白質中的常見的二級結構,是由伸展的多肽鏈組成的。摺疊片的構象是通過一個肽鍵的羰基氧和位於同一個肽鏈或相鄰肽鏈的另一個醯胺氫之間形成的氫鍵維持的。氫鍵幾乎都垂直伸展的肽鏈,這些肽鏈可以是平行排列(走向都是由N到C...
蛋白質摺疊 從一級結構到更高級結構的過程就被稱為蛋白質摺疊。一個序列特定的多肽鏈(摺疊之前的蛋白質一般都被稱為多肽鏈)一般摺疊為一種特定構象(又稱為天然構象);但有時可以摺疊為一種以上的構象,且這些不同構象具有不同的生物學活性。在真核細胞內,許多蛋白質的正確摺疊需要分子伴侶的幫助。結構分類 ...
蛋白質分子的二級結構(secondarystructure)通常是指蛋白質多肽鏈沿主鏈骨架方向的空間走向、規則性循環式排列,或某一段肽鏈的局部空間結構,即蛋白質的二級結構為肽鏈主鏈或一段肽鏈主鏈骨架原子的相對空間盤繞、摺疊位置,它並不涉及胺基酸殘基側鏈的構象。二級結構形式 蛋白質二級結構的基本類型有α螺旋、β摺疊、β...
羅斯曼摺疊(英語:Rossmann fold)是一種蛋白質結構基序,常見於核苷酸結合蛋白質,特別是輔因子NAD結合蛋白。該結構由兩個重複的部分組成,每個部分包括6個平行的β摺疊與兩對α螺旋形成β-α-β-α-β的拓撲結構。因為每一個羅斯曼摺疊可以和一個核苷酸結合,像NAD等二核苷酸的結合域包括二個成對的羅斯曼摺疊,...
《蛋白質摺疊信息資料庫及摺疊經驗規律探索》是依託北京工業大學,由李曉琴擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質摺疊規律的研究是生命科學重大前沿課題。本課題擬構建蛋白質摺疊類型資料庫,研究蛋白質摺疊的經驗規律。研究內容包括:1、蛋白質摺疊類型信息資料庫的建立,定義規範摺疊分類的量化指標。從PDB、SCOP等...
《蛋白質摺疊的單分子力譜研究》是依託南京大學,由曹毅擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質摺疊問題既與很多疾病相關,也是生命科學中非常重要的基礎問題。傳統的基於巨觀層面上的實驗研究極大地豐富了我們對蛋白質摺疊機理的認識。單分子實驗方法的可以進一步對一些特殊摺疊行為如下山式摺疊、天然態中的不同構象...
《用物理方法進行蛋白質摺疊類的研究》是依託清華大學,由孫之榮擔任項目負責人的專項基金項目。項目摘要 本項目研究主要套用各種理論物理和數理方法,總結蛋白質各個不同層次的結構規律。重點集中蛋白質結構類、結構子類、超二級結構MOTIF等結構層次的分類模式與結構預測。由於分層次研究,將複雜的結構問題轉化為比較簡單的...
(9)Rossmann捲曲——也稱Rossmann摺疊,它由兩個βαβ連在一起,形成βαβαβ結構,通常能結合輔酶I;(10)希臘鑰匙模體——是一種全β摺疊聚合體,存在於許多不同類型的蛋白質中,因在拓撲學上像古代花瓶上的希臘鑰匙而得名,清蛋白原就含有這種模體。模體是刻畫蛋白質家族組成結構和執行功能的重要部分,...
(2)對於較大的球狀蛋白質或亞基,其三級結構往往由兩個或多個結構域締合而成。結構域的特點 (3)結構域有時也指功能域 酶活性中心常位於結構域之間。結構域的類型 結構域基本類型數目有限。根據其所含的二級結構種類和組合方式,結構域大體可分為4類:反平行α螺旋結構域(全α—結構)、平行或混合型β摺疊片...
蛋白質氧化摺疊 蛋白質氧化摺疊(oxidative protein folding)是2018年全國科學技術名詞審定委員會公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。定義 多肽鏈上的半胱氨酸殘基間形成立體結構中正確配對的二硫鍵的過程。出處 《生物物理學名詞》第二版 ...
《蛋白質摺疊問題的研究及其醫學套用》是依託中山大學,由鄒小勇擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 本課題以蛋白質摺疊問題為研究目的,根據基因序列和胺基酸序列,研究基因序列包含的蛋白質高級結構信息;建立相對熵函式;研究蛋白質構象簡碼技術;研究改進型蟻群算法,達到搜尋時間短、不易出現停滯現象、用於求解連續空間...
《蛋白質摺疊和蛋白質複雜性表征》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 運用凝聚態統計物理的思想和方法,通過對蛋白質系統漏斗狀能量面特性的刻畫,建立蛋白質摺疊過程的基本圖象,研究蛋白質摺疊的物理機制.從殘基間的相互作用入手,利用種類簡化方法,表征和刻畫蛋白質系統的複雜性,並研究其...
《蛋白質結合-摺疊的理論研究》是依託吉林大學,由汪勁擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質摺疊決定三維結構的形成,而蛋白質結合決定分子水平的相互作用和功能。通常人們單獨地研究蛋白質的摺疊和結合。然而,越來越多的實驗證據表明蛋白質摺疊和結合間的耦合對細胞功能很重要。在項目中,我們將用統計力學和微觀...
蛋白質代謝表示負責合成蛋白質和胺基酸(合成代謝)的各種生化過程,以及通過分解代謝分解蛋白質。合成代謝 蛋白質合成代謝是蛋白質由胺基酸形成的過程。它依賴於五個過程:胺基酸合成,轉錄,翻譯,翻譯後修飾和蛋白質摺疊。蛋白質由胺基酸製成。在人類中,可以使用已經存在的中間體合成一些胺基酸。這些胺基酸被稱為非必需...
《蛋白質摺疊機理的研究》是依託北京工業大學,由王存新擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 用基於殘基的非格點模型與全原子模型,模擬真實蛋白質的摺疊和去摺疊過程。在殘基和原子的水平上研究具體蛋白質摺疊的物理機制,描述其在摺疊自由能面上的熱力學與動力學特徵,研究不同相互作用與溶劑效應對蛋白質結構、變性及...
針對若干蛋白質體系,結合模擬計算和數據統計研究蛋白質體系的複雜性和功能結構形成的機制。分析研究胺基酸之間的相互作用特性,構造不同複雜程度的非格點模型;用Go模型進行分子動力學模擬研究其摺疊;研究有硫鍵約束的蛋白的摺疊;研究有空間約束的摺疊;研究蛋白質雙鏈的摺疊。補充簡化的Go模型模擬,開展用Amber軟體進行...
《蛋白質摺疊過程的物理研究》是依託天津大學,由林家狄擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 由統計的方法,實現由20個胺基酸和400個胺基酸對對蛋白質四種二級結構類及含量予測,找到影響各種結構予測參數重要性的排序表,指出在予測中某些胺基酸成份重要性不及一些胺基酸對;得到予測公式,對110個蛋白質的檢驗庫予測...
此外,通過翻譯後轉運途徑進入線粒體、葉綠體和過氧化物酶體等細胞器的蛋白質,也必須在分子伴侶的幫助下解摺疊或維持非摺疊狀態,這有利於通過膜上的輸入裝置。蛋白質輸入這些細胞器通常是需要能量的過程。2、膜泡運輸(vesicular transport):蛋白質通過不同類型的轉運小泡從糙面內質網合成部位轉運至高爾基體,進而...
《蛋白質摺疊構造的新化學探針研究》是依託吉林大學,由王宗睦擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 設計、合成了具有EDTA基團或1,3-丙二胺四乙酸基團的探針共6種。部分探針的合成採用了“預製塊連結”戰略,簡化了步驟,提高了總收率。用所得探針定點(共價)修飾的蛋白質依次用Fe(z+), H2O2- 抗壞血酸處理...
《輔助因子調控的蛋白質摺疊、聚集與功能運動》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的重點項目。項目摘要 生物體內,大部分蛋白質需要輔助因子的參與才能正確行使其特定的生物學功能。然而,相對於其生物學重要性,人們對輔助因子調控的蛋白質結構與動力學卻了解甚少。在本項目中,我們將藉助量子化學方法建立描述輔助因子...
許多具有生理活性的蛋白質,如酶、轉運蛋白、蛋白類激素與免疫球蛋白、補體等均屬於球蛋白。特點 (1)球狀蛋白質分子含多種二級結構元件;(2)球狀蛋白質三維結構具有明顯的摺疊層次,多肽鏈主鏈在熵驅動下摺疊成借氫鍵維繫的α-螺旋、β-摺疊等二級結構,在一級序列上相鄰的二級結構往往在三維摺疊中彼此靠近並相互...
《蛋白質摺疊問題的全原子分子動力學模擬研究》是依託南京大學,由張建擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 針對若干典型的蛋白質體系,結合凝聚態統計物理中最新的構象空間採樣方法和手段,利用全原子及簡化模型的分子動力學模擬,研究蛋白質摺疊動力學,研究自由能面的複雜性及來源等,加深對蛋白質摺疊問題的認識...
2種類型:轉角I的特點是:第1個胺基酸殘基羰基氧與第4個殘基的醯胺氫之間形成氫鍵;轉角II的第3個殘基往往是甘氨酸。這兩種轉角中的第2個殘基大都是脯氨酸。對580多種蛋白質的X-射線晶體衍射分析發現,有些蛋白質幾乎全是由α-螺旋結構組成的,有些蛋白質幾乎全是由β-摺疊結構組成的,而有些蛋白質分子中α-...
一般說,較小蛋白質的短肽鏈如果僅有1個結構域,則此蛋白質的結構域和三級結構即為同一結構層次。較大的蛋白質為多結構域,它們可能是相似的,也可能是完全不同的。結構域的基本類型有4類:反平行d螺旋結構域(全d結構),平行或混合B摺疊結構域(d、p結構)、反平行p摺疊結構域(全3結構)和富含金屬或二硫...