蛋白質的功能結構摺疊動力學研究

蛋白質的功能結構摺疊動力學研究

《蛋白質的功能結構摺疊動力學研究》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:蛋白質的功能結構摺疊動力學研究
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:王煒
  • 依託單位:南京大學
  • 批准號:10474041
  • 申請代碼:A2014
  • 負責人職稱:教授
  • 研究期限:2005-01-01 至 2007-12-31
  • 支持經費:27(萬元)
項目摘要
針對若干蛋白質體系,結合模擬計算和數據統計研究蛋白質體系的複雜性和功能結構形成的機制。分析研究胺基酸之間的相互作用特性,構造不同複雜程度的非格點模型;用Go模型進行分子動力學模擬研究其摺疊;研究有硫鍵約束的蛋白的摺疊;研究有空間約束的摺疊;研究蛋白質雙鏈的摺疊。補充簡化的Go模型模擬,開展用Amber軟體進行全原子模型的分子動力學模擬計算等。細緻地刻畫摺疊熱力學和動力學特性,探討各自體系中的主要特徵和導致不同系統差異的來源,尋找影響和控制其結構形成過程的關鍵因素,勾畫不同的摺疊路徑和過程,從而了解其功能結構形成的過程和機制。此外,利用生物信息學和統計物理的方法對蛋白質序列複雜性和蛋白質模型進行簡化研究和特徵分析,研究胺基酸分組和蛋白質簡化的有效性。從而實現對蛋白質分子體系的複雜性有一個系統而物理的認識和進行簡化表征,為進一步研究蛋白質的序列與結構關係和蛋白質設計提供理論基礎。

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