《蛋白質的功能結構摺疊動力學研究》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:蛋白質的功能結構摺疊動力學研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:王煒
- 依託單位:南京大學
- 批准號:10474041
- 申請代碼:A2014
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2005-01-01 至 2007-12-31
- 支持經費:27(萬元)
《蛋白質的功能結構摺疊動力學研究》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。
《蛋白質的功能結構摺疊動力學研究》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的面上項目。 項目摘要針對若干蛋白質體系,結合模擬計算和數據統計研究蛋白質體系的複雜性和功能結構形成的機制。分析研究胺基酸之間的相互作用特性,構造不同...
《蛋白質結構和摺疊規律及功能關係的動力研究》是依託中國科學院合肥物質科學研究院,由鄒良劍擔任項目負責人的專項基金項目。項目摘要 該項目套用理論物理解析和計算機的分子動力學模擬的方法研究了蛋白質分子的結構,摺疊的物理規律及其與生物...
蛋白質摺疊(Protein folding)是蛋白質獲得其功能性結構和構象的過程。通過這一物理過程,蛋白質從無規則捲曲摺疊成特定的功能性三維結構。在從mRNA序列翻譯成線性的肽鏈時,蛋白質都是以去摺疊多肽或無規則捲曲的形式存在。2023年,日本...
《基於微流控晶片的蛋白質摺疊超快動力學新方法研究》是依託華中科技大學,由徐友志擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 生物大分子的功能取決於分子結構,而如何形成活性三維結構,即生物大分子摺疊動力學過程,是科學界長久以來備受關注的...
用彈性網路模型和分子動力學模擬,研究了蛋白質結構本身所固有的動力學特性對蛋白質去摺疊過程的影響,結果表明彈性網路模型不僅能夠預測蛋白質的功能性運動模式,還能夠有效預測蛋白質的去摺疊過程。將蛋白質結構柔性分析方法用於蛋白質-蛋白...
分析其摺疊過程熱力學和動力學特徵,探索影響蛋白質摺疊的主要因素,進而歸納總結摺疊過程的物理機制和圖象,研究序列組成與摺疊結構之間的內在聯繫。通過這樣的研究實現對蛋白質摺疊過程的基本物理內容的理解和認識。
《蛋白質結合-摺疊的理論研究》是依託吉林大學,由汪勁擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白質摺疊決定三維結構的形成,而蛋白質結合決定分子水平的相互作用和功能。通常人們單獨地研究蛋白質的摺疊和結合。然而,越來越多的實驗證據表明...
《蛋白質序列分析、結構預測和摺疊動力學及其相關問題》是依託南京大學,由王煒擔任項目負責人的重大研究計畫。項目摘要 對蛋白質資料庫的胺基酸序列進行統計分析,發展序列與結構之間的理論分析方法,研究序列與結構之關係並建立結構計算的模型...
蛋白質摺疊的物理機制是生物物理學研究的重大基礎問題之一,它不僅是深入理解蛋白質功能的基礎,也是納米生物技術中的瓶頸。雖然經過40多年研究,這方面已取得了很大的進展,但從蛋白質胺基酸序列預測和摺疊它的三級結構仍然十分困難。這是...
《含二硫鍵蛋白質摺疊和聚集的動力學和物理機制》是依託南京大學,由秦猛擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 含有二硫鍵蛋白質是蛋白質家族中一類含量眾多的成員,在生物體許多功能的執行中扮演了極其重要的角色。其摺疊和聚合過程中...
《一種新型超快混合裝置用於蛋白質摺疊動力學的研究》是依託東南大學,由呂華擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 本項目擬研製一種新型的超快混合裝置,並與螢光光譜分析技術相結合,用於在微秒到秒的時間標度上對蛋白質分子的...
首先以已知結構的蛋白質為研究對象,考察所建立方法的正確性並加以完善。然後以人分化抗原5C5、不同溶菌酶抗體與溶菌酶的複合物為研究對象,開展未知蛋白質三維摺疊模式的預測,以及在受體和配體三維摺疊模式已知的條件下預測蛋白質-蛋白質...
人體內蛋白質的種類很多,性質、功能各異,但都是由20多種胺基酸(Amino acid)按不同比例組合而成的,並在體內不斷進行代謝與更新。基本含義 蛋白質是由胺基酸以“脫水縮合”的方式組成的多肽鏈經過盤曲摺疊形成的具有一定空間結構的...
《蛋白質摺疊過程的物理研究》是依託天津大學,由林家狄擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 由統計的方法,實現由20個胺基酸和400個胺基酸對對蛋白質四種二級結構類及含量予測,找到影響各種結構予測參數重要性的排序表,指出在予測中...
本研究將首先通過實驗測定,探討摺疊酶之一- - 二硫鍵異構酶與多肽鏈的疏水作用、二硫鍵異構酶活性中心催化多肽鏈二硫鍵的形成和蛋白質分子結構特性之間的聯繫,研究摺疊酶介導的蛋白質摺疊過程機理及該酶促反應的動力學。本研究還將...
蛋白質結構功能的研究是從分子水平了解生命現象的基礎。本書涉及的知識範圍很廣,從胺基酸到蛋白質的三維結構及檢測方法,酶、膜蛋白、纖維蛋白等的結構功能,酶的催化和動力學,蛋白質的表達、純化、合成、加工及在細胞中的周轉,蛋白質...
進一步的檢測發現,在該蛋白質的摺疊過程中,出現瞬間二聚體的現象。本項目即是以這個具有beta-alpha-beta結構的小蛋白為模型,通過計算機模擬研究該蛋白質摺疊的可能機制。在研究過程中,我們嘗試建立了粗粒化模型和全原子分子動力學模型...
絕大多數蛋白質執行其生物功能的前提是它能夠從多肽鏈摺疊到其特定的三維結構,而蛋白質的降解需要將將其解開成多肽鏈構象才可以進行,所以蛋白質的摺疊與去摺疊的研究具有重要的生物學意義,可以認為是生物中心法則 的重要延伸。近些年來...
同時,將該模型整合到經典的分子動力學,並利用凝聚態統計物理學最新發展的高效率構象採樣技術,進行大規模並行計算,用物理的方法來研究輔助因子調控的蛋白質摺疊、聚集及功能運動。從原子層次探索輔助因子調控蛋白質結構與動力學的分子機制...
這些研究既豐富了人們對蛋白質摺疊機理的認識,也為模仿蛋白質的摺疊、聚集機制來製備功能生物材料奠定了基礎。 重要的研究結果包括:1.提出了在生物體內,許多蛋白質分子處於受力環境,其摺疊與功能均收到外力的調控的思想。我們發現凝...
結合蛋白質摺疊類型的空間結構特徵及其序列模式,綜合利用聚類等統計學方法,給出不同摺疊類型蛋白質序列的進化與摺疊類型演化之間的關係。研究結果對蛋白質設計和摺疊動力學實驗具有指導作用,並為精確的蛋白質三級結構預測、蛋白質結構與功...
1.2蛋白質結構 蛋白質分子的結構決定了它的功能。一級結構:蛋白質多肽鏈中胺基酸的排列順序,以及二硫鍵的位置。二級結構:蛋白質分子局區域內,多肽鏈沿一定方向盤繞和摺疊的方式。三級結構:蛋白質的二級結構基礎上藉助各種次級鍵捲曲...
網路理論的興起為研究蛋白質摺疊以及結構功能關係注入了全新的思路與方法。蛋白質分子可以視作以胺基酸為節點,以殘基間相互作用為邊連線而構成的複雜系統。對胺基酸網路的分子指標和彈性網路的動力學研究將增加對蛋白質拓撲學機理的了解和...
通過發展AIMD,DPPC和EPB的方法和套用,建立一個多層次的理論計算模式來研究蛋白質。結題摘要 蛋白質是最重要和最複雜的生物大分子,它的功能有它的結構和動力學所決定,要正確了解和預測蛋白質的性質,需要從多個方面,多個層次和多個尺...
生物大分子的功能取決於分子結構,如何形成活性三維結構,即摺疊動力學,是當前生物物理學研究中最為活躍的前沿領域之一。核酸和蛋白質複雜的摺疊是由眾多簡單、局部和超快的摺疊迭加而成的。揭示生物大分子精細的摺疊過程,動力學測量的...
由研究蛋白質結構而發展起來了結構生物學,採用了包括X射線晶體學、核磁共振等技術來解析蛋白質結構。一定數量的殘基對於發揮某一生物化學功能是必要的;40-50個殘基通常是一個功能性結構域大小的下限。蛋白質大小的範圍可以從這樣一個下限...
建立復性動力學方程;測定復性過程中摺疊中間體的形成及變化,從蛋白質分子結構和疏水性角度探討PNIPAAm毛髮協助復性機理;用RAFT聚合法在毛髮末端引入-SH功能基團,使之兼具抑制多肽鏈間二硫鍵錯配功能並用於蛋白質復性;增大PS核心粒徑或...
本項目的研究結果將對定量可靠的描述蛋白質分子的結構功能和動力學行為提供重要的理論 結題摘要 由於傳統分子力場缺乏顯式的靜電極化效應,嚴重製約著動力學模擬的可靠性。基於精確量子力學計算的新型的動態的蛋白質極化力場克服了目前廣泛...
以及它們在蛋白質分子結構預測中的實現模式。項目的完成,可望在非凸函式極小化和蛋白質摺疊中分子結構預測的數理方法研究方面取得新進展,拓寬最佳化問題研究的途徑、推動最最佳化學科同生命科學交叉性研究的開展。
蛋白質是由形成的長鏈。蛋白質是生物生存的基本條件。作為酶,他們是所有生物化學反應的驅動力。作為結構的基本成分,它們是我們的骨骼、肌肉、頭髮、皮膚和血管的主要組成部分。作為抗體,它們可以識別入侵物體,使免疫系統工作從而清除這些...