候選基因策略是指通過揭示直接在生理髮育上或生長發育過程中能得以表現的基因在性狀差異與其DNA差異之間的關係而進行的標記輔助選擇。
基本介紹
- 中文名:候選基因策略
- 屬性:基因工程術語
候選基因策略是指通過揭示直接在生理髮育上或生長發育過程中能得以表現的基因在性狀差異與其DNA差異之間的關係而進行的標記輔助選擇。
候選基因策略是指通過揭示直接在生理髮育上或生長發育過程中能得以表現的基因在性狀差異與其DNA差異之間的關係而進行的標記輔助選擇。相關介紹候選基因(candidategene)通常是一些已知其生物學功能和序列的基因,它們參...
《特發性房顫致病基因的識別》是依託同濟大學,由陳義漢擔任項目負責人的青年科學基金項目。 中文摘要 在已經獲得2個特發性房顫(IAf)家系基礎之上,首先通過候選基因策略直接篩查心臟鈉通道、鉀通道和縫隙連線通道等基因,如果它們不是IAf致病基因,那么則採用高效能解卷濾ㄎ⑽佬腔蚍中頭椒ê蚅ods連鎖分析技術確定...
本項目以斜帶石斑魚E. coioides為研究對象,採用分子遺傳標記技術與候選基因策略相結合的方法,對生長軸上的生長激素GH、生長激素受體GHRs、胰島素樣生長因子IGFs、胰島素樣因子受體IGFRs、胰島素樣生長因子結合蛋白IGFBPs、生長調控因子MRFs 、生長分化因子MSTN、生長激素釋放激素GHRH/PACAP、瘦素Leptin等重要功能基因的序列...
本研究運用定位候選基因策略,識別出了一個新的家族性長QT綜合症合併房顫致病基因Kir3.4。Kir3.4基因G387R 突變使Kir3.4編碼的離子通道蛋白的胞內運輸和亞細胞分布異常,致使心肌細胞膜上的G蛋白門控鉀離子通道數量顯著減少,IKAch電流顯著減小,使心肌細胞復極延長,從而導致QT延長和房顫。運用直接候選基因策略,...
《孤獨症全基因組關聯第二階段研究》是依託北京大學,由王力芳擔任負責人的面上項目。項目摘要 孤獨症是一種起病於嬰幼兒期的神經發育障礙。研究提示遺傳因素在該病發病中起重要作用。孤獨症全基因組關聯研究(GWAS)克服了候選基因策略的局限性,有助於從全基因組水平發現新的易感基因。由於種族遺傳異質性,亟待開展...
結果發現了多個房顫相關HCN2基因突變,功能研究表明這些突變均導致相應的HCN2蛋白所構成的鉀離子通道的功能障礙。另外,運用直接候選基因策略還發現了多個房顫相關PITX2c、SHOX2和TBX5等轉錄因子基因突變,功能分析發現房顫相關PITX2c突變導致相應蛋白的轉錄激活作用顯著增強,而房顫相關SHOX2和TBX5突變均導致相應蛋白的...
本項目擬採用候選基因策略結合基因組掃描的方法,克隆該家系的新致病基因。即在排除已知基因的突變後,進行全基因組的連鎖分析,縮窄定位區域,然後再進行針對性的基因測序。通過測序比對,最終分離並克隆出遺傳性多發性骨軟骨瘤的新致病基因,鑑定其在我國人群中的常見突變類型,預測其編碼產物結構和功能的改變,為此病...
為證實該假說,本研究擬在這些原創性工作的基礎上,在房顫患者中測序篩查心房表達的全部3個CX基因,以識別房顫相關CX基因突變並揭示其致病機制。結果發現了多個房顫相關生殖細胞源CX40和CX45基因突變,功能研究表明這些突變均導致相應的CX蛋白所構成的縫隙連線通道的功能障礙。另外,運用直接候選基因策略還發現了多個房顫...
GWAS為人們打開了一扇通往研究複雜疾病的大門,將在患者全基因組範圍內檢測出的SNP位點與對照組進行比較,找出所有的變異等位基因頻率,從而避免了像候選基因策略一樣需要預先假設致病基因。同時,GWAS研究讓我們找到了許多從前未曾發現的基因以及染色體區域,為複雜疾病的發病機制提供了更多的線索。存在問題 1、人群混雜(...
3.1 基於IBD方法的基因精細定位 3.1.1 IBD定位方法基本原理 3.1.2 IBD精細定位的分析方法 3.1.3 IBD精細定位的模擬研究 3.2 結合連鎖分析(LA)和連鎖不平衡分析(LA/LD)的QTL精細定位策略 3.2.1 LD/LA定位的理論基礎和方法 3.2.2 基於模擬試驗進行LA和LA/LD分析的比較研究 3.2.3 主要結論 參考...
為此,本申請項目擬採集切花菊自然群體代表性品種多年多點重要性狀表型數據,藉助SRAP、SCoT和AFLP等分子標記進行全基因組掃描,採用STRUCTURE 和TASSEL 等軟體進行群體結構和連鎖不平衡水平分析;發掘與重要性狀(觀賞性、抗逆性)相關聯的分子標記。另一方面,採用候選基因關聯分析策略,進行抗逆候選基因的克隆、測序、序列...
全基因組掃描系統 全基因組掃描系統是一種用於生物學、基礎醫學、藥學領域的分析儀器,於2010年11月29日啟用。技術指標 高重複性和特異性 超高通量的密度 超高的成功率和準確性。主要功能 將疾病相關位點定位於染色體某個區域,然後再行候選基因策略或連鎖不平衡分析,確定致病基因位點。
最近,我們通過全基因組掃描、連鎖分析和單體型分析方法對一個常染色體顯性遺傳痙攣性截癱家系進行了致病基因的定位分析,得到了一個新的致病基因位點(11p11.2-p14.1),命名為SPG30型。本研究擬通過精細定位策略對SPG30型致病基因進行精細定位,確定致病基因最小區間,並通過定位候選-基因家族策略進行SPG30型候選基...
採用候選基因關聯分析策略,利用業已建立的DNA測序、SNPs篩查、高通量自動化基因型分析、生物信息學分析、功能研究等技術方法,以疾病基因通路途徑為研究切入點,對涉及多個內源性抗氧化通路途徑的冠心病候選基因之編碼區、調控區及剪下位點區進行SNPs檢測,試圖建立中國人群冠心病易感基因變異譜、SNPs單倍型庫及基因調控網路...
《複雜性狀遺傳結構解析及候選基因分析新方法研究》是依託浙江大學,由徐海明擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 高效解析作物複雜性狀(也稱數量性狀)具有重要套用價值的候選功能基因位點,分析多基因網路,探明基因間、基因與環境間的互作,對制定科學的性狀選擇策略,改良育種目標性狀具有重要意義。目前作物數量性狀QTL ...
隨著人類基因圖的構成,3000多個人類基因已被精確地定位於染色體的各個區域。今後,一旦某個疾病位點被定位,就可以從局部的基因圖中遴選出相關基因進行分析。這種被稱為“定位候選克隆”的策略,將大大提高發現疾病基因的效率。3、多基因病的研究 目前,人類疾病的基因組學研究已進入到多基因疾病這一難點。由於多基因...
DNA、RNA、蛋白質),保證研究的可持續性;篩查開角型青光眼基因(TIGR、OPTN基因)、先天性青光眼基因及與前房發育異常相關基因(PAX6、PITX2、FOXC1及PITX3基因)是否在家系中有突變存在,探討這些基因與中國人PACG發病的關係,排查其中可能的疾病基因;再選擇定位克隆策略通過全基因組掃描和連鎖分析定位新PACG疾病...
《散發性結直腸癌候選抑癌基因ACVR1C和PLCE1鑑定研究》是依託上海交通大學,由周崇治擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 採用雜合缺失分析法發現可疑位點、篩選候選基因,並對候選基因進行驗證是目前發現抑癌基因的主要策略。在以往研究中,本課題組完成了中國人群散發性結直腸癌全基因組雜合缺失分析和基因晶片...
功能克隆:克隆(致病)基因的一種策略。收集所要克隆的基因的蛋白質產物及其功能的信息,用以分離基因,並對基因進行定位。定位克隆:利用遺傳連鎖或細胞學定位技術將致病基因定位於染色體的特定區帶 主要方法:家系調查法、體細胞雜交法、核酸雜交技術 用遺傳標記進行基因定位 形態標記morphologicalmarkers,細胞標記...
探索其病因學機制;通過對破壞性行為障礙及其共病(注意缺陷多動障礙和抑鬱症)之間遺傳因素和環境因素相互作用的內在結構進行分析,研究破壞性行為障礙共病的遺傳機制;進一步在分子水平上,結合候選基因策略,通過對基因-環境的相互作用及相關性的研究,定位CD/ODD的易感基因;通過隨訪研究,分析發育過程中遺傳因素和...
第四節B型肝炎病毒準種及基因變異與B型肝炎重症化/104 第五節B型肝炎病毒編碼蛋白與B型肝炎重症化/116 第六節B型肝炎病毒基因轉錄、複製調控與B型肝炎重症化/132 第四章B型肝炎重症化的宿主遺傳特徵 第一節B型肝炎重症化基因組學研究概述/144 第二節基於候選基因策略的B型肝炎重症化遺傳因素/150 第三節基於...
[10] 姜潤深, 徐桂雲, 李俊英, 王曉亮, 楊寧. 催乳素基因5′-調控區24-bp插入/缺失變異與非就巢雞血漿催乳素水平及產蛋性能的關係[J]. 中國農業大學學報, 2007,12(3): 46-48 [11] 姜潤深, 李俊英, 楊寧. 孟德爾分離群體驗證候選基因遺傳效應的策略. 畜牧獸醫學報, 2007,38(9): 989-992 [12] ...
國家自然科學基金(3項課題)資助對SLE易感位點的染色體精細定位、候選基因的鑑定及基因表達譜特徵進行系統深入的研究取得顯著進展,其中包括在中國人群中1q23及16q12兩個重要易感區域並鑑定發現兩個重要的新的候選基因。套用基因晶片及蛋白組學研究策略,發現SLE病人基因表達譜特徵及特異性致病通路(IFN通路)。上述發現...
近幾年來, 李霞教授在複雜疾病基因挖掘方面取得了系列研究成果,複雜疾病一般由遺傳基因與環境因素共同作用而發生,並且往往有多基互作、遺傳異質性等特徵,其發病並不能通過一個基因的突變,單一的基因產物或通路的行為來解釋。傳統的單一基因定位克隆和候選基因關聯分析策略已不能全面地闡明人類疾病潛在的遺傳複雜性。...
研究表明,近等基因系法、分離群體分組分析法再結合AFLP等強有力的分子標記技術使人們能夠在短時間內從數量眾多的分子標記中篩選出與目標基因緊密連鎖的標記。更為有意義的是,這種策略在尚未構建遺傳圖譜的物種中也是可行的。1.2 篩選與目標基因連鎖的分子標記 篩選與目的基因連鎖的分子標記是圖位克隆技術的關鍵,...
因此我們以動脈粥樣硬化性腦梗死合併腦動脈狹窄的患者為病例組,以動脈粥樣硬化相關基因為候選基因進行研究;②以候選基因通路為切入點,探討多個基因和基因-環境因素在致病過程中的協同作用;③採用兩次篩選策略篩檢易感基因,並將陽性結果在經典的易卒中動物模型中進行驗證。相信可明顯提高研究結果的可信度。為臨床上此類...
31. 大黃魚TLR9抗病途徑解析及抗病候選基因鑑定,福建省傑出青年科學基金項目(2009J06019),2009-2012,主要參加者(主持人姚翠鸞,30萬元,在研)32. 大黃魚BLUP精細育種技術的建立及套用,福建省科技廳重點項目(2010N0021),2010-2012。參加者(主持人蔡明夷,10萬元,在研)。33. 大黃魚重要經濟性狀的遺傳...
以小麥赤霉病病原禾穀鐮刀菌( Fusarium graminearum )為主要研究對象,利用分子生物學、生物信息學和各種組學技術,開展病原真菌功能和進化基因組學研究,旨在全面揭示禾穀鐮刀菌生長發育和侵染致病的分子調控機理,為制定和發展新的病害防控策略奠定理論基礎。主要研究興趣如下:1. 開展禾穀鐮刀菌有性生殖階段的A-to-...
再採用原發癌細胞和其中分選出的CSC作為對照,對MCSC進行細胞增殖、凋亡、細胞粘附和聚集等功能研究,深入探討其生物學特性;另對其進行基因表達譜晶片分析,找出其差異表達基因,並運用基因沉默或過表達方式對候選基因進行功能驗證,探尋與大腸癌轉移相關的因素和作用機制,為大腸癌轉移的發生和診治提供理論依據。結題...