《基於蛋白質相互作用網路的算法研究及其套用》是2018年08月01日科學出版社出版的圖書,作者是湯希瑋。
基本介紹
- 中文名:基於蛋白質相互作用網路的算法研究及其套用
- 作者:湯希瑋
- 出版社:科學出版社
- 出版時間:2018-08
- 頁數:204 頁
- 定價:98 元
- 開本:B5
- 裝幀:平裝
- ISBN:9787030585714
《基於蛋白質相互作用網路的算法研究及其套用》是2018年08月01日科學出版社出版的圖書,作者是湯希瑋。
《基於蛋白質相互作用網路的算法研究及其套用》是2018年08月01日科學出版社出版的圖書,作者是湯希瑋。內容簡介為了揭示蛋白質網路的動態特徵,酵母的時間序列基因表達譜被用於分離靜態的蛋白質網路,進而構建隨時間變化的動態蛋...
《蛋白質網路動態演化模型及套用算法研究》是依託湖南大學,由駱嘉偉擔任項目負責人的專項基金項目。中文摘要 生命活動是若干蛋白質在微觀上所形成的複雜相互作用網路的巨觀表現。研究蛋白質網路對從系統水平上理解生命活動的內在組織及其過程...
《面向AP-MS數據的蛋白質相互作用網路推斷算法研究》是依託大連理工大學,由何增有擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 親和純化-質譜(AP-MS)技術是目前構建蛋白質相互作用(PPI)網路的重要生化實驗手段。能否從AP-MS數據中推斷出高質量的...
《基於蛋白質起源的蛋白質相互作用網路演化機制的研究》是依託蘇州大學,由張文宇擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 細胞內的各種重要的生理過程都是以蛋白質間的相互作用為紐帶,並形成網路。因而,研究蛋白質互作網路的形成過程對...
《基於蛋白質相互作用網路的複雜疾病分子機理研究》是依託中山大學,由戴道清擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 疾病相關基因預測和藥物靶蛋白偵測是當今生物醫療領域的熱點研究課題。基於蛋白質相互作用網路的複雜疾病分子機理研究為疾病相關...
《基於蛋白質相互作用網路的廣譜抗病毒宿主靶標研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院,由李非擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 以病毒蛋白為靶的抗病毒藥物面臨易產生耐藥等諸多問題,宿主分子靶向抗病毒不僅是解決...
《蛋白質相互作用方法與套用》是北京大學醫學出版社出版的圖書,作者是(美國)傅(FuH.)。該書為蛋白質——蛋白質相互作用研究的關鍵技術提供操作指南,並提供大量識別和操作蛋白質的技術和相關綜述,覆蓋了迄今最完全、最有效的分析蛋白...
《蛋白質結構域介導的蛋白-蛋白相互作用網路的研究》是依託蘇州大學,由侯廷軍擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 蛋白-蛋白相互作用在各種生命過程中起到了至關重要的作用,蛋白-蛋白相互作用網路的預測和研究對於闡明生物信息傳導過程以及...
本項目主要研究面向動態蛋白質網路的功能模組挖掘算法及其套用。將結合時間序列的基因表達數據,研究動態蛋白質網路的構建及描述方法;採用圖論和局部搜尋技術對功能模組挖掘算法展開研究,以得到不同時間和空間通過相互作用綁定的動態功能模組;...
《基於智慧型計算的蛋白質及其相互作用算法分析》是2020年科學出版社出版的圖書,作者是張曉龍,林曉麗,胡靜。內容簡介 隨著蛋白質組學研究的不斷深入,智慧型計算方法已成為蛋白質組學的支撐技術。本書系統地闡述目前蛋白質及其相互作用的主要...
蛋白質互作網路是由單獨蛋白通過彼此之間的相互作用構成,來參與生物信號傳遞、基因表達調節、能量和物質代謝及細胞周期調控等生命過程的各個環節。系統分析大量蛋白在生物系統中的相互作用關係,對於了解生物系統中蛋白質的工作原理,了解疾病...
《極低頻電磁場誘導下HSP70蛋白相互作用網路研究》是依託電子科技大學,由張安英擔任醒目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 結合兩套蛋白質相互作用信息:一套來源於酵母雙雜交實驗,一套來源於生物信息學預測,系統探索極低頻電磁場誘導下...
本項目將以ABC家族中48個成員為樞紐蛋白,採用多種機器學習算法構建ABC轉運蛋白家族PPI網路模型;套用整合性分裂泛素化酵母雙雜交系統和免疫共沉澱、pull-down等多種經典體外檢測方法,共同對網路模型中P-gp和OABP轉運蛋白相互作用對進行細胞...
《PPI網路融合化智慧型信息流模型與算法及其評價研究》是依託陝西師範大學,由雷秀娟擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 由於蛋白質互動作用網路具有無尺度和小世界特性,使用傳統聚類方法時間複雜度高、聚類正確率低,從而導致蛋白質...
蛋白質相互作用在很多生物學進程中發揮重要作用,對蛋白質相互作用網路的分析有助於從整體上理解細胞的生物學功能。當前對蛋白質網路的研究大都基於靜態的網路,而生命是一個動態的體系,靜態網路並不能反映蛋白質活性和蛋白質相互作用對...
首先,在整合來自不同數據源相互作用數據的基礎上,利用胺基酸殘基的理化性質,並結合矩陣分解方法對蛋白質序列進行編碼;然後,運用主成分分析和極限學習機這兩種多分類器集成算法來預測蛋白質相互作用,並結合柔性神經樹方法最佳化參數,以達到...
本項目將以蛋白質序列特徵為基礎,通過構建蛋白質相互作用標準數據集,預測並評估蛋白質相互作用,最終將構建高質量的蛋白質相互作用網路,用於識別關鍵基因、藥靶及發現複合物和功能模組等套用:根據胺基酸的理化性質,基於模糊理論對20種...
PprI, RecA, SSB, RecQ, Nth等)之間的物理與生物學的相互作用,進而利用生物信息學、基因敲除技術、生物化學等方法研究其相關功能,建立DNA修復過程中的蛋白互作網路,為發現與研究未知蛋白的功能提供一條可能的道路,為闡明耐輻射球菌...
本課題通過分析生物數據特徵及生物關聯特性,利用複雜網路理論、機率統計方法、機器學習算法,解決蛋白質相互作用相關預測問題。一、設計基於蛋白質共進化的分析方法,識別蛋白質相互作用關係。二、利用局部信息(序列、結構)建立蛋白質結合位點...
這樣對於給定的DNA,可根據與其作用的蛋白質結構Motif在PDB中找出能夠與其相互作用的蛋白質候選集。同時,本項目還將對具體問題如蛋白質分類、多結構比對、結構Motif挖掘等進行算法的開發和改進。本項目的研究成果不僅對於生物及製藥等領域具有...
新藥的研究與開發是化學和生命科學的重要組成部分,基於系統的創新藥物研究,期望針對多靶點同時發現具有不同生物活性的化合物是創新藥物研發的新策略。本研究構建蛋白質相互作用網路。對網路進行拓撲表征並分析其性質。建立重要靶標節點蛋白的...
4.2.2 蛋白質相互作用重要性的計算 (41) 4.3 本章小結 (41) 第三部分 蛋白質複合物識別篇 第5章 蛋白質複合物識別的相關研究 (44) 5.1 基於密度和局部搜尋的算法 (45) 5.2 基於層次聚類的算法 (47) 5.3 交...
整理了隨機遊走模型在單個和多個生物網路上套用的方式。設計了一系列將隨機遊走模型套用在多個生物網路上的算法。並將這些算法套用於疾病相關基因、非編碼基因以及藥物靶標蛋白質功能方面的預測。最後為了便於生物學研究和醫學研究人員使用,...
本項目擬採用自然語言處理和機器學習相結合的方法來研究蛋白質相互作用問題。首先,將多個異構的蛋白質相互作用資料庫進行整合來建立一個相對完整的相互作用資料庫,通過自然語言處理技術對相互作用數據進行評估,為資料庫中每一個記錄賦予可信...
該算法和平台可有效地用於鑑定腫瘤特異的lncRNA與RBP的互作網路,探討它們在腫瘤發生髮展過程中的作用,從而擴展我們對lncRNA及其互作調控網路在生理與疾病中作用的認識。結題摘要 長鏈非編碼RNA(lncRNA)與RNA結合蛋白(RBP)結合,參與多...
本課題將在前期蛋白質相互作用及功能位點預測研究的基礎上,結合生物學、數學、物理學等方法和計算機技術,探索蛋白質能量熱點預測的新方法、新算法和軟體工具。研究內容包括:(1)建立基於結構比對的機率預測方法;(2)用複雜網路方法研究...
對結構域組成進行非線性變換,並利用進化算法最佳化計算模型,為得到高可靠性的蛋白質相互作用預測結果打下良好的基礎。本項目的成果將為了解蛋白質生理功能的實現機制和治療相關疾病的藥物設計提供理論上的依據。
蛋白以及致病性蛋白,仿真模擬與實例套用均顯示新方法顯著提高了統計效力;3、基於pQTL 的概念,首先在靜態3D蛋白互作網路中,提出加權整合新算法,實現更準確鑑定關鍵變異位點,其次通過整合蛋白質表達譜與序列突變信息,提出基於高通量蛋白質...
《基於GFP 的細胞蛋白質相互作用的檢測及定位新方法研究》是依託廈門大學,由張軍擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 本項目根據水母綠色螢光蛋白(GFP)光譜變異型間的螢光共振能量傳遞現象,設計出細胞內、外蛋白質間作用的新型檢測...
《蛋白質組信息分析及套用算法研究》是依託湖南大學,由廖波擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 隨著蛋白質組學研究近年高速的發展,需要進行蛋白質結構的預測、功能的識別、以及生物標記物的預測與鑑別等,傳統的生物數據分析處理方法無法...