《基於結構Motif方法的蛋白質與DNA相互作用研究》是依託吉林大學，由時小虎擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：基於結構Motif方法的蛋白質與DNA相互作用研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：時小虎
- 依託單位：吉林大學
- 負責人職稱：教授
- 申請代碼：F0214
- 研究期限：2008-01-01 至 2010-12-31
- 批准號：60703025
- 支持經費：20（萬元）
項目摘要
研究蛋白質與DNA相互作用對於理解大分子之間的作用關係以及藥物的設計等都具有十分重大的意義.當前的研究多是基於序列層次上的，對於實踐的指導作用不明顯.與序列相比，蛋白質結構具有更加保守的特性，本項目擬從結構分析的角度研究蛋白質與DNA的相互作用關係.首先採用計算智慧型方法對已知的蛋白質和DNA的複合體分類，對於每一類蛋白質在多結構比對的基礎上挖掘其結構Motif，而後通過這些結構Motif與PDB中已有的蛋白質對應。這樣對於給定的DNA,可根據與其作用的蛋白質結構Motif在PDB中找出能夠與其相互作用的蛋白質候選集。同時，本項目還將對具體問題如蛋白質分類、多結構比對、結構Motif挖掘等進行算法的開發和改進。本項目的研究成果不僅對於生物及製藥等領域具有巨大的現實意義，而且其研究思路和方法將為其它相關計算生物學的研究帶來啟發作用。
