蛋白質組信息分析及套用算法研究

《蛋白質組信息分析及套用算法研究》是依託湖南大學，由廖波擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

• 中文名：蛋白質組信息分析及套用算法研究
• 項目類別：面上項目
• 項目負責人：廖波
• 依託單位：湖南大學

中文摘要

隨著蛋白質組學研究近年高速的發展,需要進行蛋白質結構的預測、功能的識別、以及生物標記物的預測與鑑別等，傳統的生物數據分析處理方法無法滿足後基因組時代的需要，因此發展能快速計算分析獲取蛋白質組信息的生物信息學方法成為關鍵性的基礎問題。我們將基於代數學中的同態思想和物理學中的粗粒化思想，綜合運用數學化的形式方法、系統生物學方法和信息學方法建立模型：利用序列的圖形表示給出序列信息的一種離散度量方法，建立蛋白質組信息模型；利用模糊理論建立新的基於蛋白質組信息的系統發育分析模型及其統計校驗方法；根據胺基酸的分類和重要的理化性質給出蛋白序列的編碼方式並研究蛋白序列的L-Z複雜度，有效提取蛋白序列中胺基酸的相對分子量、等電點以及疏水性等信息，並初步套用於惡性腫瘤相關序列的相似性分析、蛋白質亞細胞定位預測、結構和功能靶標預測等熱點領域；利用序列的新型表達模式給出點突變分析方法，尋求產生點突變的數學機理。

結題摘要

隨著蛋白質組學研究近年高速的發展,需要進行蛋白質結構的預測、功能的識別、以及生物標記物的預測與鑑別等，傳統的生物數據分析處理方法無法滿足後基因組時代的需要，因此發展能快速計算分析獲取蛋白質組信息的生物信息學方法成為關鍵性的基礎問題。我們將基於代數學中的同態思想和物理學中的粗粒化思想，綜合運用數學化的形式方法、系統生物學方法和信息學方法建立模型：利用序列的圖形表示給出序列信息的一種離散度量方法，建立蛋白質組信息模型；利用模糊理論建立新的基於蛋白質組信息的系統發育分析模型及其統計校驗方法；根據胺基酸的分類和重要的理化性質給出蛋白序列的編碼方式並研究蛋白序列的L-Z複雜度，有效提取蛋白序列中胺基酸的相對分子量、等電點以及疏水性等信息，並初步套用於惡性腫瘤相關序列的相似性分析、蛋白質亞細胞定位預測、結構和功能靶標預測等熱點領域；利用序列的新型表達模式給出點突變分析方法，尋求產生點突變的數學機理。