《計算蛋白質組學研究》是依託同濟大學,由李通化擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名:計算蛋白質組學研究
- 項目類別:面上項目
- 項目負責人:李通化
- 依託單位:同濟大學
- 批准號:20675057
- 研究期限:2007-01-01 至 2009-12-31
- 申請代碼:B0310
- 支持經費:28(萬元)
- 負責人職稱:教授
《計算蛋白質組學研究》是依託同濟大學,由李通化擔任項目負責人的面上項目。
《計算蛋白質組學研究》是依託同濟大學,由李通化擔任項目負責人的面上項目。中文摘要本申請是關於計算蛋白質組學的基礎理論研究,針對生物質譜數據分析中存在的困難和挑戰,提出建立大規模,高通量的新穎蛋白質數據分析平台,抓住多肽保...
蛋白質組研究本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特徵,包括蛋白質的表達水平,翻譯後的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質水平上的關於疾病發生,細胞代謝等過程的整體而全面的認識,這個概念最早是在1995年提出的。蛋白質組...
《蛋白質組學研究 》是2010年5月1日科學出版社出版的圖書。該書對蛋白質組學的10年進行了綜述,並且探討了蛋白質組在一些方面的技術發展及套用。內容簡介 《蛋白質組學研究:概念、技術及套用(原書第2版)》在綜述蛋白質組學近10年...
SELDI 技術是蛋白質組學研究中比較理想的技術平台,其全稱是表面增強雷射解吸電離飛行時間質譜技術(SELDI-tof)。其方法主要如下:通常情況下將樣品經過簡單的預處理後直接滴加到表面經過特殊修飾的晶片上,既可比較兩個樣品之間的差異蛋白,...
《蛋白質組學研究――概念技術及套用》是2010年科學出版社出版的圖書,作者是(澳)M.R. 威爾金斯[等]。內容簡介 本書在綜述蛋白質組學近10年的發展歷程基礎上,探討了蛋白質組在樣品預處理、質譜鑑定、定量分析、成像分析、數據處理,...
隨著蛋白質組學研究近年高速的發展,需要進行蛋白質結構的預測、功能的識別、以及生物標記物的預測與鑑別等,傳統的生物數據分析處理方法無法滿足後基因組時代的需要,因此發展能快速計算分析獲取蛋白質組信息的生物信息學方法成為關鍵性的基礎...
《蛋白質組學研究——概念、技術及套用》是2010年5月科學出版社出版的圖書。內容簡介 在蛋白質組學水平上,對生命活動的功能執行體——蛋白質進行深入系統的研究,不僅有助於全景式地揭示生命活動的本質,而且對於研究疾病機制、發展預警...
定向蛋白質組的核心是利用串聯四級桿質譜特有的MRM掃描方式來定向檢測蛋白質,通過軟體計算要檢測蛋白質的肽對應的母子離子對,用串聯四級桿質譜進行MRM掃描,得到MRM色譜峰,一般還會進行MSMS掃描,以對這些肽的MRM進行序列確認,或利用 ...
基於質譜技術的無標記定量是蛋白質組學研究的關鍵技術之一。本項目將在收集、整理典型數據集和典型計算流程的基礎上,創新研究蛋白質組學中無標記定量質譜數據處理中的關鍵算法- - 定量信息提取算法。主要內容包括:對圖譜定量指標進行最佳化...
但現有的糖蛋白質組學研究方法無法實現核心岩藻糖化蛋白質的規模化鑑定,因而限制了該類糖蛋白作為疾病標誌物的有效篩選。為解決此問題,該實驗室錢小紅研究員課題組與中國科學院計算技術研究所賀思敏研究員課題組等合作,通過發展和最佳化目標...
定量蛋白質組學研究虛擬仿真實驗是浙江大學建設的虛擬仿真實驗課程。課程簡介 蛋白質組學研究是後基因組時代的重要研究內容之一,是一種研究細胞、組織乃至整個生物體中所表達的全部蛋白質的組成及變化規律的科學,是我校 “分子醫學實驗技術...
《蛋白質組學:研究方法與實驗方案》是2012年9月科學出版社出版的圖書,作者是Jorg Reinders等。內容簡介 隨著“蛋白質組學”這一概念的出現和發展,細胞分子網路領域的研究取得了巨大的進展,人們對此領域的認識也日益深入。然而,蛋白質...
4.5 雙向凝膠中蛋白質的轉移 4.6 雙向凝膠圖像的獲取和分析 實驗方案 參考文獻 第5章 反相高效液相色譜 5.1 RP-HPLC基於疏水相互作用分離分子 5.2 RP-HPLC標準色譜條件 5.3 微柱反相色譜——適合蛋白質組學的研究方法 實驗方案...
蛋白質組學的概念、重要意義以及研究範圍;蛋白質組學研究的一般原理和技術方法,包括雙向凝膠電泳,多維液相色譜,質譜學,序列分析,結構分析,研究蛋白質相互作用、修飾、定位和功能的方法,以及最近興起的蛋白質晶片技術。蛋白質組學的...
《蛋白質組學研究的新分析技術及其套用》是2011年中國醫藥科技出版社出版的圖書,作者是陳執中。基本介紹 版 次:1頁 數:190字 數:223000 印刷時間:2011-10-1開 本:16開紙 張:膠版紙 印 次:1I S B N:9787506751797...
《大腸癌組織樣本的蛋白質組學和轉錄組學整合研究》是依託浙江大學,由余捷凱擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 目前從轉錄組和蛋白質組的角度研究大腸癌腫瘤相關標誌物已有較多成果,但基因表達譜和蛋白質組的整合分析將更有...
1.切點準確率99%;2.每個切膠列表有9600個蛋白點,連續切取384點,10秒內完成切取並轉移至96孔板;3.多功能雷射成像儀包括綠、紅和藍雷射,可一次掃描4色螢光。主要功能 蛋白質組學研究,用於銀染、考染、螢光染色和已脫色膠的...
蛋白質又分為完全蛋白質和不完全蛋白質。缺乏必需胺基酸或者含量很少的蛋白質稱不完全蛋白質,如谷、麥類、玉米所含的蛋白質和動物皮骨中的明膠等。相關計算 原子數 由m個胺基酸,n條肽鏈組成的蛋白質分子,至少含有n個—COOH,至少...
splice variants)等,預計由5萬種不同的蛋白質分子組成;另一部分是組織滲漏蛋白,可能包括全部人類蛋白質組.如果按5萬種基因產物計算,平均每種產生10種不同的結構,就會有50萬種蛋白質分子;血漿中出現序列不同免疫球蛋白的可能性有近...
《基於智慧型計算的蛋白質及其相互作用算法分析》是2020年科學出版社出版的圖書,作者是張曉龍,林曉麗,胡靜。內容簡介 隨著蛋白質組學研究的不斷深入,智慧型計算方法已成為蛋白質組學的支撐技術。本書系統地闡述目前蛋白質及其相互作用的主要...
方案20用膠體金染色膜上的蛋白質196 網路上有關雙向電泳的信息資源197 參考文獻200第5章反相高效液相色譜203 5.1RPHPLC基於疏水相互作用分離分子204 5.2RPHPLC標準色譜條件205 5.3微柱反相色譜——適合蛋白質組學的研究方法213 ...
用MTT法檢測了β-欖香烯對MKN45和SGC7901胃癌細胞的毒性作用,計算了用於兩株細胞放療增敏劑體外實驗研究的給藥濃度。本項目已經從細胞水平證明了β-欖香烯能夠增加MKN45人胃癌細胞對放射的敏感性,已經建立了人胃癌細胞的裸鼠移植瘤...
由美國西奈山伊坎醫學院遺傳學和基因組學教授王沛擔任主要通訊作者的研究論文於2020年11月26日刊登於《細胞》,這是一項空前規模的“蛋白質基因組學”研究,分析了兒科腦瘤涉及的蛋白質、基因和RNA轉錄,以便對這類腫瘤有更全面的了解。...
7.4 蛋白質三級結構預測 7.4.1 同源模擬 7.4.2 摺疊識別 7.4.3 從頭計算法 本章小結 思考題 參考文獻 第8章 互作蛋白質組研究技術 8.1 蛋白質-蛋白質相互作用的離體研究技術 8.1.1 蛋白質親和層析 8.1.2 表面等離子...
3. 蛋白質研究的新技術與新方法(C類)發展蛋白質定性基礎上的高精度定量、高分辨結構測定、相互作用和動態過程研究的新技術新方法。特別關注生物大分子複合體、膜蛋白、修飾蛋白質的結構分析和相互作用研究的實驗和理論計算新技術新方法...
代謝組學在臨床疾病診斷、病理機制的探索、治療新靶點的發現等研究中發揮了極為重要的作用,但同時也存在缺陷,代謝組學的發展迫切需要發展新的方法。本項目建立了蛋白質-代謝物相互作用的代謝組學新方法,通過蛋白質-小分子相互作用,...
第六章 蛋白質組學相關的生物信息學 第一節 2-D資料庫 第二節 支持質譜數據的蛋白質鑑定的資料庫 第三節 分析蛋白與蛋白相互作用的資料庫 第四節 基於質譜技術的計算蛋白質組學 參考文獻 第七章 不同水平上的蛋白質組學 ...
《蛋白質組學方法》是2012年科學出版社出版的圖書,作者是中國生物技術發展中心、南開大學。內容簡介 《蛋白質組學方法》對研究人員進一步發展這些技術具有一定的指導意義。本書是一本蛋白質組學方法的入門讀物,我們希望借本書的編寫和...
2013年7月—2016年9月,中科院計算所,助理研究員 2006年9月—2013年7月,中國科學院大學計算機學院,工學博士 2002年9月—2006年7月,吉林大學計算機科學與技術學院,本科生 研究方向 計算蛋白質組學 主要成就 學術成果 相關研究工作...