《lncRNA在神經幹細胞乾性維持和分化中的作用及調控機制》是依託同濟大學，由羅玉萍擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：lncRNA在神經幹細胞乾性維持和分化中的作用及調控機制
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：羅玉萍
- 依託單位：同濟大學
中文摘要,結題摘要,
中文摘要
長鏈非編碼RNA(lncRNA)在哺乳動物的神經系統中廣泛表達,對神經系統的發育具有極其重要的作用。目前人們採用全腦或不同神經解剖學區域來研究神經系統lncRNA。由於同一神經解剖學區域細胞的不均一性，上述研究不能檢測到在神經系統特定細胞類群低豐度表達且起關鍵調控作用的lncRNA。我們通過單細胞高通量深度測序，首次從小鼠側腦室室管膜下區（SVZ）鑑定了600多個新的細胞類型特異的多外顯子lncRNA,並採用WGCNA方法找出了9個與幹細胞乾性維持和分化相關的蛋白質有關聯的lncRNA。本項目擬用原位雜交技術和定量PCR方法比較這些lncRNA在小鼠腦內和體外培養的細胞中的表達譜，通過過表達或表達下調、以及製備lncRNA基因敲除鼠在體外和體內研究這些lncRNA的功能，揭示lncRNA在幹細胞乾性維持和分化中的作用機理，構建lncRNA與蛋白質和轉錄因子相互作用的調控網路。
結題摘要
長鏈非編碼RNA(lncRNA)在基因表達調控中發揮了重要的作用。雖然人們對哺乳動物神經系統中的lncRNA進行了研究並發現其在神經系統發育中的作用，但對在神經系統特定細胞類群低豐度表達且起關鍵調控作用的lncRNA的功能知之甚少。我們通過單細胞高通量深度測序，從小鼠側腦室室管膜下區（SVZ）鑑定了多個新的細胞類型特異的多外顯子lncRNA,並找出了與幹細胞乾性維持和分化相關的蛋白質有關聯的lncRNA lnc-95，lnc-101，lnc-158，lnc-164，lnc-176，lnc-231，lnc-247，lnc-422，lnc-784。我們採用原位雜交技術和定量PCR方法分析了這些lncRNA在小鼠腦內不同神經解剖學區域和體外培養的細胞中的表達譜，發現了這些lncRNA在神經系統特定細胞類群中的表達特徵。lncRNA的過表達或表達下調、Western Blot、神經幹細胞增殖及分化和免疫組化實驗的結果表明，這些lncRNA通過調控相關基因的表達來影響VEGF，TGF-B，NF-kappa-B等信號通路從而調控神經幹細胞乾性維持和分化。我們發現並鑑定了調控神經幹細胞乾性維持和分化的lncRNA，研究了lncRNA 在幹細胞乾性維持和分化中的作用機理，揭示了lncRNA在哺乳動物神經發育中的重要作用。
