《調節低氧誘導因子1轉錄活性的銅結合蛋白的探索》是依託四川大學，由張文菁擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：調節低氧誘導因子1轉錄活性的銅結合蛋白的探索
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：張文菁
- 依託單位：四川大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
HIF1是機體應對低氧狀況的核心轉錄因子，直接調控一百多個基因的轉錄，功能涉及血管新生、能量代謝、細胞增殖和細胞凋亡等多方面。低氧時，調控HIF1轉錄特異性的內源性機制尚不清楚。康裕建教授團隊前期研究發現銅是HIF1轉錄特異性的調控機制之一。銅通過調控HIF1與下游基因的低氧反應元件結合，特異性調控HIF1下游誘導血管新生的VEGF等基因表達。細胞內沒有游離的銅，那么起作用的銅結合蛋白是什麼？我們前期實驗用質譜結合生物信息學分析找個兩個蛋白：NCOA5和EWS。我們假設這兩個蛋白介導了銅對HIF1活性的調節。本項目將以人臍靜脈內皮細胞和小鼠心梗模型為研究對象，用基因沉默、過表達、ChIP等方法探索NCOA5和EWS與HIF1轉錄活性調控的關係；用ChIP-Sequencing研究這兩個蛋白調控HIF1轉錄特異性的機制；最後利用心梗動物模型驗證這兩個蛋白調節HIF1活性和修復心肌梗死的作用。
結題摘要
低氧誘導因子-1（HIF-1）是機體應對低氧狀況的核心轉錄因子，直接調控著100多個基因的轉錄，功能涉及血管新生、能量代謝、細胞增殖和細胞凋亡等多方面。低氧時，調控HIF-1轉錄特異性的內源性機制尚不清楚。康裕建教授團隊前期研究發現微量元素銅是HIF-1轉錄特異性的調控機制之一。細胞內沒有游離的銅離子，那么起作用的銅結合蛋白是什麼？我們前期實驗用CoIP和IMAC結合質譜分析得到9個可能的銅結合蛋白，再根據軟體預測和生物信息學分析找個兩個蛋白：NCOA5和EWS。本項目在前期研究基礎上，重點研究並闡明了銅調控HIF-1轉錄選擇性的機制，發現銅通過調控HIF-1與下游基因的低氧反應元件（HRE）結合，特異性的調控部分HIF-1下游基因的表達。根據銅是否參與調控，將HIF-1下游基因分為銅依賴基因和銅非依賴基因。同時，採用ChIP-Sequencing和RNA-Sequencing結合的方法，在全基因組水平上探討了銅調控HIF-1轉錄活性的情況。此外，本項目就NCOA5的研究發現，NCOA5與HIF-1蛋白結合，並且在心梗後不同時期表達和定位發生改變，非常有可能參與了銅對HIF-1轉錄活性的調控。
