結合位點(binding site)是2018年公布的生物物理學名詞。
基本介紹
- 中文名:結合位點
- 外文名:binding site
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年
結合位點(binding site)是2018年公布的生物物理學名詞。
結合位點(binding site)是2018年公布的生物物理學名詞。定義分子中能與配體形成穩定相互作用的特定部位。蛋白質的結合位點通常是由多肽鏈上的一些相互分離的胺基酸殘基通過肽鏈摺疊在空間上聚集到一起,形成特定的空間...
核糖體結合位點是指起始密碼子AUG上游的一段富含嘌呤的非翻譯區。包含SD(Shine-Dalgarno)序列。RBS序列(生物):所謂RBS,是指起始密碼子AUG上游的一段非翻譯區.在RBS中有SD(Shine-Dalg-arno)序列,長度一般為5個核苷酸,富含 G,A,該...
氯黴素結合與定位在亞基交界面的一個深深的袋子結構中,該結構叫做氯黴素結合位點。儘管形成袋子結構的大多數胺基酸位於形成交界面的其中的一個亞基中,在催化中起關鍵作用的195位的組氨酸卻位於另外的一個亞基。氯黴素的苯環160亮氨酸,172...
DNA結合位點(英語:DNA binding sites)是存在於DNA上的與其它分子相綁定的各類結合位點。DNA結合位點與其它結合位點的區別在於:(1)它們是DNA序列(如一個基因組)中的一部分;(2)它們被DNA結合蛋白所綁定。DNA結合位點常常與一類...
《轉錄因子結合位點(TFBS)研究》是鄧明華為項目負責人,北京大學為依託單位的面上項目。科研成果 項目摘要 本項目進行轉錄因子結合位點(TFBS)的序列分析。旨在發展一套機率模型,發掘TFBS位點間的相關性,從模型上克服位置特異打分矩陣(PSSM...
《蛋白質與蛋白質的結合位點結構比對方法研究》是依託吉林大學,由周柚擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質結合位點結構比對方法的研究是當今結構基因組學的重要研究內容之一,對於蛋白質結構和功能研究有著重要的意義。申請...
《基於胺基酸接觸能網路的蛋白質結合位點分析》是依託蘇州大學,由嚴文穎擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 很多重要的生物過程都是在蛋白質-蛋白質相互作用的參與下完成的,研究這種相互作用關係對理解疾病發生原因、預測藥物靶點都...
《MHC多肽結合位點鑑定及超類型識別》是依託汕頭大學,由沈文君擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 人類白細胞抗原(HLA)是人類的MHC。主要功能是將多肽遞呈到細胞表面以供T細胞識別。識別抗原肽對開發表位疫苗起到重要的作用,...
《蛋白質相互作用及結合位點的預測方法研究》是依託天津大學,由郭菲擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質相互作用研究是蛋白質組學的一個重要內容。蛋白質在生命活動過程中通過相互作用實現特定的生物功能。如何更有效地對蛋白...
《蛋白質結合位點預測及輔助分子對接》是化學工業出版社出版圖書。內容簡介 蛋白質結合位點的識別對深入理解蛋白質的生物學功能具有重要的意義。本書致力於從描述特徵、殘基定義和數據篩選三個方面進行最佳化,從而構建蛋白質結合位點預測的有效...
《轉錄因子TDF1結合位點分析及直接調控下游基因鑑定》是依託上海師範大學,由楊仲南擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 轉錄因子TDF1在花葯發育過程中控制胼胝質的降解及花粉外壁的形成。本項目將通過生化方法分析並鑑定TDF1的結合位點,通過...
《尿素通道蛋白 B 與小分子抑制劑結合位點的確定》是依託北京大學,由李敏擔任負責人的青年科學基金項目。項目摘要 尿素通道蛋白是特異性通透尿素的膜蛋白,在尿濃縮機制中發揮重要作用,可研發成為新的利尿藥作用靶點。本實驗室前期研究...
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《GP130 與細胞因子結合位點的多樣性和專一性研究》是依託中國人民解放軍軍事科學院軍事醫學研究院,由倪長源擔任項目負責人的面上項目。 中文摘要 IL-6家族細胞因子識別其共用的膜受體gp130的表位不詳。本研究擬對gp130進行改構和表達...
《轉錄因子結合位點序列基元挖掘的計算方法研究》是依託同濟大學,由黃德雙擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 轉錄因子能夠調控基因表達的模式,因而是細胞調控網路的關鍵組成部分之一。轉錄因子和DNA序列間的結合關係是具有序列偏好性的,...
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《跨膜型TNF-a 結構- 功能及其與受體結合位點的研究》是依託華中科技大學,由李卓婭擔任項目負責人的面上項目。 項目摘要 利用定點突變技術對跨膜型TNF-a進行區段缺失,並觀察這些突變體的胞毒效應,以分析其峁雇δ艿墓叵擔揮眉...
《生脈方對CYP3A4酶不同結合位點的差異影響及其機理研究》是依託南昌大學,由夏春華擔任項目負責人的地區科學基金項目。項目摘要 中藥多組分可能同時作用於CYP酶的不同結合位點,對其相對應的代謝通路產生選擇性影響,最終對該酶介導的體內...
ChIP-seq,指的是結合位點分析法,作為研究體內蛋白質與DNA相互作用。染色質免疫共沉澱技術(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也稱結合位點分析法,是研究體內蛋白質與DNA相互作用的有力工具,通常用於轉錄因子結合位點或組蛋白特異性修飾...
結合位點 cAMP反應元件(cAMP response element, CRE) 是一段由30bp 左右的DNA 片段構成的cAM P 應答序列, 這段序列含有高度保守的5′2 TGACGTCA 23′的8 鹼基迴文結構, 其主要存在於基因的啟動子與增強子上, 如即刻早期基因( I...
轉錄因子(transcription factor)是一群能與基因5`端上游特定序列專一性結合,從而保證目的基因以特定的強度在特定的時間與空間表達的蛋白質分子。結合位點 轉錄因子的結合位點(transcription factor binding site,TFBS)是轉錄因子調節基因表達...
通常與含有第一個胺基酸甲硫氨酸的氨醯基-tRNA結合的核糖體小亞基與AUG密碼子結合,並招募核糖體大亞基。核糖體含有三個RNA結合位點:即A、P和E位點。A位點結合氨醯基-tRNA或終止釋放因子;P-位點結合肽基-tRNA(與tRNA結合的tRNA)...
而且,ChIP與其他方法的結合,擴大了其套用範圍:ChIP與基因晶片相結合建立的ChIP-on-chip方法已廣泛用於特定反式因子靶基因的高通量篩選;ChIP與體內足跡法相結合,用於尋找反式因子的體內結合位點;RNA-ChIP用於研究RNA在基因表達調控中的...
SRP上有三個結合位點:信號肽識別結合位點,SRP受體蛋白結合位點,翻譯暫停結構域。形態特徵 存在於細胞質中,是一種細長形的含RNA蛋白,信號識別顆粒SRP由6條多肽鏈(SRP54, SRP19, SRP68, SRP72,SRP9, SRP14),300多個鹼基的7S...
OPN啟動子包括1個TATA盒(-28-22)、1個顛倒的CCAAT盒(-55-50)及1個GC盒及多種轉錄因子的結合位點。API結合部位是高度保守的增強子樣元件。OPN基因啟動子上含有多個應答元件,如VitD反應元件,糖皮質激素反應元件,Ras反應元件,...
沉默子由原沉默子ORC,Abf1,Rap1結合位點中兩個或三個組成。本研究前期工作表明,原沉默子單獨存在雖無法形成基因沉默,但是與沉默子相互作用下,Abf1和ORC結合位點能夠在其兩側形成基因沉默,而Rap1結合位點只在與沉默子相互作用側形成...
IKK將細胞內NF-κB·IκB複合物的IκB亞基調節位點的絲氨酸磷酸化,使得IκB亞基被泛素化修飾,進而被蛋白酶降解,從而釋放NF-κB二聚體。自由的NF-κB會進入細胞核,與有NF-κB結合位點的基因結合,啟動轉錄進程。NF-κB也會激活I...
α亞單位穿過細胞膜,一端暴露在細胞膜表面,具有胰島素結合位點。β亞單位由細胞膜向胞漿延伸,是胰島素引發細胞膜與細胞內效應的功能單位。胰島素與亞單位結合後,β亞單位中酪氨酸激酶被激活,使受體磷酸化,產生介體,調節細胞內酶系統...