氯黴素結合與定位在亞基交界面的一個深深的袋子結構中,該結構叫做氯黴素結合位點。儘管形成袋子結構的大多數胺基酸位於形成交界面的其中的一個亞基中,在催化中起關鍵作用的195位的組氨酸卻位於另外的一個亞基。氯黴素的苯環160亮氨酸,172位異亮氨酸的側鏈結合,其二氯基團和105位的丙氨酸,146位的天冬酞胺發生范德華力相互作用。
基本介紹
- 中文名:氯黴素結合位點
- 所屬學科:生物學
輕基和乙酞胺與水分子形成氫鍵,這些氫鍵位於口袋結構極性的一側。酶與氯黴素之間只有兩個氫鍵相連,一個位於乙酞胺的氧與25位酪氨酸的經基側鏈之間,另一個位於氯黴素C3位的經基和195位組氨酸咪哇基的N3之間。距離氯黴素C3位的羥基3.5埃的範圍記憶體在兩個水分子。