《轉錄因子結合位點(TFBS)研究》是鄧明華為項目負責人，北京大學為依託單位的面上項目。
基本介紹
- 中文名：轉錄因子結合位點(TFBS)研究
- 項目類別 ：面上項目
- 依託單位 ：北京大學
- 項目負責人：鄧明華
科研成果 ,項目摘要,
科研成果
序號 | 標題 | 類型 |
|---|---|---|
1 | Nonequilibrium Model for Yeast Cell Cycle. | 會議論文 |
2 | Searching for bidirectional promoters in Arabidopsis thaliana. | 會議論文 |
3 | Conservation and implications of eukaryote transcriptional regulatory regions across multiple species | 期刊論文 |
4 | REMAS: a new regression model to identify alternative splicing events from exon array data. | 會議論文 |
5 | Using a stochastic Adaboost algorithm to discover interactome motif pairs from sequence. | 會議論文 |
6 | 晶片數據標準化方法比較 | 期刊論文 |
7 | On Design of Oligonucleotide SNP Arrays and Methods for Genotype Calling. | 會議論文 |
8 | A Method to Correct Systematic Bias in Affymetrix SNP Arrays. | 會議論文 |
9 | Diffusion kernel based logistic regression models for protein function prediction | 期刊論文 |
10 | k-gram方法識別MicroRNA前體 | 期刊論文 |
11 | 轉錄因子結合位點生物信息學研究進展。被雜誌接受。 | 期刊論文 |
12 | Stochastic model of yeast cell-cycle network | 期刊論文 |
13 | Nonlinear cooperation of p53-ING1-induced bax expression and protein S-nitrosylation in GSNO-induced thymocyte apoptosis: a quantitative approach with cross-platform validation | 期刊論文 |
14 | Inferring domain-domain interactions from multiple biological data sources | 期刊論文 |
項目摘要
本項目進行轉錄因子結合位點(TFBS)的序列分析。旨在發展一套機率模型，發掘TFBS位點間的相關性，從模型上克服位置特異打分矩陣（PSSM）在TFBS描述上的局限性，同時融合多個物種啟動子序列上的分子進化模型，給出高精度的TFBS檢測算法。在轉錄因子結合位點預測的基礎上，研究基因調控序列與基因表達水平的關係，建立基因表達水平預測的系統生物學模型，探索基因調控機制。在轉錄因子結合位點預測的基礎上，分析調控區域的分子進化規律以及TFBS在基因啟動子區域上的分布規律，建立啟動子預測模型，對擬蘭芥、水稻等基因組進行啟動子標註，為其功能基因組研究提供基礎。
