《有約束多項分布轉錄因子結合位點識別》是依託西安電子科技大學，由劉立芳擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：有約束多項分布轉錄因子結合位點識別
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：劉立芳
- 依託單位：西安電子科技大學
- 批准號：60705004
- 申請代碼：F0605
- 負責人職稱：教授
- 研究期限：2008-01-01 至 2010-12-31
- 支持經費：20（萬元）
中文摘要
本項目研究轉錄因子結合位點的從頭識別問題。首先構建有約束多項分布motif模型，以實驗統計為參考，充分考慮motif內各位點之間的相關性，以及模體的局部構象信息，增強motif模型描述生物學特徵的準確性；其次研究基於有約束多項分布motif模型的機器學習問題，建立Gibbs抽樣、現代進化算法、輔助生物信息有機融合的混合學習算法，著重提高對於長序列和特徵微弱motif識別的準確程度；為了提供可靠的統計顯著性評價，研究轉錄因子結合位點的分布特徵，設計熵值P-value的漸進逼近的數值計算方法，提高計算的精確度並降低計算的時間複雜度，並探討P-value與識別準確程度之間的相關性。本項目給人們進一步理解基因表達調控網路提供了一種非常有效的輔助手段，對於研究基因的調控是有重要意義的。
