基因組掃描是從全基因組的遺傳標記中尋找與特定性狀或基因緊密連鎖的標記,並在染色體上定位相關基因的方法。
中文名稱 | 基因組掃描 |
英文名稱 | genome scanning |
定 義 | 從全基因組的遺傳標記中尋找與特定性狀或基因緊密連鎖的標記,並在染色體上定位相關基因的方法。 |
套用學科 | 遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科) |
基本介紹
- 中文名:基因組掃描
- 所屬學科:遺傳學
基因組掃描是從全基因組的遺傳標記中尋找與特定性狀或基因緊密連鎖的標記,並在染色體上定位相關基因的方法。
中文名稱 | 基因組掃描 |
英文名稱 | genome scanning |
定 義 | 從全基因組的遺傳標記中尋找與特定性狀或基因緊密連鎖的標記,並在染色體上定位相關基因的方法。 |
套用學科 | 遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科) |
基因組錯配掃描 基因組錯配掃描是遺傳學用語。
《新的遺傳性痙攣性截癱疾病基因的定位與克隆》是依託中南大學,由沈璐擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 遺傳性痙攣性截癱(SPG)是我國常見的具有高度遺傳異質性的神經系統遺傳病。本課題擬套用全基因組掃描及基因家族- - 候選...
中心建立了集基因組學,生物信息學和蛋白質組學於一體的,具有國際一流水平的技術平台,包括全國範圍的遺傳資源樣品收集網路,大規模測序平台,全基因組掃描分型,疾病基因精細定位克隆,高通量SNP檢測,大規模全長新基因的克隆,DNA晶片,...
課題組在連續10年高發區流行病學調查、家系收集與中密度STRs標記全基因組掃描的基礎上,獲得2個候選區,其中1個候選區經精細掃描定位出食管癌連鎖易感區。本申請項目旨在增加家系樣本,利用更密集的STRs和SNPs標記對另1個候選區進行精細...
我們收集了62個高度遠視家系,分析了部分候選基因,並對1個常染色體顯性遺傳PHH(adPHH)大家系進行了初步定位研究,排除了與相關疾病位點(如小眼球)的連鎖關係。. 本課題擬在已有工作基礎上,首先通過全基因組掃描連鎖分析,確定首個...
我們已經收集了大量RP家系和散發病例,並已完成部分家系的STR/SNP全基因組掃描分析;在此基礎上,擬通過SNP進一步遺傳連鎖分析和候選基因篩選的方法來定位致病基;同時採用基因組外顯子測序技術檢測1-2個大家系以鑑定中國人RP致病基因,並...
本研究將進行全基因組掃描、致病基因的單倍型分析,精細定位這一新的RP致病基因位點;進一步篩選候選基因的突變檢測,以及突變與疾病共分離分析,並在該家系及其他家系和散發病例中進行突變檢測,以克隆該RP家系的新的致病基因。本項目的順利...
影子基因犬是一隻貴賓犬。2003年9月,影子基因犬接受基因組掃描,它在在基因組研究史上占據一席之地。研究 科學家克雷格·文特爾也曾養過狗並且是3條。此外,他還對為生物體基因組排序產生濃厚興趣。2003年9月26日,基因組研究所(...
表明還有相當多的致病基因及相關基因有待於鑑定和克隆。目前我們在河南、湖北和安徽等地鑑定了5個常染色體顯性遺傳癲癇家系,對1個信息量高的家系(模擬LOD值4.29)連鎖分析排除所有已知癲癇致病基因和位點,全基因組掃描、單倍型分析將該...
《腓骨肌萎縮症致病基因的定位與克隆》是依託中南大學,由蕭劍峰擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 本研究套用基因組掃描及連鎖分析方法對腓骨肌萎縮症的致病基因新位點進行精細定位;套用基因家族同源或同功的新基因;套用定位候選...
《散發性結直腸癌相關基因精細定位及候選克隆》是依託上海交通大學,由彭志海擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 在已完成的自然科學基金項目研究中,通過對散發性結直腸癌的全基因組掃描,發現三十餘個腫瘤發生與轉移相關區域,平均精度達...
傳統上通過外源種質表型鑑定、染色體定位和染色體片段轉移等手段可利用外源抗性基因,但需要較長時間。近年來,利用品種資源表型鑑定和基因組掃描,通過QTL定位可發掘優異基因。然而,相對缺乏品種資源抗性分級性狀基因發掘的統計方法。本項目在...
目前已有一個基因(SSH1)被克隆,另有3個致病基因位點被定位。我們鑑定了一個散播性、淺表性、光敏性汗孔角化症家系,連鎖分析結果排除了以上已知位點,通過全基因組掃描,我們初步將這一家系的致病基因定位在1號染色體,提示這是一個新...
尋找分子遺傳標記的主要方法有候選基因法和基因組掃描法。1. 候選基因法作為某個性狀的候選基因通常是一些已知其生物學功能和核酸序列的基因,它們參與性狀的生長發育過程。這些基因可能是結構基因、調節基因或是在生化代謝途徑中影響性狀表達...
經過6年的發展,目前已經擁有6大分子生物學平台:DNA 測序;Oligo DNA 和 TaqMan-MGB Probe的合成;實時螢光定量PCR分析;SNPs發現和驗證;基因組掃描(Genescan);蛋白質組學的 MALDI-TOF MS測定分子量,肽質量指紋圖譜,PSD-MALDI-...
Forkhead box p2(FOXP2)基因是FOX家族成員之一,在胎兒和成人腦中高表達,參與人類語言功能的發育。該基因定位於染色體7q31,這是國際上基因組掃描研究結果中重複性最好的孤獨症連鎖區域之一。這些證據提示FOXP2基因可能是孤獨症的易感...
螢光標記自動測序技術的發展使得微衛星DNA的基因分型變得快速、準確,從而大大地提高了微衛星標記分型效率和準確率,同時節約了實驗成本和時間,使得套用微衛星進行了大規模基因組掃描成為可能。優點 衛星DNA具有很多優點,然而如何獲得所需要...
取得以下主要結果:1)完成其雌成蜂毒液小肽組學分析,及小肽組分的篩選與鑑定;2)利用全基因組掃描,完成蝶蛹金小蜂抗菌肽基因的鑑定、注釋與進化分析;3)成功克隆蝶蛹金小蜂毒液源幾丁質結合蛋白PpCBP、Pacifastin絲氨酸蛋白酶抑制因子...
《RASSF6-KRAS協同抑制胃癌發生與進展分子機制研究》是依託上海交通大學,由溫玉剛擔任項目負責人的面上項目。項目摘要 課題組前期通過多平台全基因組掃描及生物信息學分析,篩選出新的胃癌相關基因RASSF6。經qPCR、免疫印跡驗證提示93.75%...
主持構建了覆蓋《中國豬品種志》記載的所有現存地方豬種的基因組DNA庫,在此基礎上系統研究了中國地方豬生長、抗病和肉質種質遺傳特性,並深入闡明了中國地方豬棕褐毛色形成的獨特遺傳機制。主持構建了大規模家豬經濟性狀基因定位資源群體,...
但因為免疫沉澱的DNA量較少,所以在研究時通常要用PCR方法擴增DNA探針,再進行整個基因組掃描。還可以把沉澱的DNA克隆到載體中,進行測序,尋找該序列附近的開放閱讀框,發現新的基因調節序列。隨著人類基因組測序工作的基本完成,研究目的...
在國際上第一次利用全基因組掃描策略研究了中國華東地區漢族人2型糖尿病相關基因,並發現9號染色體上存在著與2型糖尿病連鎖的位點(D9S171和D9S175),同時,該課題還利用雙向測序技術對連鎖區域內部分候選基因進行SNP篩查,並發現位於RO...