《食管癌第二候選連鎖易感區精細掃描研究》是依託汕頭大學，由張國紅擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：食管癌第二候選連鎖易感區精細掃描研究
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：張國紅
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
食管癌是嚴重危害國人生命與健康的最常見惡性腫瘤之一。研究證實沿海潮汕和內陸太行山食管癌高危人群有著相近的遺傳背景，提示兩高危人群可能共同遺傳了祖先染色體上增加罹患食管癌風險的位點。課題組在連續10年高發區流行病學調查、家系收集與中密度STRs標記全基因組掃描的基礎上，獲得2個候選區，其中1個候選區經精細掃描定位出食管癌連鎖易感區。本申請項目旨在增加家系樣本，利用更密集的STRs和SNPs標記對另1個候選區進行精細掃描與連鎖分析，以肯定與縮小連鎖易感區，為接下來鑑定出可用於食管癌易感個體篩選的分子遺傳學標記奠定基礎。
結題摘要
對原有6個食管癌大家系繼續追蹤、隨訪、補充血樣，對家系中已死亡個體DNA進行了全基因組高保真擴增,並新增食管癌家系6個。利用5個SNP替代原有全基因組掃描最高LOD值STR標記，在新增6個家系精細掃描，連鎖分析發現LOD值0.78，NPL值1.58；利用9個STR標記，對累計的12個家系精細掃描發現，LOD值從1.71上升到2.20 ，NPL值從1.58上升到2.55，超過2.0，且單體型與表型在部分家系中共分離，家系間單體型區域有重疊，重疊區內還有DNA修復基因N4BP2。候選區鄰近食管癌全基因組關聯基因ADH1B Arg47His位點的Meta分析發現，ADH1B位點為食管癌易感位點，結合飲酒增加食管癌發病風險，但是該標記位點在家系中連鎖分析，LOD值為-0.603，否定了該位點是家族性食管癌易感位點。該項目進一步肯定了候選區與食管癌易感性間的連鎖，家系間重疊單體型區域縮小了連鎖區範圍，確定了N4BP2、LOC344967等候選基因，為進一步發現易感突變位點提供了強有力的證據與方向。
