亞硫酸氫鹽測序（bisulfite sequencing）是2018年公布的生物物理學名詞，出自《生物物理學名詞》第二版。
基本介紹
- 中文名：亞硫酸氫鹽測序
- 外文名：bisulfite sequencing
- 所屬學科：生物物理學
- 公布時間：2018年
定義,出處,
相關詞條
- 亞硫酸氫鹽測序
亞硫酸氫鹽測序（bisulfite sequencing）是2018年公布的生物物理學名詞，出自《生物物理學名詞》第二版。定義檢測細胞或組織中全部染色體DNA上甲基化情況的技術。基於亞硫酸氫鹽能使DNA中未發生甲基化的胞...
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- 甲基化檢測
用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA，所有未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶不變；隨後設計針對甲基化和非甲基化序列的引物進行PCR。通過電泳檢測MSP擴增產物，如果用針對處理後甲基化DNA鏈的引物能得到擴增片段，則說明該位點存在甲基化；反之，說明被檢測的位點不存在甲基化。2．亞硫酸氫鹽測序法（...
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本研究以3月齡已分化的雌性尼羅羅非魚次發性逆轉模型為基礎，通過Bisulfite-seq、CHIP-seq和miRNA、轉錄組測序和生物信息學分析，研究了性腺細胞重編程過程中的DNA甲基化、組蛋白修飾和miRNA調控表觀遺傳修飾在其中發揮的作用，並通過亞硫酸氫鹽測序、qPCR以及基因敲除技術進一步驗證。取得以下主要結果：（1）通過正常雌雄...
- 子宮內膜異位症惡變:基於系譜分析的進化樹推斷
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- IAA調控棉纖維起始與分化發育的表觀遺傳機制研究
本項目研究通過以胚珠內源生長素含量差異明顯的轉iaaM基因棉花種質IF11和受體材料，及通過對TM-1外施IAA，內源與外源兩條途徑，結合高通量測序技術（Small RNA-Seq）和全基因組亞硫酸氫鹽測序（WGBS）等方法解析鑑定了棉纖維起始發育階段MicroRNA及其DNA甲基化特徵，鑑定到了一批IAA表達水平不同引起棉纖維起始發育階段...
- 雙生病毒衛星DNA編碼的βC1蛋白抑制轉錄水平基因沉默研究
亞硫酸氫鹽測序（bisulfite sequencing）表明TYLCCNV基因組DNA在TYLCCNV單獨侵染的本氏煙中能夠發生甲基化，且甲基化主要集中於病毒啟動子區，包括基因間隔區(含有病毒複製起點和雙向轉錄啟動子)、AV2區(含有AV1/CP啟動子)以及AC2/AC3的啟動子區。衛星TYLCCNB與TYLCCNV共同侵染能夠降低TYLCCNV全基因組的甲基...
- 木爾坦棉花曲葉病毒C4蛋白抑制轉錄基因沉默的機理研究
通過亞硫酸氫鹽測序技術證明，CLCuMuV致病複合體和上述病毒蛋白都以不同的程度抑制植物外源基因的啟動子區域（35S啟動子）及內源轉座子（NbTnt1）的甲基化。 通過串聯親和純化和質譜連用以及體內和體外實驗鑑定CLCuMuV C4蛋白與植物甲基循環中的核心酶—S-腺苷甲硫氨酸合酶（SAMS）相互作用並抑制其酶活性。C4...
- 單倍體胚胎幹細胞
Shuai等通過亞硫酸氫鹽測序發現，AG-haESCs都含有父源印記，但這種印記不穩定。在體外（in vivo）培養過程中逐漸朝向正常受精來源的ESCs轉化，同時，母源印記開始表達。另外，在傳代過程中，一些AG-haESCs中的印記基因，如H19，會丟失部分父源印記。這種丟失會造成H19的上調，形成的轉基因小鼠的生產率低且發育遲緩...
- GNAS1低甲基化在胰島素瘤細胞增殖失控中作用的研究
進一步用亞硫酸氫鹽測序擴增子（BSAS）法對上述基因的13個甲基化差異位點和PDX1的3個甲基化差異位點進行驗證分析。兩種方法得到的數據作相關分析，皮爾森相關係數為0.852，說明用BSAS方法驗證得到的CpG位點甲基化水平與晶片結果基本相符。 Gata6在調控胰島細胞的分化調控的過程中發揮重要作用，亦參與體內一些腫瘤的形...
- 母體循環中胎兒表觀遺傳學信息靶標的篩選與檢測
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- 小鼠1號染色體新印記基因的鑑定及差異甲基化區分析
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- 家族性食管癌連鎖區易感突變篩選與鑑定
第二步執行備選方案，在家系樣本中進行遺傳性甲基化篩選：對一個珍貴大家系的5例樣本及10例病人（含不同階段共34例癌變樣本）進行簡化的表觀亞硫酸氫鹽測序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS)，得到全基因組甲基化圖譜。此外對連鎖區一個目標靶基因（谷胱甘肽轉移酶家族）的啟動子中的一段區域進行...
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通過亞硫酸氫鹽修飾PCR測序分析，我們首次發現表達沉默的NPR1基因啟動子區存在CpG島並在胃癌細胞中存在甲基化畸變。本項目即在此研究基礎上，採用啟動子螢光素酶報告分析、去甲基化藥物處理和免疫沉降的方法，分析NPR1基因表達沉默的表觀遺傳學機制；同時構建NPR1全長mRNA表達載體並轉染到表達沉默胃癌細胞中，對細胞...
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採用亞硫酸氫鹽修飾後測序測定兩組下丘腦中CRHR1啟動子區域甲基化狀況；採用染色質免疫沉澱技術檢測CRHR1基因啟動子和第一外顯子上的組蛋白賴氨酸4和賴氨酸9的三甲基化水平。結果發現：（1）行為學研究顯示建立了穩定的慢性應激致大鼠抑鬱模型。抑鬱組在應激後體重較正常組有明顯下降，在應激後糖水消耗較正常組明顯...
- 抑癌基因ECRG4在腎癌中的表達調控及功能研究
為此，本課題組擬：（1）採用RT-PCR、Western blot和免疫組化等技術，分析ECRG4基因表達及其與腎癌臨床病理特徵的相關性；（2） 使用亞硫酸氫鹽基因組測序和染色質免疫共沉澱等技術分析ECRG4基因表達的表觀調控機制；（3）利用慢病毒表達系統等技術研究ECRG4基因的功能。以期初步揭示ECRG4在腎癌發生中的作用，為...
- 分子克隆實驗指南(第四版)(原版)
方案15 為454測序製備小片段文庫 702 方案16 單鏈DNA文庫的捕獲及emPCR 708 方案17 Rochei454測序：執行一個測序運行 714 方案18 結果有效性確認 721 方案19 測序數據的履量評估 723 方案20 數據分析 724 信息欄 725 第12章 哺乳動物細胞中DNA甲基化分析 729 導言 730 方案1 DNA亞硫酸氫鹽測序法檢測單個...
- ART小鼠肝臟INSIG-SREBP-SCAP基因表達改變機制研究
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- 肝癌細胞中HLA-Ⅰ類抗原表達上調的分子機制研究
《肝癌細胞中HLA-Ⅰ類抗原表達上調的分子機制研究》是依託東南大學，由張建瓊擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 在肝癌中發現HLA-1類分子表達上調，其中A抗原上顯著，與較好預後相關，但機制未明。本項目擬用螢光素酶分析，電泳移動實驗，亞硫酸氫鹽修飾基因組測序法等技術在轉錄水平研究其上調的分子機制。為進一步...
- 分子生物學與蛋白質組學實驗技術
第五節 亞硫酸氫鹽修飾後測序法分析甲基化(116)第十章 蛋白質組學及其研究方法概述(119)第一節 蛋白質組學的概念(119)第二節 蛋白質組學研究方法概述(120)第三節 蛋白質組學在疾病研究中的套用(123)第十一章 蛋白質樣品製備技術(129)第一節 蛋白質製備的基本方法(129)第二節 細胞蛋白質的製備(139)第三...
- bisulphite
Sodium Bisulphite 亞硫酸氫鈉 ; 亞硫酸氫鈉亞硫酸氫鈉 ; 硫酸鈉 ; 重亞硫酸鈉 Bisulphite Sequencing 重亞硫酸鹽測序法 Potassium Bisulphite 亞硫酸氫鉀 bisulphite e 亞硫酸氫鹽 ammonium bisulphite 亞硫酸氫銨 bisulphite leaching 亞硫酸氫鹽浸出 Sodiun Bisulphite 亞硫酸氫鈉 Sodium Meta bisulphite foodandamp...
