子宮內膜異位症惡變:基於系譜分析的進化樹推斷

《子宮內膜異位症惡變:基於系譜分析的進化樹推斷》是依託復旦大學,由劉惜時擔任項目負責人的面上項目。

基本介紹

  • 中文名:子宮內膜異位症惡變:基於系譜分析的進化樹推斷
  • 依託單位:復旦大學
  • 項目類別:面上項目
  • 項目負責人:劉惜時
項目摘要,結題摘要,

項目摘要

雖已有諸多證據顯示子宮內膜異位症惡變與部分亞型卵巢癌的發生關係密切,但對於子宮內膜異位症惡變進程仍然了解不夠。本課題擬對部分卵巢癌患者(包括臨床病理診斷內異症惡變和合併內異症)的卵巢癌組織,內異症組織和癌灶周圍的正常卵巢組織進行基因甲基化模式多態性的檢測;基於分子鐘的原理,運用系譜分析和聚類分析方法推斷三者的遺傳關係,建立子宮內膜異位症惡性轉化進化樹。力求.1、探索子宮內膜異位症惡變與部分上皮性卵巢癌發生的關係,從表觀遺傳學角度探索子宮內膜異位症惡性轉化。2、了解目前關於子宮內膜異位症惡變的臨床病理診斷和基於甲基化進化樹的表觀遺傳學推斷之間的關係。.該課題對於從表觀遺傳學角度探索子宮內膜異位症惡性轉化與部分亞型卵巢癌發生的關係,以指導臨床更好地診斷子宮內膜異位症惡變,及對子宮內膜異位症進行積極處理,及早期干預卵巢癌具有積極意義。

結題摘要

本課題擬對部分卵巢癌患者(包括臨床病理診斷內異症惡變和合併內異症)的卵巢癌組織,內異症組織和癌灶周圍的正常卵巢組織進行基因甲基化模式多態性的檢測;基於分子鐘的原理,運用系譜分析和聚類分析方法推斷三者的遺傳關係,建立子宮內膜異位症惡性轉化進化樹。 我們用亞硫酸氫鹽測序法(bisulfite sequencing PCR, BSP)分別對卵巢型子宮內膜異位症患者,卵巢子宮內膜樣癌或透明細胞癌患者組織標本的目的DNA區域進行甲基化檢測,成功測序獲得組織標本的目的DNA區域甲基化情況,用聚類分析和基因進化樹的方法對甲基化測序結果進行統計分析,初步顯示:卵巢型子宮內膜異位症、及卵巢子宮內膜樣癌的病灶組織細胞的基因起源接近,但變異較大,很難做出確定的結論。我們也發現由於收集的標本組織量很少,再進行雷射顯微切割,獲得的組織量及提取的DNA更少,無法滿足試驗所需,並極為費時費力,且結果非常不一致。有鑒於此,我們捨棄了雷射顯微切割。 在這些情況下,我們對原課題及時進行了調整,對腺肌症/內異症的表觀遺傳學變異進行了進一步的研究。通過對腺肌症的異位內膜標本進行了免疫組化研究,發現負責DNA甲基化酶的DNMT1,DNMT3A及DNMT3B在腺肌症中的表達異常,從而提示腺肌症中DNA甲基化異常可能較為普遍,故腺肌症和內異症類似,也是一個表觀遺傳學疾病。而在小鼠腺肌症模型中,我們發現腺肌症可導致中樞神經系統的痛覺抑制功能減弱,表現在中縫大核中的GAD65陽性神經細胞數目減少及中樞敏化。而服用EGCG可改善由於腺肌症導致的中樞神經系統痛覺抑制功能減弱。 此外,我們發現內異症的異位內膜標本中負責組蛋白去甲基化酶1(LSD1)的基因呈異常高表達,且抑制該基因表達可有效抑制細胞增殖,侵襲,而在動物模型中,患有內異症的小鼠在服用LSD1拮抗劑之後可達到病灶顯著減小、改善痛覺的效果。

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