《家族性食管癌連鎖區易感突變篩選與鑑定》是依託汕頭大學，由蘇敏擔任項目負責人的面上項目。
基本介紹
- 中文名：家族性食管癌連鎖區易感突變篩選與鑑定
- 項目類別：面上項目
- 項目負責人：蘇敏
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
食管癌是嚴重危害國人生命與健康的最常見惡性腫瘤之一。食管癌發病具有顯著地域性高發與家族聚集的特徵，然而至今家族性食管癌易感基因尚未被定位與鑑定。課題組前期系統完成潮汕食管癌發病流行病學，家族聚集與遺傳模型分析、食管癌大家系全基因組與精細掃描連鎖分析、多階段病例-對照關聯研究，首次定位出家族性食管癌連鎖區以及篩選出一個關聯易感位點。在此基礎上，本申請項目繼續從家系出發，以易感位點為軸心對其上下游基因及其調控區進行測序，篩選、鑑定出在大家系中傳遞並與食管癌表型共分離的突變位點。利用核心家系與家族聚集病例-對照驗證突變位點，進一步深入研究突變對基因、細胞功能改變的影響，以揭示突變作用的具體分子機制；兼顧甲基化表觀遺傳學研究，為家族性食管癌易感個體發病風險預測模型的建立提供分子遺傳學標記。
結題摘要
廣東潮汕地區，尤其是南澳島是一罕見的食管癌高發現場和相對隔離人群，針對前期鑑定出的易感位點，本項目第一步對該位點兩側基因及其調控區進行檢測，未發現新的胚系突變，因此增加26食管癌大家系樣本連鎖區為研究對象，對其他易感位點進行測序篩選，同時增加了珍貴家系樣本的全基因組測序，篩選出了大家系中與表型共分離的突變位點，並對其中一個突變位點進行了初步的功能研究。第二步執行備選方案，在家系樣本中進行遺傳性甲基化篩選：對一個珍貴大家系的5例樣本及10例病人（含不同階段共34例癌變樣本）進行簡化的表觀亞硫酸氫鹽測序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS)，得到全基因組甲基化圖譜。此外對連鎖區一個目標靶基因（谷胱甘肽轉移酶家族）的啟動子中的一段區域進行了克隆測序，發現該基因的第5個甲基化位點在一個大家系中存在傳遞現象。共培養研究生4名，博士生1名，發表SCI文章6篇，獲得實用新型專利1項。
