《家族性食管癌候選易感C連鎖區驗證和精細掃描》是依託汕頭大學，由黃博擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名：家族性食管癌候選易感C連鎖區驗證和精細掃描
- 項目類別：青年科學基金項目
- 項目負責人：黃博
- 依託單位：汕頭大學
項目摘要,結題摘要,
項目摘要
食管癌家族聚集現象顯著，但家族性食管癌易感基因尚未定位。課題組對食管癌高發區12年的現場調查，收集到一批高質量珍貴大家系樣本；經全基因組STR掃描與連鎖分析，獲得3個候選連鎖區,命名為A、B、C。A和B區已啟動精細掃描。C區NPL接近2.0，提示支持連鎖，需精細掃描予以肯定。因食管癌屬多基因複雜性疾病，且C區在有家族史癌組織中存在高頻雜合性缺失（＞60%），提示C區可能存在與A/B區互動作用的抑癌基因，故值得深入研究。本項目擬首先評估C區連鎖可信區間；進而套用STR和TagSNP雙重標記高密度覆蓋可信區精細掃描，肯定並縮小連鎖區；並在新增大家系中驗證；最後在鎖定的C連鎖區挑選關鍵基因的功能性SNP/TagSNP進行小規模病例對照關聯研究，以發現關聯位點解析連鎖區。本項目將證實並縮小C連鎖區，為家族性食管癌易感基因發現奠定基礎。
結題摘要
近年全基因組關聯研究發現數個散發性食管癌易感基因，但具有明顯家族聚集現象的家族性食管癌易感基因尚未定位。課題組對食管癌高發區15年的現場調查，收集到一批高質量珍貴大家系樣本；經全基因組STR掃描與連鎖分析，獲得A、B、C 3個候選連鎖區。本項目旨在證實並縮小C連鎖區，為家族性食管癌易感基因發現奠定基礎。本項目首先套用STR和TagSNP雙重標記覆蓋C區精細掃描，經連鎖分析C區由14 Mb縮小至11.2 Mb，LOD值和NPL值在部分家系明顯抬升；進而在縮小的C區內挑選關鍵基因進行Sanger測序和關聯研究，發現MY基因（代號）存在一新的功能性突變位點在家系患者間傳遞，且該突變位點在576例家族史患者和年輕患者（< 55歲）中頻率為6.9‰，而在192例高齡對照樣本（> 60歲）中頻率為0；另外發現MY蛋白在34%的食管癌組織表達缺失，且該基因低表達與食管癌患者生存期短呈正相關。總之，本項目超額完成研究計畫，鎖定C區並發現MY基因很可能是家族性食管癌易感基因，為下一步探索MY基因易感機理奠定基礎。
