亞硫酸氫鹽測序(bisulfite sequencing)是2018年公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
基本介紹
- 中文名:亞硫酸氫鹽測序
- 外文名:bisulfite sequencing
- 所屬學科:生物物理學
- 公布時間:2018年
亞硫酸氫鹽測序(bisulfite sequencing)是2018年公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。
亞硫酸氫鹽測序(bisulfite sequencing)是2018年公布的生物物理學名詞,出自《生物物理學名詞》第二版。定義檢測細胞或組織中全部染色體DNA上甲基化情況的技術。基於亞硫酸氫鹽能使DNA中未發生甲基化的胞...
RRBS(Reduced representation bisulfite sequencing) ,即簡併代表性亞硫酸氫鹽測序技術。是一種用於基因組單核苷酸級別的甲基化水平分析的高效的高通量測序技術。這項技術結合了限制性內切酶和亞硫酸氫鹽測序,從而得到高CpG區域的富集信息。...
2.亞硫酸氫鹽測序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,則未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變。隨後設計BSP引物進行PCR,在擴增過程中尿嘧啶全部轉化為胸腺嘧啶,最後對PCR產物進行...
(2)亞硫酸氫鹽測序法(Bisulfite sequencing PCR,BSP)用亞硫酸氫鹽處理基因組DNA,則未發生甲基化的胞嘧啶被轉化為尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不變。隨後設計BSP引物進行PCR,在擴增過程中尿嘧啶全部轉化為胸腺嘧啶,最後對PCR產物進行...
本項目研究通過以胚珠內源生長素含量差異明顯的轉iaaM基因棉花種質IF11和受體材料,及通過對TM-1外施IAA,內源與外源兩條途徑,結合高通量測序技術(Small RNA-Seq)和全基因組亞硫酸氫鹽測序(WGBS)等方法解析鑑定了棉纖維起始發育...
我們用亞硫酸氫鹽測序法(bisulfite sequencing PCR, BSP)分別對卵巢型子宮內膜異位症患者,卵巢子宮內膜樣癌或透明細胞癌患者組織標本的目的DNA區域進行甲基化檢測,成功測序獲得組織標本的目的DNA區域甲基化情況,用聚類分析和基因進化樹的...
本項目首先採用生物信息學方法全面篩選X染色體上具有單核苷酸多態性的CpG島,然後通過亞硫酸氫鹽-PCR-克隆-測序法測定胎兒與母體組織CpG位點甲基化指數,分析胎-母組織的甲基化差異,其目的是發現X染色體上具有胎兒特異性、適用於母體血漿...
方案17 Rochei454測序:執行一個測序運行 714 方案18 結果有效性確認 721 方案19 測序數據的履量評估 723 方案20 數據分析 724 信息欄 725 第12章 哺乳動物細胞中DNA甲基化分析 729 導言 730 方案1 DNA亞硫酸氫鹽測序法檢測單個...
通過亞硫酸氫鹽修飾PCR測序分析,我們首次發現表達沉默的NPR1基因啟動子區存在CpG島並在胃癌細胞中存在甲基化畸變。本項目即在此研究基礎上,採用啟動子螢光素酶報告分析、去甲基化藥物處理和免疫沉降的方法,分析NPR1基因表達沉默的表觀遺傳...
通過Bisulfite-seq、CHIP-seq和miRNA、轉錄組測序和生物信息學分析,研究了性腺細胞重編程過程中的DNA甲基化、組蛋白修飾和miRNA調控表觀遺傳修飾在其中發揮的作用,並通過亞硫酸氫鹽測序、qPCR以及基因敲除技術進一步驗證。
Sodium Bisulphite 亞硫酸氫鈉 ; 亞硫酸氫鈉亞硫酸氫鈉 ; 硫酸鈉 ; 重亞硫酸鈉 Bisulphite Sequencing 重亞硫酸鹽測序法 Potassium Bisulphite 亞硫酸氫鉀 bisulphite e 亞硫酸氫鹽 ammonium bisulphite 亞硫酸氫銨 bisulphite leaching 亞...
為證實此假設,本項目擬採用螢光定量PCR、Western blot、免疫組化、亞硫酸氫鹽基因組測序、染色質免疫共沉澱、慢病毒載體和裸鼠成瘤等技術方法分析C12orf59基因在腎透明細胞癌中的表達及其與臨床病理特徵的相關性、研究其表達缺失或下調的...
第二步執行備選方案,在家系樣本中進行遺傳性甲基化篩選:對一個珍貴大家系的5例樣本及10例病人(含不同階段共34例癌變樣本)進行簡化的表觀亞硫酸氫鹽測序 (Reduced Representation Bisulfite Sequencing, RRBS),得到全基因組甲基化圖譜...
但機制未明。本項目擬用螢光素酶分析,電泳移動實驗,亞硫酸氫鹽修飾基因組測序法等技術在轉錄水平研究其上調的分子機制。為進一步研究其刺激分子和信號傳導途徑,了解腫瘤免疫的機理,指導HLA-1類下調腫瘤免疫治療奠定基礎。
本課題擬在前期研究基礎上,採用RT-PCR、Western blot、免疫組化、亞硫酸氫鹽基因組測序、染色質免疫共沉澱、慢病毒載體、串聯親和純化質譜和裸鼠模型等技術方法分析C8orf84在膀胱癌中的表達及其與患者病情的相關性,分析其表達缺失或下調...
Shuai等通過亞硫酸氫鹽測序發現,AG-haESCs都含有父源印記,但這種印記不穩定。在體外(in vivo)培養過程中逐漸朝向正常受精來源的ESCs轉化,同時,母源印記開始表達。另外,在傳代過程中,一些AG-haESCs中的印記基因,如H19,會丟失...
亞硫酸氫鹽測序(bisulfite sequencing)表明TYLCCNV基因組DNA在TYLCCNV單獨侵染的本氏煙中能夠發生甲基化,且甲基化主要集中於病毒啟動子區,包括基因間隔區(含有病毒複製起點和雙向轉錄啟動子)、AV2區(含有AV1/CP啟動子)以及AC2/AC3的...
本項研究工作擬採用圍產期給予PCP處理的大鼠精神分裂症動物模型,趨同功能基因組學最佳化的精神分裂症相關基因作為候選基因,在大鼠的不同腦區通過亞硫酸氫鹽修飾後測序法定性和MSP方法定量檢測候選基因的DNA甲基化的變化,半定量RT-PCR和Real...
通過亞硫酸氫鹽測序技術證明,CLCuMuV致病複合體和上述病毒蛋白都以不同的程度抑制植物外源基因的啟動子區域(35S啟動子)及內源轉座子(NbTnt1)的甲基化。 通過串聯親和純化和質譜連用以及體內和體外實驗鑑定CLCuMuV C4蛋白與植物甲基...
通過建立ART C57BL/6J 小鼠模型,獲得IVM/ICSI 成熟卵母細胞,新生、性成熟老年IVF、ICSI、IVM 和體內受精小鼠,套用Real-Time PCR、Western-blot、螢光免疫細胞化學、亞硫酸氫鹽測序PCR(BSP)及pyrosequencing 等技術, 進行ART 小鼠...
進一步用亞硫酸氫鹽測序擴增子(BSAS)法對上述基因的13個甲基化差異位點和PDX1的3個甲基化差異位點進行驗證分析。兩種方法得到的數據作相關分析,皮爾森相關係數為0.852,說明用BSAS方法驗證得到的CpG位點甲基化水平與晶片結果基本相符。
基於晶片結果,我們試驗性的挑選10個共含有27個陽性CpG位點的候選序列,採用亞硫酸氫鹽處理後測序(BSP)進行驗證。選擇條件為:1、多個母胎甲基化差異CpG位點位於一段短DNA片段中;2、目的片段有兩個以上的甲基化敏感性內切酶(MRSE)Hin...
採用亞硫酸氫鹽修飾後測序測定兩組下丘腦中CRHR1啟動子區域甲基化狀況;採用染色質免疫沉澱技術檢測CRHR1基因啟動子和第一外顯子上的組蛋白賴氨酸4和賴氨酸9的三甲基化水平。結果發現:(1)行為學研究顯示建立了穩定的慢性應激致大鼠...
bisulfite salt 亞硫酸氫鹽 odium bisulfite 亞硫酸氫鈉 sodium bisulfite[無化] 亞硫酸氫鈉 ; 亞硫酸氫鈉 ; 亞硫酸氫鈉化學品 ; 重亞硫酸鈉 bisulfite sequencing 亞硫酸鹽定序 ; 亞硫酸鹽測序 ; 測序法 雙語例句 In the ...
為此,本課題組擬:(1)採用RT-PCR、Western blot和免疫組化等技術,分析ECRG4基因表達及其與腎癌臨床病理特徵的相關性;(2 使用亞硫酸氫鹽基因組測序和染色質免疫共沉澱等技術分析ECRG4基因表達的表觀調控機制;(3)利用慢病毒表達...
第五節 亞硫酸氫鹽修飾後測序法分析甲基化(116)第十章 蛋白質組學及其研究方法概述(119)第一節 蛋白質組學的概念(119)第二節 蛋白質組學研究方法概述(120)第三節 蛋白質組學在疾病研究中的套用(123)第十一章 蛋白質樣品製備...
PyroMark Q24包括了一個完整軟體包,用於分析CpG位點甲基化,以及用於確認亞硫酸氫鹽處理徹底與否的內置的對照。 定量分析單個CpG位點 分析單個CpG位點對於研究各種腫瘤基因的異常表達是非常重要的。由於傳統方法獲得的數據解析度低,通常靈敏...