《蛋白質翻譯後修飾的生物信息學研究》是依託華中科技大學,由薛宇擔任項目負責人的青年科學基金項目。
基本介紹
- 中文名:蛋白質翻譯後修飾的生物信息學研究
- 項目類別:青年科學基金項目
- 項目負責人:薛宇
- 依託單位:華中科技大學
- 批准號:30700138
- 申請代碼:C0505
- 負責人職稱:教授
- 研究期限:2008-01-01 至 2010-12-31
- 支持經費:17(萬元)
《蛋白質翻譯後修飾的生物信息學研究》是依託華中科技大學,由薛宇擔任項目負責人的青年科學基金項目。
《蛋白質翻譯後修飾的生物信息學研究》是依託華中科技大學,由薛宇擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要蛋白質的翻譯後修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質與底物蛋白質上特定的胺基酸結合,調控著底物的酶活性、功能以及三級結...
很多mRNA表達產生的蛋白質要經歷翻譯後修飾如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻譯後修飾是蛋白質調節功能的重要方式,因此對蛋白質翻譯後修飾的研究對闡明蛋白質的功能具有重要作用。蛋白質功能確定 如分析酶活性和確定酶底物,細胞因子的生物分析/配基-受體結合分析。可以利用基因敲除和反義技術分析基因表達產物-蛋白質的...
《nsSNPs影響植物蛋白質磷酸化修飾的生物信息學研究》是依託鄭州大學,由程涵擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質磷酸化是重要的翻譯後修飾之一,在植物的生長發育過程中發揮關鍵作用,幾乎參與所有生物學過程。非同義單核苷酸多態性(Non-synonymous single nucleotide polymorphisms, nsSNPs)可改變蛋白質磷酸...
《泛素化特異性及其調控細胞自噬的生物信息學研究》是依託華中科技大學,由劉澤先擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 作為最重要的蛋白質翻譯後修飾之一,泛素化主要通過介導底物的降解來調控細胞內的生命活動。泛素化和去泛素化的特異性分別由泛素連線酶 (E3) 和去泛素化酶 (DUB) 決定。研究泛素化調控的...
蛋白質組(Proteome)一詞,源於蛋白質(protein)與 基因組(genome)兩個詞的組合,意指“一種基因組所表達的全套蛋白質”,即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特徵,包括蛋白質的表達水平,翻譯後的修飾,蛋白與蛋白相互作用等,由此獲得蛋白質...
《組蛋白翻譯後修飾及其結合蛋白系統鑑定新方法的研究》是依託天津醫科大學,由張鍇擔任項目負責人的面上項目。中文摘要 組蛋白通過翻譯後修飾及其結合蛋白改變了與DNA的纏繞狀態,參與了DNA複製、修復和轉錄等重要的生物過程,對細胞分化、組織發育具有極為重要的影響,與癌症的發生、發展密切聯繫,具有腫瘤標誌物和藥物...
《基於質譜數據的非限制性翻譯後修飾檢測算法研究》是依託中國科學院數學與系統科學研究院,由付岩擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 蛋白質翻譯後修飾(PTM)能夠改變蛋白質的結構,調控蛋白質的活性。研究 PTM 對於闡明蛋白質的功能,解釋疾病的發生機理等,都具有十分重要的意義。基於質譜技術的蛋白質組學...
蛋白質磷酸化是蛋白質組學研究中的重要內容,本項目研究融合蛋白質結構、功能域組成、相互作用等多種信息識別激酶特異的磷酸化位點。蛋白質磷酸化是蛋白質翻譯後修飾的一種,它參與細胞中眾多的生命活動過程,對調控蛋白質的生物活性起著至關重要的作用。蛋白質磷酸化位點預測是生物信息學研究中的熱點問題,從1999年第...
大量臨床研究證明,Tau蛋白翻譯後的異常修飾是引起阿爾茨海默病發生髮展的主要原因之一。針對阿爾茨海默病及Tau蛋白翻譯後修飾的研究現狀,本項目擬採用信息熵最佳化窗函式,構建Tau蛋白翻譯後修飾的位點序列數據集,融合Tau蛋白的結構進化信息、序列信息和胺基酸物化性質提取序列特徵,並運用Wrapper算法對特徵最佳化選擇,設計一...
《胺基酸突變對賴氨酸翻譯後修飾影響的生物信息學研究》是依託南昌大學,由施紹萍擔任項目負責人的青年科學基金項目。項目摘要 針對重大疾病相關胺基酸突變與賴氨酸翻譯後修飾的內在關聯及研究現狀,本項目擬基於生物分析中的進化保守信息,開發一種新的簡潔高效的預測分析方法蛋白翻譯後修飾肽段富集方法PSEA,構建賴氨酸...
我們已證明了核受體PXR是SUMO化翻譯後修飾的靶蛋白,但是,PXR蛋白內SUMO的修飾位點,及PXR對靶基因的轉錄調控機制受SUMO化翻譯後修飾的影響尚不清楚。本項目進行了鑑別PXR蛋白中重要的SUMO化胺基酸位點,及SUMO化翻譯後修飾對PXR轉錄調控機制的影響等內容的研究。結果顯示:根據生物信息學軟體預測和構建相應突變體考察其...
第五章 真核生物基因組的注釋 第一節 蛋白質編碼基因的注釋 第二節 RNA基因的注釋 第三節 重複序列的注釋 第四節 假基因的注釋 第五節 案例分析:黃瓜基因組的注釋 思考題 參考文獻 第六章 蛋白質組學 第一節 蛋白質組學概述 第二節 蛋白質的大規模分離鑑定技術 第三節 蛋白質的翻譯後修飾 第四節 ...
蛋白質磷酸化是最重要、研究最廣泛的翻譯後修飾之一,在各種生物學過程和通路中發揮著不可替代的作用,並可逆的決定了細胞的動力學和可塑性。上游激酶可識別並修飾特定的絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸殘基,而修飾位點能夠被上游磷酸酶識別並去磷酸化,磷酸化位點也可以通過形成對接位點從而介導蛋白質-蛋白質相互作用。傳統的...
葉明亮 研究員 博士生導師 中科院大連化學物理研究所 生物技術部 1996年畢業於安徽師範大學,獲理學學士學位。以色譜分離與質譜分析為立足點,針對蛋白質組等複雜生物樣品的高效分離與高靈敏檢測,開展蛋白質組分離分析新技術和新方法的研究,注重分析化學與生物學、數學、生物信息學等學科的交叉。在蛋白質翻譯後修飾的...
研究方向:分子細胞生物學 研究方向描述: 主要利用生物化學,分子生物學,表觀遺傳學,細胞生物學,生物信息學等多學科生物實驗手段,研究集中在(1)泛素化酶和去泛素化酶及其調控網路,主攻癌症和免疫性疾病的病理基礎,為臨床開發藥物提供新靶標。(2)蛋白質翻譯後β-羥基丁醯化修飾,尋找其催化酶、去除酶、...
6.2.1 蛋白質組學發展歷史 6.2.2 蛋白質組學研究內容 6.3 蛋白質組學實驗技術 6.3.1 蛋白質分離技術 6.3.2 蛋白質鑑定與定量技術 6.4 質譜數據分析 6.4.1 質譜數據的特點 6.4.2 蛋白質鑑定 6.4.3 蛋白質定量 6.4.4 翻譯後修飾 6.5 蛋白質組學研究展望 參考文獻 第7章 生物分子網路研究...
蛋白質磷酸化修飾是最常見、最重要的的一種蛋白質翻譯後修飾方式,磷酸化蛋白質的大規模化分析和位點鑑定更是磷酸化蛋白質組研究面臨的巨大挑戰。儘管近年在磷酸化肽段的富集、磷酸化位點的鑑定和相關生物信息學方面有明顯進展,但仍需要更加特異有效的分離方法和更加高靈敏度、更高通量的鑑定方法,從而實現從少量生物...
蛋白質賴氨酸的乙醯化是一種重要的翻譯後修飾(PTM),在細胞生命活動中發揮舉足輕重的作用,並參與著包括腫瘤在內的多種病理過程。發展理論預測乙醯化位點的方法,是乙醯化研究的迫切需要和當前生物信息學的前沿熱點課題,具有重要的生物學意義。本課題旨在開發一種嶄新的乙醯化位點預測方法,其突出特點是:(1)預...
6.2.1 蛋白質組學發展歷史 6.2.2 蛋白質組學研究內容 6.3 蛋白質組學實驗技術 6.3.1 蛋白質分離技術 6.3.2 蛋白質鑑定與定量技術 6.4 質譜數據分析 6.4.1 質譜數據的特點 6.4.2 蛋白質鑑定 6.4.3 蛋白質定量 6.4.4 翻譯後修飾 6.5 蛋白質組學研究展望 參考文獻 第7章 生物分子網路研究...
蛋白質翻譯後修飾在生命體中具有十分重要的作用,它使蛋白質的功能更為完善,調節更為精細。本研究運用一種特異性磷酸化蛋白染色的磷酸化蛋白分析技術,對磷酸化蛋白的動態變化進行了比較分析。同時利用建立的兩種富集糖蛋白的方法(即生物素醯肼富集糖蛋白與生物素/親合素富集糖蛋白),對肝切除後72小時後及其假手術...
被引用100篇文獻以上的期刊有91種,其中經常被引用的前20種期刊(表)被引用次數皆在1000次以上,合計貢獻文獻48314篇,占總被引用文獻數的52.04%,說明這些期刊是發表蛋白質序列相關信息的主要文獻源。特點 可提供蛋白質序列的詳盡注釋信息序列注釋包括蛋白質功能、蛋白質翻譯後修飾、結構域和結合位點、二級結構、四級...
2012.8-2022.7 北京大學基礎醫學院醫學信息學系 副教授 2022.8-2024.1 北京大學基礎醫學院醫學信息學系 研究員、長聘副教授 博士生導師 2024.2 - 至今 博雅特聘教授、長聘正教授 研究方向 (1) 生物信息學 (2) 生物大分子相分離與相變 (3) 蛋白質翻譯後修飾 社會任職 中國人工智慧學會生物信...
研究方向 腫瘤生物信息學:包括腫瘤基因組測序分析;腫瘤相關分子標記物的篩選;腫瘤病因、亞類、療效、預後等分類預測;腫瘤調控網路研究等。蛋白質組學生物信息學: 包括蛋白質翻譯後修飾的功能研究;蛋白質功能注釋及信號傳遞網路分析;蛋白質基因組學等。工作方向包括多組學數據分析及整合、腫瘤免疫治療、臨床預後預警...
現任復旦大學生命科學院教授,生物醫學研究院高級PI,遺傳工程國家重點實驗室PI,國家蛋白質重大研究計畫首席科學家。進行代謝與疾病,蛋白質翻譯後修飾與蛋白組學等研究工作。主要研究方向 用生物化學、分子生物學、蛋白組學和生物信息學等手段, 研究代謝調控機理及代謝失調與人類疾病發生的關係。重點研究:1.代謝酶乙醯化...
所發布的GPS系列工具在蛋白質翻譯後修飾領域受到廣泛關注,推動了該領域發展,相關文章已被包括Nature、Science及Cell系列雜誌在內的文章引用700餘次,最高單篇引用超200次,H-index 12。擔任國際雜誌Frontiers in Genetics編委。主持國家自然科學基金3項,作為骨幹參與科技部973/863/國際合作項目4項。發布生物信息學工具...
《糖基化信號途徑中OGA的雙催化功能及調節機制》是依託南開大學,由李靜擔任項目負責人的青年科學基金項目。中文摘要 乙醯葡萄糖胺(O-GlcNAc)修飾是最新發現的一種蛋白質翻譯後修飾,與Ⅱ型糖尿病、腫瘤等多種疾病的發病機理相關。乙醯葡萄糖胺酶(O-GlcNAcase,OGA)是唯一水解蛋白O-GlcNAc的己糖胺酶。最近研究...
利用液質聯用技術鑑定人尿蛋白質組。在嚴格的質量控制下,鑑定的蛋白總數在當時世界領先。最先建立了人尿糖蛋白質組的研究方法,建立了人尿糖蛋白質組資料庫,解決了白蛋白的高豐度抑制問題,提出了可以將翻譯後修飾的富集方法套用於高豐度蛋白的去除。由於在尿蛋白質組領域的貢獻,獲邀參加編寫Wiley-VCH出版的《Renal...
二、生物質譜技術 三、蛋白質晶片技術 四、蛋白質印跡法 第二節 蛋白質問相互作用的研究技術 一、酵母雙雜交技術 二、免疫共沉澱技術 第三節 蛋白質組學的生物信息學分析 一、蛋白質定性鑑定 二、蛋白質翻譯後修飾分析 第九章 感染性疾病的分子診斷 第一節 感染性疾病的分子...
開展蛋白質組和翻譯後修飾研究,開展腫瘤血管生成的動態蛋白質組學研究;在國際上提出並倡導腫瘤預測預防個體化醫學的多參數系統策略觀,腫瘤多組學是解決腫瘤複雜問題的根本途徑,提出並系統論述了以表型組為重心的腫瘤多組學策略和技術方案;倡導和推行腫瘤預測預防個體化醫學(PPPM)和精準醫學(PM)的研究和實踐。
《乙醯轉移酶、去乙醯化酶特異的賴氨酸乙醯化位點識別》是李婷婷為項目負責人,北京大學為依託單位的面上項目。科研成果 項目摘要 蛋白質賴氨酸殘基乙醯化是一種普遍存在的可逆性翻譯後修飾, 乙醯轉移酶和去乙醯化酶共同作用使其處於動態平衡, 在基因表達等生物過程中發揮著重要作用。乙醯化位點預測是生物信息學...