《蛋白質模擬的多尺度方法》是2014年2月1日科學出版社出版的圖書,作者是Andrzej Kolinski,譯者是王存新。
基本介紹
- 中文名:蛋白質模擬的多尺度方法
- 作者:Andrzej Kolinski
- 譯者:王存新
- ISBN:9787030396495
- 頁數:304
- 定價:118.00
- 出版社:科學出版社
- 出版時間:2014-02
- 裝幀:平裝
- 開本:16
- 叢書名:新生物學叢書
《蛋白質模擬的多尺度方法》是2014年2月1日科學出版社出版的圖書,作者是Andrzej Kolinski,譯者是王存新。
《蛋白質模擬的多尺度方法》是2014年2月1日科學出版社出版的圖書,作者是Andrzej Kolinski,譯者是王存新。內容簡介《蛋白質模擬的多尺度方法》涉及蛋白質分子模擬領域內最新的綜述和通用方法,學術思想新穎,內容...
蛋白質分子主要通過多個尺度的相互作用和構象漲落行使功能。常規分子模擬方法在刻畫蛋白質功能運動時通常會面臨精度/效率瓶頸。本項目中,我們將建立耦合蛋白質分子粗粒化模型與全原子模型的多尺度理論和計算方法。一方面通過多尺度方法將粗粒...
蛋白質模擬的多尺度方法/新生物學叢書 蛋白質模擬的多尺度方法/新生物學叢書
本項目將發展描述柔性連結多域蛋白的多尺度模型,並對典型柔性連結多域蛋白(包括鈣調蛋白和鋅指蛋白轉錄因子)識別下游靶蛋白/DNA時的別構動力學進行分子模擬,揭示柔性連結多域蛋白別構信號在域間傳播的一般規則,進而探討域間協同性產生...
蛋白質分子模擬是利用物理數學的方法和原理,以計算機為工具,模擬蛋白質、藥物等物質分子中原子、分子的結構及相關性質;並按照一定的規律,改造天然分子,設計自然界不存在的全新分子。表示方式 用不同形式表示原子、殘基、主鏈、二級結構...
在發展高層次的蛋白質AIMD方法的同時,發展建立於分塊量子計算的新穎的極化和可極化生物分子力場,及動態的DPPC和漲落電荷的EPB方法,並套用於蛋白質相互作用體系的分子模擬計算研究。 通過發展AIMD,DPPC和EPB的方法和套用,建立一個多層次...
針對此關鍵問題,本項目以建立HCIC置換劑的多尺度分子設計方法為目標,利用分子對接、分子動力學模擬、微觀檢測和巨觀色譜實驗等方法開展系統研究,在分子尺度上展示置換劑-配基-蛋白質之間相互作用的分子機理,探索置換劑設計的關鍵因素及其...
以單分子光譜實時檢測技術和共聚焦雷射掃描顯微鏡為研究平台,結合靜態吸附和動態色譜吸附等常規實驗手段,實現離子交換色譜介質中蛋白質吸附行為的多尺度理論和實驗研究。研究蛋白質與離子交換配基之間以及蛋白質分子之間的靜電相互作用與吸附...
因此流體剪下力對蛋白質結構影響的作用機制是涉及眾多生物化工和生物醫藥工程的共性和基礎科學問題,其核心和難點在於描述流體剪下力對蛋白質構象產生影響的時空特性。本申請擬發展流體力學與多尺度分子模擬相結合的方法來模擬剪下力場中蛋白質...
蛋白質在納米材料表面形成的蛋白質冠,對生物感測和生物檢測等新技術的套用開發起重要作用。本研究採用多尺度分子模擬方法研究智慧型回響性對蛋白質與納米材料形成的蛋白質冠的功能調控,探討了pH、離子強度等外部條件對納米粒子與蛋白質的自...
本項目就是研究如何利用計算手段模擬蛋白質對接過程中柔性區域的相互作用。 蛋白質複合物界面一般都會存在著一定量的水分子。將受體柔性納入含水對接過程中,考慮界面水分子和受體柔性同時作用於蛋白質配體對接過程,提出了基於RosettaLigand的...
以蛋白質色譜的科學發展和技術創新為目標,以多尺度界面分子行為的科學研究為主線,運用多維實驗檢測、量子化學/分子力學分析、分子對接和多尺度分子動力學模擬方法,進行系統的理論和實驗研究。內容包括:在分子-分子界面解析蛋白質-親和配基...
至今,這種在分子動力學模擬中存在的長時間尺度問題仍然沒有得到解決。.本項目將抓住ATP驅動蛋白質分子構象變化動力學的根本特徵,對蛋白質分子進行新的多尺度建模,從而既可以在微觀原子尺度上研究ATP與蛋白質相互作用,又能把微觀信息...
針對跨膜蛋白的結構特徵,結合課題組前期的研究基礎,建立適合於跨膜蛋白的分子對接計算方法。綜合粗粒化彈性網路模型和分子動力學對跨膜蛋白的變構和轉運過程進行多尺度模擬。通過平衡態和拉伸分子動力學模擬,進一步探討跨膜蛋白與底物相互...
我們在前期研究中建立了胺基酸序列設計方法,並進行了實驗驗證。本項目將在對全自動序列設計進一步完善的基礎上,採用鏈生長抽樣、多尺度模型等技術,發展能設計蛋白質主鏈摺疊的模擬技術;以天然蛋白質結構數據為依據,基於貝葉斯理論建立”可...
我們的研究還可能對如何模擬一般的對超大生物分子體系動力學提供借鑑意義。結題摘要 雖然蛋白質資料庫收集了越來越多的高精度、多狀態下的膜蛋白結構,目前人們還是無法在原子尺度上直接觀察磷脂-膜蛋白複合體的結構及其動力學,這就使得...
該項目主要採用多尺度分子模擬方法,即把粗粒化和全原子分子動力學模擬相結合,同時採用抽樣效率高的副本交換分子動力學方法,研究多肽濃度、溶液pH值、溶劑效應、及其胺基酸序列對芳香環多肽、表面活性劑多肽、和澱粉樣多肽三種不同多肽的...
同時,利用多尺度分子動力學模擬研究蛋白質在靜電排斥表面的構象轉換和自相互作用,闡釋靜電排斥表面調控蛋白質復性的分子機理;在此基礎上,設計合成新型結構的荷電粒子,研究荷電錶面結構對蛋白質復性的影響,最佳化荷電介質性能參數;最後...
本項目利用理論推導,量子化學計算和分子動力學模擬,圍繞蛋白質大分子與納米材料之間的物理吸附和電子轉移反應開展研究。首先發展了一套綜合各種技術手段進行多尺度模擬的方法。在此方法上,研究發現,石墨烯和碳納米管與細胞色素C的吸附中...
首先綜合運用多維檢測技術和分子模擬方法研究蛋白質、分離材料和溶劑間的相互作用,揭示不同尺度和結構層次上分子相互作用的特性和蛋白質結構變化規律;然後基於巨觀色譜和復性實驗、多尺度分析檢測以及分子模擬結果,建立多組分吸附熱力學、傳質...
《比較蛋白質組學和生物信息學》《蛋白質模擬的通用方法》《蛋白質模型的多尺度測量方法》《幹細胞的細胞生物學》《植物轉基因技術》《合成生物學:原理、方法和套用》《延續生命——人類健康與生物多樣性》《大腦的未來》《植物轉化技術...