蛋白質分子模擬

利用物理數學的方法和原理，以計算機為工具，模擬蛋白質、藥物等物質分子中原子、分子的結構及相關性質；並按照一定的規律，改造天然分子，設計自然界不存在的全新分子。

分子圖形的表示方式

用不同形式表示原子、殘基、主鏈、二級結構、結構域等不同層次的結構，是蛋白質分子圖形顯示的特點。

原子和原子鍵的表示方式：

基本介紹

• 中文名：蛋白質分子模擬
• 方法：物理學方法
• 技術：計算機
• 學科：生物學

概念

利用物理數學的方法和原理，以計算機為工具，模擬蛋白質、藥物等物質分子中原子、分子的結構及相關性質；並按照一定的規律，改造天然分子，設計自然界不存在的全新分子。

分子圖形的表示方式

用不同形式表示原子、殘基、主鏈、二級結構、結構域等不同層次的結構，是蛋白質分子圖形顯示的特點。

原子和原子鍵的表示方式：

骨架式

棍球式

填充式

…….

含有較多亞基的蛋白質分子，有時很難分清各個亞基之間的界限。將亞基簡化為橢球體，則可以清楚的顯示各個亞基的大小、位置和相互關係。

理論基礎

X射線衍射晶體學

核磁共振波譜學

電勢能研究

分子動力學

主要套用

蛋白質結構預測

蛋白質和多肽分子的結構預測，蛋白質分子與抑制劑等複合物的分子對接是分子模擬的一個重要方面。

分子間相互作用

蛋白質與其他分子之間的相互作用是生命過程中的重要組成部分。研究分子間的相互作用，是探索生命現象的重要途徑。

藥物設計加快了新藥的開發過程。